RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.86■■■□□ 2.37
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MSI1-201ENST00000257552 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.36■■□□□ 1.65
MSI1-201ENST00000257552 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
MSI1-201ENST00000257552 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
MSI1-201ENST00000257552 HRCP23327 699 aa24.8■■□□□ 1.56
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MSI1-201ENST00000257552 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
MSI1-201ENST00000257552 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.3■■□□□ 1.48
MSI1-201ENST00000257552 ABCC9O60706 1549 aa24.29■■□□□ 1.48
MSI1-201ENST00000257552 SCRIBQ14160 1630 aa24.03■■□□□ 1.44
MSI1-201ENST00000257552 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.88■■□□□ 1.41
MSI1-201ENST00000257552 NACADO15069 1562 aa23.65■■□□□ 1.38
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MSI1-201ENST00000257552 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
MSI1-201ENST00000257552 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MSI1-201ENST00000257552 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.48■■□□□ 1.35
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MSI1-201ENST00000257552 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.4■■□□□ 1.34
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MSI1-201ENST00000257552 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.28■■□□□ 1.32
MSI1-201ENST00000257552 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.13■■□□□ 1.29
MSI1-201ENST00000257552 WIZO95785 1651 aa23.12■■□□□ 1.29
MSI1-201ENST00000257552 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MSI1-201ENST00000257552 TRIM41Q8WV44 630 aa23.12■■□□□ 1.29
MSI1-201ENST00000257552 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.99■■□□□ 1.27
MSI1-201ENST00000257552 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MSI1-201ENST00000257552 NEUROD1Q13562 356 aa22.87■■□□□ 1.25
MSI1-201ENST00000257552 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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MSI1-201ENST00000257552 SMARCA4P51532 1647 aa22.8■■□□□ 1.24
MSI1-201ENST00000257552 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.8■■□□□ 1.24
MSI1-201ENST00000257552 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.74■■□□□ 1.23
MSI1-201ENST00000257552 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
MSI1-201ENST00000257552 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.66■■□□□ 1.22
MSI1-201ENST00000257552 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
MSI1-201ENST00000257552 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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MSI1-201ENST00000257552 ABCC8Q09428 1581 aa22.55■■□□□ 1.2
MSI1-201ENST00000257552 SMARCA2P51531 1590 aa22.54■■□□□ 1.2
MSI1-201ENST00000257552 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
MSI1-201ENST00000257552 MYT1Q01538 1121 aa22.5■■□□□ 1.19
MSI1-201ENST00000257552 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
MSI1-201ENST00000257552 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.39■■□□□ 1.17
MSI1-201ENST00000257552 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
MSI1-201ENST00000257552 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MSI1-201ENST00000257552 SOGA1O94964 1423 aa22.29■■□□□ 1.16
MSI1-201ENST00000257552 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.25■■□□□ 1.15
MSI1-201ENST00000257552 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.21■■□□□ 1.15
MSI1-201ENST00000257552 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MSI1-201ENST00000257552 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
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MSI1-201ENST00000257552 MIER1Q8N108 512 aa22.08■■□□□ 1.13
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MSI1-201ENST00000257552 NCAPD3P42695 1498 aa21.96■■□□□ 1.11
MSI1-201ENST00000257552 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
MSI1-201ENST00000257552 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MSI1-201ENST00000257552 EEA1Q15075 1411 aa21.85■■□□□ 1.09
MSI1-201ENST00000257552 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.84■■□□□ 1.09
MSI1-201ENST00000257552 HMGXB3Q12766 1538 aa21.84■■□□□ 1.09
MSI1-201ENST00000257552 GOLGA3Q08378 1498 aa21.8■■□□□ 1.08
MSI1-201ENST00000257552 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.72■■□□□ 1.07
MSI1-201ENST00000257552 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.71■■□□□ 1.07
MSI1-201ENST00000257552 CFTRP13569 1480 aa21.7■■□□□ 1.06
MSI1-201ENST00000257552 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.7■■□□□ 1.06
MSI1-201ENST00000257552 TOP2BQ02880 1626 aa21.69■■□□□ 1.06
MSI1-201ENST00000257552 CUX1P39880 1505 aa21.67■■□□□ 1.06
MSI1-201ENST00000257552 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
MSI1-201ENST00000257552 CLIP1P30622 1438 aa21.62■■□□□ 1.05
MSI1-201ENST00000257552 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.61■■□□□ 1.05
MSI1-201ENST00000257552 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.6■■□□□ 1.05
MSI1-201ENST00000257552 KIF21BO75037 1637 aa21.55■■□□□ 1.04
MSI1-201ENST00000257552 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.55■■□□□ 1.04
MSI1-201ENST00000257552 KIF27Q86VH2 1401 aa21.5■■□□□ 1.03
MSI1-201ENST00000257552 APLP2Q06481 763 aa21.5■■□□□ 1.03
MSI1-201ENST00000257552 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.5■■□□□ 1.03
MSI1-201ENST00000257552 NESP48681 1621 aa21.49■■□□□ 1.03
MSI1-201ENST00000257552 CUX2O14529 1486 aa21.45■■□□□ 1.02
MSI1-201ENST00000257552 PRXQ9BXM0 1461 aa21.43■■□□□ 1.02
MSI1-201ENST00000257552 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.42■■□□□ 1.02
MSI1-201ENST00000257552 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.41■■□□□ 1.02
MSI1-201ENST00000257552 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.4■■□□□ 1.02
MSI1-201ENST00000257552 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.4■■□□□ 1.02
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MSI1-201ENST00000257552 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.32■■□□□ 1
MSI1-201ENST00000257552 KCNH8Q96L42 1107 aa21.3■■□□□ 1
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MSI1-201ENST00000257552 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.28■■□□□ 1
MSI1-201ENST00000257552 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
MSI1-201ENST00000257552 BCL11AQ9H165 835 aa21.28■■□□□ 1
MSI1-201ENST00000257552 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
MSI1-201ENST00000257552 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.27■□□□□ 0.99
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