RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288607.2

PSMG3-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMG3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG3-202ENST00000288607 JPH4Q96JJ6 628 aa41.34■■■■■ 4.21
PSMG3-202ENST00000288607 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
PSMG3-202ENST00000288607 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.28■■■■■ 4.2
PSMG3-202ENST00000288607 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.19■■■■■ 4.18
PSMG3-202ENST00000288607 IQGAP2Q13576 1575 aa41.05■■■■■ 4.16
PSMG3-202ENST00000288607 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
PSMG3-202ENST00000288607 PRXQ9BXM0 1461 aa40.97■■■■■ 4.15
PSMG3-202ENST00000288607 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.91■■■■■ 4.14
PSMG3-202ENST00000288607 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.87■■■■■ 4.13
PSMG3-202ENST00000288607 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.85■■■■■ 4.13
PSMG3-202ENST00000288607 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.83■■■■■ 4.13
PSMG3-202ENST00000288607 EEA1Q15075 1411 aa40.82■■■■■ 4.13
PSMG3-202ENST00000288607 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
PSMG3-202ENST00000288607 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
PSMG3-202ENST00000288607 DISP1Q96F81 1524 aa40.79■■■■■ 4.12
PSMG3-202ENST00000288607 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
PSMG3-202ENST00000288607 PTPRGP23470 1445 aa40.76■■■■■ 4.12
PSMG3-202ENST00000288607 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.76■■■■■ 4.11
PSMG3-202ENST00000288607 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.74■■■■■ 4.11
PSMG3-202ENST00000288607 KIAA0556O60303 1618 aa40.67■■■■■ 4.1
PSMG3-202ENST00000288607 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
PSMG3-202ENST00000288607 GOLGA3Q08378 1498 aa40.52■■■■■ 4.08
PSMG3-202ENST00000288607 UACAQ9BZF9 1416 aa40.48■■■■■ 4.07
PSMG3-202ENST00000288607 MAPKBP1O60336 1514 aa40.48■■■■■ 4.07
PSMG3-202ENST00000288607 KIF21BO75037 1637 aa40.47■■■■■ 4.07
PSMG3-202ENST00000288607 ABCC2Q92887 1545 aa40.43■■■■■ 4.06
PSMG3-202ENST00000288607 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.42■■■■■ 4.06
PSMG3-202ENST00000288607 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.4■■■■■ 4.06
PSMG3-202ENST00000288607 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.36■■■■■ 4.05
PSMG3-202ENST00000288607 P3H3Q8IVL6 736 aa40.35■■■■■ 4.05
PSMG3-202ENST00000288607 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.35■■■■■ 4.05
PSMG3-202ENST00000288607 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.33■■■■■ 4.05
PSMG3-202ENST00000288607 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
PSMG3-202ENST00000288607 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.31■■■■■ 4.04
PSMG3-202ENST00000288607 DIP2BQ9P265 1576 aa40.3■■■■■ 4.04
PSMG3-202ENST00000288607 SAMD9Q5K651 1589 aa40.28■■■■■ 4.04
PSMG3-202ENST00000288607 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
PSMG3-202ENST00000288607 ASXL2Q76L83 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
PSMG3-202ENST00000288607 ABCA8O94911 1581 aa40.23■■■■■ 4.03
PSMG3-202ENST00000288607 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
PSMG3-202ENST00000288607 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
PSMG3-202ENST00000288607 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.1■■■■■ 4.01
PSMG3-202ENST00000288607 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.03■■■■■ 4
PSMG3-202ENST00000288607 ARID3CA6NKF2 412 aa40.01■■■■■ 4
PSMG3-202ENST00000288607 TSPOAP1O95153 1857 aa40■■■■□ 3.99
PSMG3-202ENST00000288607 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PSMG3-202ENST00000288607 GLI2P10070 1586 aa39.97■■■■□ 3.99
PSMG3-202ENST00000288607 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.97■■■■□ 3.99
PSMG3-202ENST00000288607 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.96■■■■□ 3.99
PSMG3-202ENST00000288607 ATP10BO94823 1461 aa39.9■■■■□ 3.98
