RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264042.7

FARP2-201, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FARP2, Length 4,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2-201ENST00000264042 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.83■□□□□ 0.92
FARP2-201ENST00000264042 FOXD1Q16676 465 aa20.82■□□□□ 0.92
FARP2-201ENST00000264042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.923e-7■□□□□ 9.7
FARP2-201ENST00000264042 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.78■□□□□ 0.92
FARP2-201ENST00000264042 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.76■□□□□ 0.91
FARP2-201ENST00000264042 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
FARP2-201ENST00000264042 ARAP1Q96P48 1450 aa20.66■□□□□ 0.9
FARP2-201ENST00000264042 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.62■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 MIER1Q8N108 512 aa20.61■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 HMGXB3Q12766 1538 aa20.6■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 TOPBP1Q92547 1522 aa20.6■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 JPH4Q96JJ6 628 aa20.58■□□□□ 0.89
FARP2-201ENST00000264042 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.58■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.57■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 KIF21BO75037 1637 aa20.56■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 TOP2BQ02880 1626 aa20.55■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.55■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.53■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 RGL3Q3MIN7 710 aa20.52■□□□□ 0.88
FARP2-201ENST00000264042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FARP2-201ENST00000264042 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FARP2-201ENST00000264042 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FARP2-201ENST00000264042 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.5■□□□□ 0.87
FARP2-201ENST00000264042 PRXQ9BXM0 1461 aa20.48■□□□□ 0.87
FARP2-201ENST00000264042 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FARP2-201ENST00000264042 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.45■□□□□ 0.86
FARP2-201ENST00000264042 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FARP2-201ENST00000264042 BCANQ96GW7 911 aa20.44■□□□□ 0.86
FARP2-201ENST00000264042 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 28.1
FARP2-201ENST00000264042 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.43■□□□□ 0.86
FARP2-201ENST00000264042 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.39■□□□□ 0.85
FARP2-201ENST00000264042 TONSLQ96HA7 1378 aa20.39■□□□□ 0.85
FARP2-201ENST00000264042 TSPY4P0CV99 314 aa20.38■□□□□ 0.85
FARP2-201ENST00000264042 TSPY10P0CW01 314 aa20.38■□□□□ 0.85
FARP2-201ENST00000264042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.34■□□□□ 0.85
FARP2-201ENST00000264042 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
FARP2-201ENST00000264042 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FARP2-201ENST00000264042 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.29■□□□□ 0.84
FARP2-201ENST00000264042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.24■□□□□ 0.83
FARP2-201ENST00000264042 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.22■□□□□ 0.83
FARP2-201ENST00000264042 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.22■□□□□ 0.83
FARP2-201ENST00000264042 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FARP2-201ENST00000264042 FMN1Q68DA7 1419 aa20.21■□□□□ 0.83
FARP2-201ENST00000264042 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 MLECQ14165 292 aa20.2■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.18■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.16■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 PKD2Q13563 968 aa20.15■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.15■□□□□ 0.82
FARP2-201ENST00000264042 ANP32CO43423 234 aa20.13■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.13■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 PRDM2Q13029 1718 aa20.13■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 GRIN2BQ13224 1484 aa20.13■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.12■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 PTPRGP23470 1445 aa20.11■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.11■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 GGT6Q6P531 493 aa20.11■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.1■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 PLEKHG5O94827 1062 aa20.1■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.09■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.08■□□□□ 0.81
FARP2-201ENST00000264042 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.08■□□□□ 0.8
FARP2-201ENST00000264042 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.08■□□□□ 0.8
FARP2-201ENST00000264042 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.07■□□□□ 0.8
FARP2-201ENST00000264042 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.07■□□□□ 0.8
FARP2-201ENST00000264042 AFAP1Q8N556 730 aa20.05■□□□□ 0.8
FARP2-201ENST00000264042 NCOA2Q15596 1464 aa20■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 NUP155O75694 1391 aa20■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.99■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 OSCARQ8IYS5 282 aa19.97■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 IFT140Q96RY7 1462 aa19.97■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
FARP2-201ENST00000264042 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.95■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 KIF3BO15066 747 aa19.95■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.93■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.93■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 NEFLP07196 543 aa19.9■□□□□ 0.78
FARP2-201ENST00000264042 TIAM1Q13009 1591 aa19.88■□□□□ 0.77
FARP2-201ENST00000264042 PTPRKQ15262 1439 aa19.88■□□□□ 0.77
FARP2-201ENST00000264042 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.87■□□□□ 0.77
FARP2-201ENST00000264042 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.86■□□□□ 0.77
FARP2-201ENST00000264042 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
FARP2-201ENST00000264042 BCL11AQ9H165 835 aa19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms