RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IGF1RP08069 1367 aa26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIF21BO75037 1637 aa26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FOXD1Q16676 465 aa26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCAPD3P42695 1498 aa26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.89■■□□□ 1.89
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARAP1Q96P48 1450 aa26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KCNH8Q96L42 1107 aa26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CUX1P39880 1505 aa26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPY4P0CV99 314 aa26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPY10P0CW01 314 aa26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NESP48681 1621 aa26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CFTRP13569 1480 aa26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MRS2Q9HD23 443 aa26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRXQ9BXM0 1461 aa26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TOP2BQ02880 1626 aa26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RGL3Q3MIN7 710 aa26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ERCC6Q03468 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FMN1Q68DA7 1419 aa26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMC1Q8TDI8 760 aa26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HMGXB3Q12766 1538 aa26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MYT1Q01538 1121 aa26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.39■■□□□ 1.82
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PKD2Q13563 968 aa26.38■■□□□ 1.81
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.33■■□□□ 1.81
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TOPBP1Q92547 1522 aa26.3■■□□□ 1.8
RAB11FIP5-201ENST00000258098 JPH4Q96JJ6 628 aa26.29■■□□□ 1.8
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.29■■□□□ 1.8
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.28■■□□□ 1.8
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.82e-10■□□□□ 11.2
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCER2I3L3R5 266 aa26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUP155O75694 1391 aa26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TIAM1Q13009 1591 aa26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCOA2Q15596 1464 aa26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BCL11AQ9H165 835 aa26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WDR97A6NE52 1622 aa26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UACAQ9BZF9 1416 aa26■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRDM2Q13029 1718 aa25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP5-201ENST00000258098 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms