RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.43■■■■□ 3.42
SOHLH1-201ENST00000298466 GOLGA3Q08378 1498 aa36.38■■■■□ 3.41
SOHLH1-201ENST00000298466 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
SOHLH1-201ENST00000298466 JPH4Q96JJ6 628 aa36.38■■■■□ 3.41
SOHLH1-201ENST00000298466 IQGAP2Q13576 1575 aa36.29■■■■□ 3.4
SOHLH1-201ENST00000298466 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.29■■■■□ 3.4
SOHLH1-201ENST00000298466 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.26■■■■□ 3.4
SOHLH1-201ENST00000298466 SHROOM2Q13796 1616 aa36.24■■■■□ 3.39
SOHLH1-201ENST00000298466 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
SOHLH1-201ENST00000298466 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
SOHLH1-201ENST00000298466 ARHGEF11O15085 1522 aa36.22■■■■□ 3.39
SOHLH1-201ENST00000298466 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.21■■■■□ 3.39
SOHLH1-201ENST00000298466 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
SOHLH1-201ENST00000298466 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
SOHLH1-201ENST00000298466 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
SOHLH1-201ENST00000298466 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.11■■■■□ 3.37
SOHLH1-201ENST00000298466 DISP1Q96F81 1524 aa36.07■■■■□ 3.36
SOHLH1-201ENST00000298466 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.04■■■■□ 3.36
SOHLH1-201ENST00000298466 P3H3Q8IVL6 736 aa36.03■■■■□ 3.36
SOHLH1-201ENST00000298466 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
SOHLH1-201ENST00000298466 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.01■■■■□ 3.36
SOHLH1-201ENST00000298466 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.99■■■■□ 3.35
SOHLH1-201ENST00000298466 ARAP1Q96P48 1450 aa35.99■■■■□ 3.35
SOHLH1-201ENST00000298466 KIAA0556O60303 1618 aa35.95■■■■□ 3.35
SOHLH1-201ENST00000298466 SAMD9Q5K651 1589 aa35.88■■■■□ 3.33
SOHLH1-201ENST00000298466 PTPRGP23470 1445 aa35.85■■■■□ 3.33
SOHLH1-201ENST00000298466 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.83■■■■□ 3.33
SOHLH1-201ENST00000298466 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.82■■■■□ 3.33
SOHLH1-201ENST00000298466 CLIP1P30622 1438 aa35.79■■■■□ 3.32
SOHLH1-201ENST00000298466 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.78■■■■□ 3.32
SOHLH1-201ENST00000298466 CEP162Q5TB80 1403 aa35.78■■■■□ 3.32
SOHLH1-201ENST00000298466 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.65■■■■□ 3.3
SOHLH1-201ENST00000298466 UACAQ9BZF9 1416 aa35.6■■■■□ 3.29
SOHLH1-201ENST00000298466 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.55■■■■□ 3.28
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCA8O94911 1581 aa35.52■■■■□ 3.28
SOHLH1-201ENST00000298466 FMN1Q68DA7 1419 aa35.51■■■■□ 3.28
SOHLH1-201ENST00000298466 ARID3CA6NKF2 412 aa35.51■■■■□ 3.27
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCC2Q92887 1545 aa35.49■■■■□ 3.27
SOHLH1-201ENST00000298466 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.47■■■■□ 3.27
SOHLH1-201ENST00000298466 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SOHLH1-201ENST00000298466 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.43■■■■□ 3.26
SOHLH1-201ENST00000298466 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.4■■■■□ 3.26
SOHLH1-201ENST00000298466 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
SOHLH1-201ENST00000298466 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.34■■■■□ 3.25
SOHLH1-201ENST00000298466 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
SOHLH1-201ENST00000298466 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.31■■■■□ 3.24
SOHLH1-201ENST00000298466 ATP10BO94823 1461 aa35.31■■■■□ 3.24
SOHLH1-201ENST00000298466 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
SOHLH1-201ENST00000298466 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
SOHLH1-201ENST00000298466 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.27■■■■□ 3.24
SOHLH1-201ENST00000298466 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SOHLH1-201ENST00000298466 HECW1Q76N89 1606 aa35.23■■■■□ 3.23
SOHLH1-201ENST00000298466 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
SOHLH1-201ENST00000298466 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.22■■■■□ 3.23
SOHLH1-201ENST00000298466 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
SOHLH1-201ENST00000298466 ASXL2Q76L83 1435 aa35.18■■■■□ 3.22
SOHLH1-201ENST00000298466 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.16■■■■□ 3.22
SOHLH1-201ENST00000298466 MAPKBP1O60336 1514 aa35.15■■■■□ 3.22
SOHLH1-201ENST00000298466 KCNH8Q96L42 1107 aa35.08■■■■□ 3.21
SOHLH1-201ENST00000298466 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.06■■■■□ 3.2
SOHLH1-201ENST00000298466 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.06■■■■□ 3.2
SOHLH1-201ENST00000298466 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.06■■■■□ 3.2
SOHLH1-201ENST00000298466 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.99■■■■□ 3.19
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.98■■■■□ 3.19
SOHLH1-201ENST00000298466 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.95■■■■□ 3.19
SOHLH1-201ENST00000298466 DIP2BQ9P265 1576 aa34.92■■■■□ 3.18
SOHLH1-201ENST00000298466 APLP2Q06481 763 aa34.9■■■■□ 3.18
SOHLH1-201ENST00000298466 TIAM1Q13009 1591 aa34.88■■■■□ 3.17
SOHLH1-201ENST00000298466 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SOHLH1-201ENST00000298466 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SOHLH1-201ENST00000298466 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.86■■■■□ 3.17
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.85■■■■□ 3.17
SOHLH1-201ENST00000298466 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.84■■■■□ 3.17
SOHLH1-201ENST00000298466 MAP3K1Q13233 1512 aa34.8■■■■□ 3.16
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF14Q15058 1648 aa34.79■■■■□ 3.16
SOHLH1-201ENST00000298466 GLI2P10070 1586 aa34.77■■■■□ 3.16
SOHLH1-201ENST00000298466 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.77■■■■□ 3.16
SOHLH1-201ENST00000298466 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.74■■■■□ 3.15
SOHLH1-201ENST00000298466 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
SOHLH1-201ENST00000298466 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.71■■■■□ 3.15
SOHLH1-201ENST00000298466 CD109Q6YHK3 1445 aa34.71■■■■□ 3.15
SOHLH1-201ENST00000298466 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.7■■■■□ 3.15
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.7■■■■□ 3.14
SOHLH1-201ENST00000298466 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.67■■■■□ 3.14
SOHLH1-201ENST00000298466 TSPOAP1O95153 1857 aa34.65■■■■□ 3.14
SOHLH1-201ENST00000298466 NCOA2Q15596 1464 aa34.59■■■■□ 3.13
SOHLH1-201ENST00000298466 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
SOHLH1-201ENST00000298466 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
SOHLH1-201ENST00000298466 PLCH2O75038 1416 aa34.54■■■■□ 3.12
SOHLH1-201ENST00000298466 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.53■■■■□ 3.12
SOHLH1-201ENST00000298466 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
SOHLH1-201ENST00000298466 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.47■■■■□ 3.11
SOHLH1-201ENST00000298466 FANCAO15360 1455 aa34.45■■■■□ 3.11
SOHLH1-201ENST00000298466 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.45■■■■□ 3.11
SOHLH1-201ENST00000298466 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.45■■■■□ 3.11
SOHLH1-201ENST00000298466 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.45■■■■□ 3.1
SOHLH1-201ENST00000298466 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.44■■■■□ 3.1
SOHLH1-201ENST00000298466 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms