RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 CEP170Q5SW79 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
MSMO1-201ENST00000261507 GOLGA3Q08378 1498 aa22.37■■□□□ 1.17
MSMO1-201ENST00000261507 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.35■■□□□ 1.17
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.34■■□□□ 1.17
MSMO1-201ENST00000261507 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.33■■□□□ 1.17
MSMO1-201ENST00000261507 IQGAP2Q13576 1575 aa22.27■■□□□ 1.16
MSMO1-201ENST00000261507 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
MSMO1-201ENST00000261507 SHROOM2Q13796 1616 aa22.23■■□□□ 1.15
MSMO1-201ENST00000261507 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MSMO1-201ENST00000261507 JPH4Q96JJ6 628 aa22.19■■□□□ 1.14
MSMO1-201ENST00000261507 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MSMO1-201ENST00000261507 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.17■■□□□ 1.14
MSMO1-201ENST00000261507 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.15■■□□□ 1.14
MSMO1-201ENST00000261507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.14■■□□□ 1.14
MSMO1-201ENST00000261507 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.13■■□□□ 1.13
MSMO1-201ENST00000261507 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MSMO1-201ENST00000261507 ARHGEF11O15085 1522 aa22.07■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.04■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.04■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.04■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA0556O60303 1618 aa22.03■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 SAMD9Q5K651 1589 aa22.03■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 DISP1Q96F81 1524 aa22.02■■□□□ 1.12
MSMO1-201ENST00000261507 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.97■■□□□ 1.11
MSMO1-201ENST00000261507 CLIP1P30622 1438 aa21.94■■□□□ 1.1
MSMO1-201ENST00000261507 PTPRGP23470 1445 aa21.93■■□□□ 1.1
MSMO1-201ENST00000261507 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
MSMO1-201ENST00000261507 CEP162Q5TB80 1403 aa21.91■■□□□ 1.1
MSMO1-201ENST00000261507 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.91■■□□□ 1.1
MSMO1-201ENST00000261507 ARAP1Q96P48 1450 aa21.9■■□□□ 1.1
MSMO1-201ENST00000261507 FMN1Q68DA7 1419 aa21.85■■□□□ 1.09
MSMO1-201ENST00000261507 P3H3Q8IVL6 736 aa21.85■■□□□ 1.09
MSMO1-201ENST00000261507 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.84■■□□□ 1.09
MSMO1-201ENST00000261507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.81■■□□□ 1.08
MSMO1-201ENST00000261507 UACAQ9BZF9 1416 aa21.8■■□□□ 1.08
MSMO1-201ENST00000261507 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.8■■□□□ 1.08
MSMO1-201ENST00000261507 ABCA8O94911 1581 aa21.77■■□□□ 1.08
MSMO1-201ENST00000261507 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
MSMO1-201ENST00000261507 ABCC2Q92887 1545 aa21.76■■□□□ 1.07
MSMO1-201ENST00000261507 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.75■■□□□ 1.07
MSMO1-201ENST00000261507 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.71■■□□□ 1.07
MSMO1-201ENST00000261507 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
MSMO1-201ENST00000261507 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.7■■□□□ 1.06
MSMO1-201ENST00000261507 HECW1Q76N89 1606 aa21.7■■□□□ 1.06
MSMO1-201ENST00000261507 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.69■■□□□ 1.06
MSMO1-201ENST00000261507 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.67■■□□□ 1.06
MSMO1-201ENST00000261507 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.67■■□□□ 1.06
MSMO1-201ENST00000261507 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.65■■□□□ 1.06
MSMO1-201ENST00000261507 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
MSMO1-201ENST00000261507 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.61■■□□□ 1.05
MSMO1-201ENST00000261507 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
MSMO1-201ENST00000261507 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 MAPKBP1O60336 1514 aa21.56■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 ATP10BO94823 1461 aa21.56■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
MSMO1-201ENST00000261507 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 MAP3K1Q13233 1512 aa21.5■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 APLP2Q06481 763 aa21.49■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.48■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 ASXL2Q76L83 1435 aa21.47■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.46■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.46■■□□□ 1.03
MSMO1-201ENST00000261507 ARID3CA6NKF2 412 aa21.44■■□□□ 1.02
MSMO1-201ENST00000261507 TIAM1Q13009 1591 aa21.43■■□□□ 1.02
MSMO1-201ENST00000261507 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
MSMO1-201ENST00000261507 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.38■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 GLI2P10070 1586 aa21.38■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.37■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.37■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 DIP2BQ9P265 1576 aa21.35■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 KIF14Q15058 1648 aa21.34■■□□□ 1.01
MSMO1-201ENST00000261507 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.32■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 KCNH8Q96L42 1107 aa21.31■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.3■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.3■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.29■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.29■■□□□ 1
MSMO1-201ENST00000261507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
MSMO1-201ENST00000261507 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.25■□□□□ 0.99
MSMO1-201ENST00000261507 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
MSMO1-201ENST00000261507 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.22■□□□□ 0.99
MSMO1-201ENST00000261507 CD109Q6YHK3 1445 aa21.21■□□□□ 0.99
MSMO1-201ENST00000261507 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.2■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.2■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.19■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.19■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 NCOA2Q15596 1464 aa21.18■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.18■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.17■□□□□ 0.98
MSMO1-201ENST00000261507 PLCH2O75038 1416 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms