RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1-201ENST00000257552 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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MSI1-201ENST00000257552 PBRM1Q86U86 1689 aa20.53■□□□□ 0.88
MSI1-201ENST00000257552 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.53■□□□□ 0.88
MSI1-201ENST00000257552 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MSI1-201ENST00000257552 IFT140Q96RY7 1462 aa20.51■□□□□ 0.87
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MSI1-201ENST00000257552 WDR62O43379 1518 aa20.47■□□□□ 0.87
MSI1-201ENST00000257552 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.46■□□□□ 0.87
MSI1-201ENST00000257552 IQGAP2Q13576 1575 aa20.46■□□□□ 0.87
MSI1-201ENST00000257552 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.45■□□□□ 0.86
MSI1-201ENST00000257552 NCOA2Q15596 1464 aa20.43■□□□□ 0.86
MSI1-201ENST00000257552 TONSLQ96HA7 1378 aa20.43■□□□□ 0.86
MSI1-201ENST00000257552 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.42■□□□□ 0.86
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MSI1-201ENST00000257552 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.35■□□□□ 0.85
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MSI1-201ENST00000257552 CCDC184Q52MB2 194 aa20.32■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.32■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.3■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 DISP1Q96F81 1524 aa20.29■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 JPH4Q96JJ6 628 aa20.29■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.28■□□□□ 0.84
MSI1-201ENST00000257552 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
MSI1-201ENST00000257552 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.26■□□□□ 0.83
MSI1-201ENST00000257552 HECW1Q76N89 1606 aa20.26■□□□□ 0.83
MSI1-201ENST00000257552 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.26■□□□□ 0.83
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