RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272317.10

RPS27A-201, Transcript of ribosomal protein S27a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS27A, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27A-201ENST00000272317 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.11■■■□□ 2.09
RPS27A-201ENST00000272317 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.09■■■□□ 2.09
RPS27A-201ENST00000272317 SHROOM2Q13796 1616 aa28.08■■■□□ 2.09
RPS27A-201ENST00000272317 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RPS27A-201ENST00000272317 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS27A-201ENST00000272317 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.89■■■□□ 2.06
RPS27A-201ENST00000272317 PRXQ9BXM0 1461 aa27.85■■■□□ 2.05
RPS27A-201ENST00000272317 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.84■■■□□ 2.05
RPS27A-201ENST00000272317 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.83■■■□□ 2.05
RPS27A-201ENST00000272317 IQGAP2Q13576 1575 aa27.81■■■□□ 2.04
RPS27A-201ENST00000272317 PTPRGP23470 1445 aa27.8■■■□□ 2.04
RPS27A-201ENST00000272317 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
RPS27A-201ENST00000272317 EEA1Q15075 1411 aa27.77■■■□□ 2.04
RPS27A-201ENST00000272317 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.77■■■□□ 2.04
RPS27A-201ENST00000272317 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
RPS27A-201ENST00000272317 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
RPS27A-201ENST00000272317 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.7■■■□□ 2.02
RPS27A-201ENST00000272317 DISP1Q96F81 1524 aa27.69■■■□□ 2.02
RPS27A-201ENST00000272317 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.58■■■□□ 2.01
RPS27A-201ENST00000272317 GOLGA3Q08378 1498 aa27.57■■■□□ 2
RPS27A-201ENST00000272317 UACAQ9BZF9 1416 aa27.57■■■□□ 2
RPS27A-201ENST00000272317 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.53■■■□□ 2
RPS27A-201ENST00000272317 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.52■■■□□ 2
RPS27A-201ENST00000272317 KIAA0556O60303 1618 aa27.52■■■□□ 2
RPS27A-201ENST00000272317 MAPKBP1O60336 1514 aa27.51■■□□□ 1.99
RPS27A-201ENST00000272317 ABCC2Q92887 1545 aa27.5■■□□□ 1.99
RPS27A-201ENST00000272317 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.49■■□□□ 1.99
RPS27A-201ENST00000272317 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.47■■□□□ 1.99
RPS27A-201ENST00000272317 P3H3Q8IVL6 736 aa27.46■■□□□ 1.99
RPS27A-201ENST00000272317 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
RPS27A-201ENST00000272317 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.38■■□□□ 1.97
RPS27A-201ENST00000272317 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
RPS27A-201ENST00000272317 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.38■■□□□ 1.97
RPS27A-201ENST00000272317 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.37■■□□□ 1.97
RPS27A-201ENST00000272317 KIF21BO75037 1637 aa27.37■■□□□ 1.97
RPS27A-201ENST00000272317 ASXL2Q76L83 1435 aa27.36■■□□□ 1.97
RPS27A-201ENST00000272317 DIP2BQ9P265 1576 aa27.3■■□□□ 1.96
RPS27A-201ENST00000272317 ABCA8O94911 1581 aa27.28■■□□□ 1.96
RPS27A-201ENST00000272317 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.27■■□□□ 1.96
RPS27A-201ENST00000272317 SAMD9Q5K651 1589 aa27.26■■□□□ 1.95
RPS27A-201ENST00000272317 ARID3CA6NKF2 412 aa27.2■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.2■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 KCNH8Q96L42 1107 aa27.17■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 GLI2P10070 1586 aa27.17■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.16■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 ATP10BO94823 1461 aa27.15■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.15■■□□□ 1.94
RPS27A-201ENST00000272317 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RPS27A-201ENST00000272317 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
RPS27A-201ENST00000272317 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.05■■□□□ 1.92
RPS27A-201ENST00000272317 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
RPS27A-201ENST00000272317 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.02■■□□□ 1.92
RPS27A-201ENST00000272317 CD109Q6YHK3 1445 aa27■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 FMN1Q68DA7 1419 aa26.99■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.98■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 TSPOAP1O95153 1857 aa26.98■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.95■■□□□ 1.91
RPS27A-201ENST00000272317 KDM6BO15054 1643 aa26.94■■□□□ 1.9
RPS27A-201ENST00000272317 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.91■■□□□ 1.9
RPS27A-201ENST00000272317 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RPS27A-201ENST00000272317 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RPS27A-201ENST00000272317 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RPS27A-201ENST00000272317 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS27A-201ENST00000272317 CLIP1P30622 1438 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS27A-201ENST00000272317 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.79■■□□□ 1.88
RPS27A-201ENST00000272317 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RPS27A-201ENST00000272317 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
RPS27A-201ENST00000272317 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.77■■□□□ 1.88
RPS27A-201ENST00000272317 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS27A-201ENST00000272317 HECW1Q76N89 1606 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS27A-201ENST00000272317 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.72■■□□□ 1.87
RPS27A-201ENST00000272317 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.69■■□□□ 1.86
RPS27A-201ENST00000272317 NEO1Q92859 1461 aa26.68■■□□□ 1.86
RPS27A-201ENST00000272317 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.861e-13■■■■□ 26.2
RPS27A-201ENST00000272317 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RPS27A-201ENST00000272317 RAPGEF3O95398 923 aa26.64■■□□□ 1.86
RPS27A-201ENST00000272317 CEP162Q5TB80 1403 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 PLCH2O75038 1416 aa26.61■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.61■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 AKNAQ7Z591 1439 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 FANCAO15360 1455 aa26.58■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.58■■□□□ 1.85
RPS27A-201ENST00000272317 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.54■■□□□ 1.84
RPS27A-201ENST00000272317 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RPS27A-201ENST00000272317 KIF14Q15058 1648 aa26.48■■□□□ 1.83
RPS27A-201ENST00000272317 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS27A-201ENST00000272317 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS27A-201ENST00000272317 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.44■■□□□ 1.82
RPS27A-201ENST00000272317 ADGRL1O94910 1474 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS27A-201ENST00000272317 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.4■■□□□ 1.82
RPS27A-201ENST00000272317 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.39■■□□□ 1.81
RPS27A-201ENST00000272317 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.37■■□□□ 1.81
RPS27A-201ENST00000272317 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms