RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.94■■■□□ 2.54
PTX4-201ENST00000293922 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
PTX4-201ENST00000293922 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.87■■■□□ 2.53
PTX4-201ENST00000293922 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTX4-201ENST00000293922 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.78■■■□□ 2.52
PTX4-201ENST00000293922 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.7■■■□□ 2.51
PTX4-201ENST00000293922 IQGAP2Q13576 1575 aa30.63■■■□□ 2.49
PTX4-201ENST00000293922 PRXQ9BXM0 1461 aa30.54■■■□□ 2.48
PTX4-201ENST00000293922 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.53■■■□□ 2.48
PTX4-201ENST00000293922 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.49■■■□□ 2.47
PTX4-201ENST00000293922 PTPRGP23470 1445 aa30.49■■■□□ 2.47
PTX4-201ENST00000293922 DISP1Q96F81 1524 aa30.48■■■□□ 2.47
PTX4-201ENST00000293922 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.47■■■□□ 2.47
PTX4-201ENST00000293922 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.47■■■□□ 2.47
PTX4-201ENST00000293922 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
PTX4-201ENST00000293922 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.4■■■□□ 2.46
PTX4-201ENST00000293922 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PTX4-201ENST00000293922 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.38■■■□□ 2.45
PTX4-201ENST00000293922 MAPKBP1O60336 1514 aa30.36■■■□□ 2.45
PTX4-201ENST00000293922 EEA1Q15075 1411 aa30.35■■■□□ 2.45
PTX4-201ENST00000293922 KIAA0556O60303 1618 aa30.35■■■□□ 2.45
PTX4-201ENST00000293922 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.29■■■□□ 2.44
PTX4-201ENST00000293922 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.29■■■□□ 2.44
PTX4-201ENST00000293922 UACAQ9BZF9 1416 aa30.28■■■□□ 2.44
PTX4-201ENST00000293922 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.27■■■□□ 2.44
PTX4-201ENST00000293922 ABCC2Q92887 1545 aa30.27■■■□□ 2.44
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA3Q08378 1498 aa30.23■■■□□ 2.43
PTX4-201ENST00000293922 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.22■■■□□ 2.43
PTX4-201ENST00000293922 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PTX4-201ENST00000293922 DIP2BQ9P265 1576 aa30.21■■■□□ 2.43
PTX4-201ENST00000293922 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.14■■■□□ 2.42
PTX4-201ENST00000293922 ASXL2Q76L83 1435 aa30.12■■■□□ 2.41
PTX4-201ENST00000293922 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.11■■■□□ 2.41
PTX4-201ENST00000293922 KIF21BO75037 1637 aa30.07■■■□□ 2.4
PTX4-201ENST00000293922 ABCA8O94911 1581 aa30.05■■■□□ 2.4
PTX4-201ENST00000293922 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PTX4-201ENST00000293922 SAMD9Q5K651 1589 aa30.04■■■□□ 2.4
PTX4-201ENST00000293922 P3H3Q8IVL6 736 aa30.03■■■□□ 2.4
PTX4-201ENST00000293922 GLI2P10070 1586 aa29.96■■■□□ 2.39
PTX4-201ENST00000293922 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
PTX4-201ENST00000293922 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PTX4-201ENST00000293922 TSPOAP1O95153 1857 aa29.91■■■□□ 2.38
PTX4-201ENST00000293922 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.9■■■□□ 2.38
PTX4-201ENST00000293922 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.86■■■□□ 2.37
PTX4-201ENST00000293922 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.86■■■□□ 2.37
PTX4-201ENST00000293922 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PTX4-201ENST00000293922 ATP10BO94823 1461 aa29.82■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.81■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.81■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 ARID3CA6NKF2 412 aa29.79■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 KDM6BO15054 1643 aa29.79■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.79■■■□□ 2.36
PTX4-201ENST00000293922 KCNH8Q96L42 1107 aa29.73■■■□□ 2.35
PTX4-201ENST00000293922 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PTX4-201ENST00000293922 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.68■■■□□ 2.34
PTX4-201ENST00000293922 CD109Q6YHK3 1445 aa29.66■■■□□ 2.34
PTX4-201ENST00000293922 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.65■■■□□ 2.34
PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.65■■■□□ 2.34
PTX4-201ENST00000293922 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
PTX4-201ENST00000293922 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.62■■■□□ 2.33
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
PTX4-201ENST00000293922 FMN1Q68DA7 1419 aa29.55■■■□□ 2.32
PTX4-201ENST00000293922 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.54■■■□□ 2.32
PTX4-201ENST00000293922 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.5■■■□□ 2.31
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.49■■■□□ 2.31
PTX4-201ENST00000293922 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PTX4-201ENST00000293922 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PTX4-201ENST00000293922 HECW1Q76N89 1606 aa29.44■■■□□ 2.3
PTX4-201ENST00000293922 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
PTX4-201ENST00000293922 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.38■■■□□ 2.29
PTX4-201ENST00000293922 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
PTX4-201ENST00000293922 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.35■■■□□ 2.29
PTX4-201ENST00000293922 NEO1Q92859 1461 aa29.34■■■□□ 2.29
PTX4-201ENST00000293922 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.34■■■□□ 2.29
PTX4-201ENST00000293922 CLIP1P30622 1438 aa29.33■■■□□ 2.29
PTX4-201ENST00000293922 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.31■■■□□ 2.28
PTX4-201ENST00000293922 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.29■■■□□ 2.28
PTX4-201ENST00000293922 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.28■■■□□ 2.28
PTX4-201ENST00000293922 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PTX4-201ENST00000293922 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
PTX4-201ENST00000293922 RAPGEF3O95398 923 aa29.23■■■□□ 2.27
PTX4-201ENST00000293922 FANCAO15360 1455 aa29.23■■■□□ 2.27
PTX4-201ENST00000293922 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PTX4-201ENST00000293922 ADGRL1O94910 1474 aa29.2■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.2■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 AKNAQ7Z591 1439 aa29.2■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.19■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 PLCH2O75038 1416 aa29.18■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 KIF14Q15058 1648 aa29.18■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.18■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.17■■■□□ 2.26
PTX4-201ENST00000293922 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PTX4-201ENST00000293922 CEP162Q5TB80 1403 aa29.12■■■□□ 2.25
PTX4-201ENST00000293922 RICTORQ6R327 1708 aa29.08■■■□□ 2.25
PTX4-201ENST00000293922 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.08■■■□□ 2.25
PTX4-201ENST00000293922 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.05■■■□□ 2.24
PTX4-201ENST00000293922 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.03■■■□□ 2.24
PTX4-201ENST00000293922 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29■■■□□ 2.23
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