RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264824.4

LYL1-201, Transcript of LYL1, basic helix-loop-helix family member, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYL1, Length 1,490 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1-201ENST00000264824 NUP160Q12769 1436 aa38.35■■■■□ 3.73
LYL1-201ENST00000264824 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.35■■■■□ 3.73
LYL1-201ENST00000264824 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.26■■■■□ 3.72
LYL1-201ENST00000264824 IQGAP2Q13576 1575 aa38.24■■■■□ 3.71
LYL1-201ENST00000264824 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
LYL1-201ENST00000264824 OSCARQ8IYS5 282 aa38.22■■■■□ 3.71
LYL1-201ENST00000264824 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.14■■■■□ 3.7
LYL1-201ENST00000264824 CEP162Q5TB80 1403 aa38.08■■■■□ 3.69
LYL1-201ENST00000264824 JPH4Q96JJ6 628 aa38.03■■■■□ 3.68
LYL1-201ENST00000264824 CLIP1P30622 1438 aa38.03■■■■□ 3.68
LYL1-201ENST00000264824 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.01■■■■□ 3.67
LYL1-201ENST00000264824 SHROOM2Q13796 1616 aa37.97■■■■□ 3.67
LYL1-201ENST00000264824 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.93■■■■□ 3.66
LYL1-201ENST00000264824 SAMD9Q5K651 1589 aa37.91■■■■□ 3.66
LYL1-201ENST00000264824 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.9■■■■□ 3.66
LYL1-201ENST00000264824 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
LYL1-201ENST00000264824 P3H3Q8IVL6 736 aa37.9■■■■□ 3.66
LYL1-201ENST00000264824 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.87■■■■□ 3.65
LYL1-201ENST00000264824 KIAA0556O60303 1618 aa37.86■■■■□ 3.65
LYL1-201ENST00000264824 DISP1Q96F81 1524 aa37.86■■■■□ 3.65
LYL1-201ENST00000264824 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.79■■■■□ 3.64
LYL1-201ENST00000264824 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.77■■■■□ 3.64
LYL1-201ENST00000264824 ARAP1Q96P48 1450 aa37.74■■■■□ 3.63
LYL1-201ENST00000264824 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
LYL1-201ENST00000264824 ARHGEF11O15085 1522 aa37.59■■■■□ 3.61
LYL1-201ENST00000264824 PTPRGP23470 1445 aa37.56■■■■□ 3.6
LYL1-201ENST00000264824 FMN1Q68DA7 1419 aa37.56■■■■□ 3.6
LYL1-201ENST00000264824 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.54■■■■□ 3.6
LYL1-201ENST00000264824 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.53■■■■□ 3.6
LYL1-201ENST00000264824 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.53■■■■□ 3.6
LYL1-201ENST00000264824 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.53■■■■□ 3.6
LYL1-201ENST00000264824 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
LYL1-201ENST00000264824 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
LYL1-201ENST00000264824 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.4■■■■□ 3.58
LYL1-201ENST00000264824 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.39■■■■□ 3.58
LYL1-201ENST00000264824 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.37■■■■□ 3.57
LYL1-201ENST00000264824 ABCA8O94911 1581 aa37.35■■■■□ 3.57
LYL1-201ENST00000264824 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.35■■■■□ 3.57
LYL1-201ENST00000264824 UACAQ9BZF9 1416 aa37.33■■■■□ 3.57
LYL1-201ENST00000264824 HECW1Q76N89 1606 aa37.32■■■■□ 3.57
LYL1-201ENST00000264824 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.26■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.26■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 ABCC2Q92887 1545 aa37.24■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 ARID3CA6NKF2 412 aa37.23■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 APLP2Q06481 763 aa37.23■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.22■■■■□ 3.55
LYL1-201ENST00000264824 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.19■■■■□ 3.54
LYL1-201ENST00000264824 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.19■■■■□ 3.54
LYL1-201ENST00000264824 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
LYL1-201ENST00000264824 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.14■■■■□ 3.54
LYL1-201ENST00000264824 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
LYL1-201ENST00000264824 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
LYL1-201ENST00000264824 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
LYL1-201ENST00000264824 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.1■■■■□ 3.53
LYL1-201ENST00000264824 TIAM1Q13009 1591 aa37.08■■■■□ 3.53
LYL1-201ENST00000264824 ATP10BO94823 1461 aa37.06■■■■□ 3.52
LYL1-201ENST00000264824 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
LYL1-201ENST00000264824 MAP3K1Q13233 1512 aa37.02■■■■□ 3.52
LYL1-201ENST00000264824 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.02■■■■□ 3.52
LYL1-201ENST00000264824 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.01■■■■□ 3.51
LYL1-201ENST00000264824 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
LYL1-201ENST00000264824 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
LYL1-201ENST00000264824 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.9■■■■□ 3.5
LYL1-201ENST00000264824 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
LYL1-201ENST00000264824 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.88■■■■□ 3.49
LYL1-201ENST00000264824 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.88■■■■□ 3.49
LYL1-201ENST00000264824 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.86■■■■□ 3.49
LYL1-201ENST00000264824 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.84■■■■□ 3.49
LYL1-201ENST00000264824 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
LYL1-201ENST00000264824 ASXL2Q76L83 1435 aa36.77■■■■□ 3.48
LYL1-201ENST00000264824 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
LYL1-201ENST00000264824 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.72■■■■□ 3.47
LYL1-201ENST00000264824 KCNH8Q96L42 1107 aa36.7■■■■□ 3.47
LYL1-201ENST00000264824 MAPKBP1O60336 1514 aa36.7■■■■□ 3.47
LYL1-201ENST00000264824 KIF14Q15058 1648 aa36.69■■■■□ 3.46
LYL1-201ENST00000264824 NCOA2Q15596 1464 aa36.62■■■■□ 3.45
LYL1-201ENST00000264824 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.441e-5■■■■□ 25.8
LYL1-201ENST00000264824 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.51■■■■□ 3.43
LYL1-201ENST00000264824 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.5■■■■□ 3.43
LYL1-201ENST00000264824 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.49■■■■□ 3.43
LYL1-201ENST00000264824 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.48■■■■□ 3.43
LYL1-201ENST00000264824 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.45■■■■□ 3.43
LYL1-201ENST00000264824 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.44■■■■□ 3.42
LYL1-201ENST00000264824 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.43■■■■□ 3.42
LYL1-201ENST00000264824 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.43■■■■□ 3.42
LYL1-201ENST00000264824 DIP2BQ9P265 1576 aa36.43■■■■□ 3.42
LYL1-201ENST00000264824 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.41■■■■□ 3.42
LYL1-201ENST00000264824 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.38■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 GLI2P10070 1586 aa36.37■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 PREX2Q70Z35 1606 aa36.36■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.35■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.33■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
LYL1-201ENST00000264824 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.31■■■■□ 3.4
LYL1-201ENST00000264824 CD109Q6YHK3 1445 aa36.3■■■■□ 3.4
LYL1-201ENST00000264824 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.29■■■■□ 3.4
LYL1-201ENST00000264824 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.29■■■■□ 3.4
LYL1-201ENST00000264824 PLCH2O75038 1416 aa36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms