RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.54■■■■□ 3.44
LMO2-201ENST00000257818 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
LMO2-201ENST00000257818 CUL7Q14999 1698 aa36.45■■■■□ 3.43
LMO2-201ENST00000257818 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.44■■■■□ 3.42
LMO2-201ENST00000257818 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.42■■■■□ 3.42
LMO2-201ENST00000257818 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.41■■■■□ 3.42
LMO2-201ENST00000257818 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
LMO2-201ENST00000257818 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
LMO2-201ENST00000257818 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
LMO2-201ENST00000257818 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.25■■■■□ 3.39
LMO2-201ENST00000257818 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.21■■■■□ 3.39
LMO2-201ENST00000257818 P3H3Q8IVL6 736 aa36.21■■■■□ 3.39
LMO2-201ENST00000257818 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.383e-7■■■□□ 18.3
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LMO2-201ENST00000257818 ERCC6Q03468 1493 aa36.14■■■■□ 3.38
LMO2-201ENST00000257818 PBRM1Q86U86 1689 aa36.12■■■■□ 3.37
LMO2-201ENST00000257818 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.07■■■■□ 3.37
LMO2-201ENST00000257818 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
LMO2-201ENST00000257818 IFT140Q96RY7 1462 aa36.05■■■■□ 3.36
LMO2-201ENST00000257818 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.04■■■■□ 3.36
LMO2-201ENST00000257818 MYT1Q01538 1121 aa36.04■■■■□ 3.36
LMO2-201ENST00000257818 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
LMO2-201ENST00000257818 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.02■■■■□ 3.36
LMO2-201ENST00000257818 TIAM1Q13009 1591 aa35.97■■■■□ 3.35
LMO2-201ENST00000257818 GRIN2BQ13224 1484 aa35.97■■■■□ 3.35
LMO2-201ENST00000257818 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
LMO2-201ENST00000257818 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.34
LMO2-201ENST00000257818 ADAMTS12P58397 1594 aa35.94■■■■□ 3.34
LMO2-201ENST00000257818 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
LMO2-201ENST00000257818 MAP3K1Q13233 1512 aa35.92■■■■□ 3.34
LMO2-201ENST00000257818 SAMD9Q5K651 1589 aa35.86■■■■□ 3.33
LMO2-201ENST00000257818 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.84■■■■□ 3.33
LMO2-201ENST00000257818 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.82■■■■□ 3.33
LMO2-201ENST00000257818 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.82■■■■□ 3.32
LMO2-201ENST00000257818 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.81■■■■□ 3.32
LMO2-201ENST00000257818 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
LMO2-201ENST00000257818 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.8■■■■□ 3.32
LMO2-201ENST00000257818 FMN1Q68DA7 1419 aa35.79■■■■□ 3.32
LMO2-201ENST00000257818 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.74■■■■□ 3.31
LMO2-201ENST00000257818 IQGAP2Q13576 1575 aa35.71■■■■□ 3.31
LMO2-201ENST00000257818 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
LMO2-201ENST00000257818 ITGAEP38570 1179 aa35.64■■■■□ 3.3
LMO2-201ENST00000257818 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.63■■■■□ 3.29
LMO2-201ENST00000257818 MAPKBP1O60336 1514 aa35.61■■■■□ 3.29
LMO2-201ENST00000257818 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.6■■■■□ 3.29
LMO2-201ENST00000257818 GRIN2AQ12879 1464 aa35.57■■■■□ 3.29
LMO2-201ENST00000257818 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.57■■■■□ 3.28
LMO2-201ENST00000257818 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
LMO2-201ENST00000257818 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.51■■■■□ 3.27
LMO2-201ENST00000257818 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.49■■■■□ 3.27
LMO2-201ENST00000257818 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
LMO2-201ENST00000257818 FBLN2P98095 1184 aa35.46■■■■□ 3.27
LMO2-201ENST00000257818 SYNJ2O15056 1496 aa35.45■■■■□ 3.27
LMO2-201ENST00000257818 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.44■■■■□ 3.26
LMO2-201ENST00000257818 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
LMO2-201ENST00000257818 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.42■■■■□ 3.26
LMO2-201ENST00000257818 KCNH8Q96L42 1107 aa35.41■■■■□ 3.26
LMO2-201ENST00000257818 CEP170Q5SW79 1584 aa35.37■■■■□ 3.25
LMO2-201ENST00000257818 DISP1Q96F81 1524 aa35.37■■■■□ 3.25
LMO2-201ENST00000257818 KIAA0556O60303 1618 aa35.34■■■■□ 3.25
LMO2-201ENST00000257818 HECW1Q76N89 1606 aa35.34■■■■□ 3.25
LMO2-201ENST00000257818 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.3■■■■□ 3.24
LMO2-201ENST00000257818 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.27■■■■□ 3.24
LMO2-201ENST00000257818 ARID3CA6NKF2 412 aa35.26■■■■□ 3.24
LMO2-201ENST00000257818 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
LMO2-201ENST00000257818 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.26■■■■□ 3.24
LMO2-201ENST00000257818 NCOA2Q15596 1464 aa35.26■■■■□ 3.23
LMO2-201ENST00000257818 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.26■■■■□ 3.23
LMO2-201ENST00000257818 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.25■■■■□ 3.23
LMO2-201ENST00000257818 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
LMO2-201ENST00000257818 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.23■■■■□ 3.23
LMO2-201ENST00000257818 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
LMO2-201ENST00000257818 NUP160Q12769 1436 aa35.23■■■■□ 3.23
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LMO2-201ENST00000257818 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.15■■■■□ 3.22
LMO2-201ENST00000257818 JPH4Q96JJ6 628 aa35.15■■■■□ 3.22
LMO2-201ENST00000257818 ARHGEF11O15085 1522 aa35.1■■■■□ 3.21
LMO2-201ENST00000257818 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
LMO2-201ENST00000257818 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.09■■■■□ 3.21
LMO2-201ENST00000257818 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.08■■■■□ 3.21
LMO2-201ENST00000257818 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
LMO2-201ENST00000257818 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.04■■■■□ 3.2
LMO2-201ENST00000257818 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.99■■■■□ 3.19
LMO2-201ENST00000257818 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.99■■■■□ 3.19
LMO2-201ENST00000257818 PTPRKQ15262 1439 aa34.98■■■■□ 3.19
LMO2-201ENST00000257818 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
LMO2-201ENST00000257818 CHD1O14646 1710 aa34.94■■■■□ 3.18
LMO2-201ENST00000257818 BCANQ96GW7 911 aa34.94■■■■□ 3.18
LMO2-201ENST00000257818 FKBP8Q14318 412 aa34.92■■■■□ 3.18
LMO2-201ENST00000257818 CCER2I3L3R5 266 aa34.87■■■■□ 3.17
LMO2-201ENST00000257818 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
LMO2-201ENST00000257818 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
LMO2-201ENST00000257818 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
LMO2-201ENST00000257818 MIA2Q96PC5 1412 aa34.81■■■■□ 3.16
LMO2-201ENST00000257818 HFM1A2PYH4 1435 aa34.81■■■■□ 3.16
LMO2-201ENST00000257818 ANP32CO43423 234 aa34.79■■■■□ 3.16
LMO2-201ENST00000257818 ABCA8O94911 1581 aa34.76■■■■□ 3.15
LMO2-201ENST00000257818 ANP32EQ9BTT0 268 aa34.75■■■■□ 3.15
LMO2-201ENST00000257818 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.75■■■■□ 3.15
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