RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261206.7

ACSS3-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS3, Length 2,666 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-201ENST00000261206 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.77■■□□□ 1.88
ACSS3-201ENST00000261206 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ACSS3-201ENST00000261206 CCER2I3L3R5 266 aa26.74■■□□□ 1.87
ACSS3-201ENST00000261206 MSH5O43196 834 aa26.74■■□□□ 1.87
ACSS3-201ENST00000261206 ANP32CO43423 234 aa26.72■■□□□ 1.87
ACSS3-201ENST00000261206 KIF27Q86VH2 1401 aa26.7■■□□□ 1.86
ACSS3-201ENST00000261206 TIAM1Q13009 1591 aa26.65■■□□□ 1.86
ACSS3-201ENST00000261206 CUX1P39880 1505 aa26.63■■□□□ 1.85
ACSS3-201ENST00000261206 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.61■■□□□ 1.85
ACSS3-201ENST00000261206 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.6■■□□□ 1.85
ACSS3-201ENST00000261206 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ACSS3-201ENST00000261206 MAP3K1Q13233 1512 aa26.56■■□□□ 1.84
ACSS3-201ENST00000261206 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.56■■□□□ 1.84
ACSS3-201ENST00000261206 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.56■■□□□ 1.84
ACSS3-201ENST00000261206 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ACSS3-201ENST00000261206 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ACSS3-201ENST00000261206 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.47■■□□□ 1.83
ACSS3-201ENST00000261206 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
ACSS3-201ENST00000261206 TONSLQ96HA7 1378 aa26.39■■□□□ 1.82
ACSS3-201ENST00000261206 IGF1RP08069 1367 aa26.36■■□□□ 1.81
ACSS3-201ENST00000261206 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.35■■□□□ 1.81
ACSS3-201ENST00000261206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.32■■□□□ 1.8
ACSS3-201ENST00000261206 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ACSS3-201ENST00000261206 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ACSS3-201ENST00000261206 P3H3Q8IVL6 736 aa26.28■■□□□ 1.8
ACSS3-201ENST00000261206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.27■■□□□ 1.8
ACSS3-201ENST00000261206 CFTRP13569 1480 aa26.24■■□□□ 1.79
ACSS3-201ENST00000261206 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.23■■□□□ 1.79
ACSS3-201ENST00000261206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.23■■□□□ 1.79
ACSS3-201ENST00000261206 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.22■■□□□ 1.79
ACSS3-201ENST00000261206 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.22■■□□□ 1.79
ACSS3-201ENST00000261206 HMGXB3Q12766 1538 aa26.2■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.19■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 UACAQ9BZF9 1416 aa26.17■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 NCAPD3P42695 1498 aa26.17■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.16■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.16■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.14■■□□□ 1.78
ACSS3-201ENST00000261206 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.13■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.13■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.13■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.12■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 HFM1A2PYH4 1435 aa26.12■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC184Q52MB2 194 aa26.11■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 PTPRKQ15262 1439 aa26.1■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.09■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ACSS3-201ENST00000261206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.07■■□□□ 1.76
ACSS3-201ENST00000261206 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.06■■□□□ 1.76
ACSS3-201ENST00000261206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
ACSS3-201ENST00000261206 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.03■■□□□ 1.76
ACSS3-201ENST00000261206 NAIPQ13075 1403 aa26.02■■□□□ 1.76
ACSS3-201ENST00000261206 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
ACSS3-201ENST00000261206 PRDM2Q13029 1718 aa26■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 NCOA2Q15596 1464 aa26■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 NBR1Q14596 966 aa25.99■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.97■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.96■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 MRS2Q9HD23 443 aa25.95■■□□□ 1.75
ACSS3-201ENST00000261206 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.95■■□□□ 1.74
ACSS3-201ENST00000261206 FMN1Q68DA7 1419 aa25.92■■□□□ 1.74
ACSS3-201ENST00000261206 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ACSS3-201ENST00000261206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.87■■□□□ 1.73
ACSS3-201ENST00000261206 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC7Q96M83 1385 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS3-201ENST00000261206 NCOA1Q15788 1441 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS3-201ENST00000261206 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
ACSS3-201ENST00000261206 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.83■■□□□ 1.73
ACSS3-201ENST00000261206 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 AKNAQ7Z591 1439 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.79■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.79■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.78■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.78■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 HECW1Q76N89 1606 aa25.77■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ACSS3-201ENST00000261206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.76■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.74■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.71■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 FOXD1Q16676 465 aa25.71■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 KDM6BO15054 1643 aa25.7■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.7■■□□□ 1.71
ACSS3-201ENST00000261206 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.7■■□□□ 1.7
ACSS3-201ENST00000261206 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
ACSS3-201ENST00000261206 NUDCQ9Y266 331 aa25.67■■□□□ 1.7
ACSS3-201ENST00000261206 CUL7Q14999 1698 aa25.67■■□□□ 1.7
ACSS3-201ENST00000261206 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.67■■□□□ 1.7
ACSS3-201ENST00000261206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.67■■□□□ 1.7
ACSS3-201ENST00000261206 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.67■■□□□ 1.7
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