RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.2■■■■□ 3.71
PRADC1-201ENST00000258083 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
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PRADC1-201ENST00000258083 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
PRADC1-201ENST00000258083 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.92■■■■□ 3.66
PRADC1-201ENST00000258083 IQGAP2Q13576 1575 aa37.81■■■■□ 3.64
PRADC1-201ENST00000258083 PRXQ9BXM0 1461 aa37.74■■■■□ 3.63
PRADC1-201ENST00000258083 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.7■■■■□ 3.63
PRADC1-201ENST00000258083 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.66■■■■□ 3.62
PRADC1-201ENST00000258083 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.66■■■■□ 3.62
PRADC1-201ENST00000258083 PTPRGP23470 1445 aa37.65■■■■□ 3.62
PRADC1-201ENST00000258083 DISP1Q96F81 1524 aa37.65■■■■□ 3.62
PRADC1-201ENST00000258083 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.65■■■■□ 3.62
PRADC1-201ENST00000258083 MAPKBP1O60336 1514 aa37.56■■■■□ 3.6
PRADC1-201ENST00000258083 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.53■■■■□ 3.6
PRADC1-201ENST00000258083 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.52■■■■□ 3.6
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PRADC1-201ENST00000258083 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.5■■■■□ 3.59
PRADC1-201ENST00000258083 KIAA0556O60303 1618 aa37.47■■■■□ 3.59
PRADC1-201ENST00000258083 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.44■■■■□ 3.58
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.44■■■■□ 3.58
PRADC1-201ENST00000258083 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.42■■■■□ 3.58
PRADC1-201ENST00000258083 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC2Q92887 1545 aa37.41■■■■□ 3.58
PRADC1-201ENST00000258083 UACAQ9BZF9 1416 aa37.4■■■■□ 3.58
PRADC1-201ENST00000258083 GOLGA3Q08378 1498 aa37.36■■■■□ 3.57
PRADC1-201ENST00000258083 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.33■■■■□ 3.57
PRADC1-201ENST00000258083 DIP2BQ9P265 1576 aa37.33■■■■□ 3.57
PRADC1-201ENST00000258083 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.31■■■■□ 3.56
PRADC1-201ENST00000258083 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.26■■■■□ 3.55
PRADC1-201ENST00000258083 ASXL2Q76L83 1435 aa37.19■■■■□ 3.54
PRADC1-201ENST00000258083 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.19■■■■□ 3.54
PRADC1-201ENST00000258083 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
PRADC1-201ENST00000258083 KIF21BO75037 1637 aa37.13■■■■□ 3.53
PRADC1-201ENST00000258083 ABCA8O94911 1581 aa37.12■■■■□ 3.53
PRADC1-201ENST00000258083 SAMD9Q5K651 1589 aa37.09■■■■□ 3.53
PRADC1-201ENST00000258083 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
PRADC1-201ENST00000258083 GLI2P10070 1586 aa37.07■■■■□ 3.52
PRADC1-201ENST00000258083 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
PRADC1-201ENST00000258083 P3H3Q8IVL6 736 aa36.99■■■■□ 3.51
PRADC1-201ENST00000258083 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.94■■■■□ 3.5
PRADC1-201ENST00000258083 TSPOAP1O95153 1857 aa36.89■■■■□ 3.5
PRADC1-201ENST00000258083 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
PRADC1-201ENST00000258083 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.84■■■■□ 3.49
PRADC1-201ENST00000258083 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.83■■■■□ 3.49
PRADC1-201ENST00000258083 ATP10BO94823 1461 aa36.82■■■■□ 3.49
PRADC1-201ENST00000258083 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.82■■■■□ 3.48
PRADC1-201ENST00000258083 KDM6BO15054 1643 aa36.8■■■■□ 3.48
PRADC1-201ENST00000258083 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.78■■■■□ 3.48
PRADC1-201ENST00000258083 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
PRADC1-201ENST00000258083 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
PRADC1-201ENST00000258083 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
PRADC1-201ENST00000258083 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.69■■■■□ 3.46
PRADC1-201ENST00000258083 ARID3CA6NKF2 412 aa36.68■■■■□ 3.46
PRADC1-201ENST00000258083 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.66■■■■□ 3.46
PRADC1-201ENST00000258083 KCNH8Q96L42 1107 aa36.66■■■■□ 3.46
PRADC1-201ENST00000258083 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.64■■■■□ 3.46
PRADC1-201ENST00000258083 CD109Q6YHK3 1445 aa36.63■■■■□ 3.45
PRADC1-201ENST00000258083 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.63■■■■□ 3.45
PRADC1-201ENST00000258083 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.59■■■■□ 3.45
PRADC1-201ENST00000258083 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.5■■■■□ 3.43
PRADC1-201ENST00000258083 FMN1Q68DA7 1419 aa36.5■■■■□ 3.43
PRADC1-201ENST00000258083 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
PRADC1-201ENST00000258083 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
PRADC1-201ENST00000258083 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.41■■■■□ 3.42
PRADC1-201ENST00000258083 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
PRADC1-201ENST00000258083 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
PRADC1-201ENST00000258083 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.34■■■■□ 3.41
PRADC1-201ENST00000258083 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.33■■■■□ 3.41
PRADC1-201ENST00000258083 HECW1Q76N89 1606 aa36.33■■■■□ 3.41
PRADC1-201ENST00000258083 NEO1Q92859 1461 aa36.28■■■■□ 3.4
PRADC1-201ENST00000258083 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.25■■■■□ 3.39
PRADC1-201ENST00000258083 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
PRADC1-201ENST00000258083 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
PRADC1-201ENST00000258083 CLIP1P30622 1438 aa36.18■■■■□ 3.38
PRADC1-201ENST00000258083 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.17■■■■□ 3.38
PRADC1-201ENST00000258083 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.16■■■■□ 3.38
PRADC1-201ENST00000258083 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
PRADC1-201ENST00000258083 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
PRADC1-201ENST00000258083 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.1■■■■□ 3.37
PRADC1-201ENST00000258083 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PRADC1-201ENST00000258083 FANCAO15360 1455 aa36.08■■■■□ 3.37
PRADC1-201ENST00000258083 ADGRL1O94910 1474 aa36.06■■■■□ 3.36
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PRADC1-201ENST00000258083 AKNAQ7Z591 1439 aa36.06■■■■□ 3.36
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.05■■■■□ 3.36
PRADC1-201ENST00000258083 PLCH2O75038 1416 aa36.05■■■■□ 3.36
PRADC1-201ENST00000258083 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.05■■■■□ 3.36
PRADC1-201ENST00000258083 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.04■■■■□ 3.36
PRADC1-201ENST00000258083 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.03■■■■□ 3.36
PRADC1-201ENST00000258083 KIF14Q15058 1648 aa36■■■■□ 3.35
PRADC1-201ENST00000258083 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
PRADC1-201ENST00000258083 RICTORQ6R327 1708 aa35.92■■■■□ 3.34
PRADC1-201ENST00000258083 CEP162Q5TB80 1403 aa35.91■■■■□ 3.34
PRADC1-201ENST00000258083 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.89■■■■□ 3.34
PRADC1-201ENST00000258083 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.88■■■■□ 3.33
PRADC1-201ENST00000258083 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.85■■■■□ 3.33
PRADC1-201ENST00000258083 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.83■■■■□ 3.33
PRADC1-201ENST00000258083 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.82■■■■□ 3.32
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