PSMG3-202ENST00000288607 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.84■■■■□ 3.97
PSMG3-202ENST00000288607 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
PSMG3-202ENST00000288607 KCNH8Q96L42 1107 aa39.83■■■■□ 3.97
PSMG3-202ENST00000288607 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
PSMG3-202ENST00000288607 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.8■■■■□ 3.96
PSMG3-202ENST00000288607 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
PSMG3-202ENST00000288607 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
PSMG3-202ENST00000288607 KDM6BO15054 1643 aa39.73■■■■□ 3.95
PSMG3-202ENST00000288607 FMN1Q68DA7 1419 aa39.66■■■■□ 3.94
PSMG3-202ENST00000288607 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.64■■■■□ 3.94
PSMG3-202ENST00000288607 CD109Q6YHK3 1445 aa39.63■■■■□ 3.94
PSMG3-202ENST00000288607 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.62■■■■□ 3.93
PSMG3-202ENST00000288607 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
PSMG3-202ENST00000288607 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
PSMG3-202ENST00000288607 HECW1Q76N89 1606 aa39.54■■■■□ 3.92
PSMG3-202ENST00000288607 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.53■■■■□ 3.92
PSMG3-202ENST00000288607 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.51■■■■□ 3.92
PSMG3-202ENST00000288607 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.51■■■■□ 3.91
PSMG3-202ENST00000288607 CLIP1P30622 1438 aa39.5■■■■□ 3.91
PSMG3-202ENST00000288607 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
PSMG3-202ENST00000288607 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
PSMG3-202ENST00000288607 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.35■■■■□ 3.89
PSMG3-202ENST00000288607 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.33■■■■□ 3.89
PSMG3-202ENST00000288607 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.31■■■■□ 3.88
PSMG3-202ENST00000288607 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.29■■■■□ 3.88
PSMG3-202ENST00000288607 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.28■■■■□ 3.88
PSMG3-202ENST00000288607 CEP162Q5TB80 1403 aa39.27■■■■□ 3.88
PSMG3-202ENST00000288607 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
PSMG3-202ENST00000288607 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.23■■■■□ 3.87
PSMG3-202ENST00000288607 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.2■■■■□ 3.87
PSMG3-202ENST00000288607 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.2■■■■□ 3.87
PSMG3-202ENST00000288607 NEO1Q92859 1461 aa39.2■■■■□ 3.87
PSMG3-202ENST00000288607 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
PSMG3-202ENST00000288607 KIF14Q15058 1648 aa39.16■■■■□ 3.86
PSMG3-202ENST00000288607 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.16■■■■□ 3.86
PSMG3-202ENST00000288607 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PSMG3-202ENST00000288607 FANCAO15360 1455 aa39.11■■■■□ 3.85
PSMG3-202ENST00000288607 RAPGEF3O95398 923 aa39.07■■■■□ 3.84
PSMG3-202ENST00000288607 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.05■■■■□ 3.84
PSMG3-202ENST00000288607 PLCH2O75038 1416 aa39.04■■■■□ 3.84
PSMG3-202ENST00000288607 AKNAQ7Z591 1439 aa39.04■■■■□ 3.84
PSMG3-202ENST00000288607 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.01■■■■□ 3.84
PSMG3-202ENST00000288607 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.99■■■■□ 3.83
PSMG3-202ENST00000288607 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.96■■■■□ 3.83
PSMG3-202ENST00000288607 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
PSMG3-202ENST00000288607 ADGRL1O94910 1474 aa38.9■■■■□ 3.82
PSMG3-202ENST00000288607 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.89■■■■□ 3.82
PSMG3-202ENST00000288607 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.89■■■■□ 3.82
PSMG3-202ENST00000288607 RICTORQ6R327 1708 aa38.89■■■■□ 3.82
PSMG3-202ENST00000288607 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms