RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.79■■■□□ 2.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.74■■■□□ 2.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQGAP2Q13576 1575 aa32.73■■■□□ 2.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JPH4Q96JJ6 628 aa32.71■■■□□ 2.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.7■■■□□ 2.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHROOM2Q13796 1616 aa32.58■■■□□ 2.81
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.56■■■□□ 2.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.54■■■□□ 2.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 P3H3Q8IVL6 736 aa32.53■■■□□ 2.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DISP1Q96F81 1524 aa32.5■■■□□ 2.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP162Q5TB80 1403 aa32.48■■■□□ 2.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLIP1P30622 1438 aa32.45■■■□□ 2.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.43■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF11O15085 1522 aa32.43■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.42■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.42■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA0556O60303 1618 aa32.41■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAMD9Q5K651 1589 aa32.41■■■□□ 2.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.38■■■□□ 2.77
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.34■■■□□ 2.77
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.34■■■□□ 2.77
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.34■■■□□ 2.77
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARAP1Q96P48 1450 aa32.29■■■□□ 2.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRGP23470 1445 aa32.26■■■□□ 2.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.21■■■□□ 2.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.12■■■□□ 2.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FMN1Q68DA7 1419 aa32.09■■■□□ 2.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UACAQ9BZF9 1416 aa32.04■■■□□ 2.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCA8O94911 1581 aa32.02■■■□□ 2.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARID3CA6NKF2 412 aa32.02■■■□□ 2.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS8Q8N3P4 1428 aa32■■■□□ 2.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.97■■■□□ 2.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC2Q92887 1545 aa31.95■■■□□ 2.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.95■■■□□ 2.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.94■■■□□ 2.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.91■■■□□ 2.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.87■■■□□ 2.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HECW1Q76N89 1606 aa31.85■■■□□ 2.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP10BO94823 1461 aa31.81■■■□□ 2.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.77■■■□□ 2.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.69■■■□□ 2.66
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APLP2Q06481 763 aa31.66■■■□□ 2.66
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASXL2Q76L83 1435 aa31.62■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIAM1Q13009 1591 aa31.61■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.6■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.58■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.56■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNH8Q96L42 1107 aa31.56■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAPKBP1O60336 1514 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K1Q13233 1512 aa31.54■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.53■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.52■■■□□ 2.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.5■■■□□ 2.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.44■■■□□ 2.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.41■■■□□ 2.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF14Q15058 1648 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.38■■■□□ 2.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.37■■■□□ 2.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIP2BQ9P265 1576 aa31.33■■■□□ 2.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCOA2Q15596 1464 aa31.31■■■□□ 2.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.28■■■□□ 2.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.23■■■□□ 2.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.23■■■□□ 2.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.21■■■□□ 2.59
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD109Q6YHK3 1445 aa31.2■■■□□ 2.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.14■■■□□ 2.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLCH2O75038 1416 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.1■■■□□ 2.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPOAP1O95153 1857 aa31.09■■■□□ 2.57
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
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