RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254301.13

LGALS3-201, Transcript of galectin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LGALS3, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3-201ENST00000254301 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.56■■■■■ 5.04
LGALS3-201ENST00000254301 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.5■■■■■ 5.03
LGALS3-201ENST00000254301 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
LGALS3-201ENST00000254301 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.4■■■■■ 5.02
LGALS3-201ENST00000254301 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
LGALS3-201ENST00000254301 PRXQ9BXM0 1461 aa46.15■■■■■ 4.98
LGALS3-201ENST00000254301 IQGAP2Q13576 1575 aa46.13■■■■■ 4.98
LGALS3-201ENST00000254301 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.13■■■■■ 4.98
LGALS3-201ENST00000254301 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.13■■■■■ 4.98
LGALS3-201ENST00000254301 EEA1Q15075 1411 aa46.05■■■■■ 4.96
LGALS3-201ENST00000254301 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.04■■■■■ 4.96
LGALS3-201ENST00000254301 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.94
LGALS3-201ENST00000254301 PTPRGP23470 1445 aa45.94■■■■■ 4.94
LGALS3-201ENST00000254301 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.93■■■■■ 4.94
LGALS3-201ENST00000254301 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.9■■■■■ 4.94
LGALS3-201ENST00000254301 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
LGALS3-201ENST00000254301 DISP1Q96F81 1524 aa45.87■■■■■ 4.93
LGALS3-201ENST00000254301 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.83■■■■■ 4.93
LGALS3-201ENST00000254301 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.82■■■■■ 4.92
LGALS3-201ENST00000254301 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.74■■■■■ 4.91
LGALS3-201ENST00000254301 KIAA0556O60303 1618 aa45.7■■■■■ 4.91
LGALS3-201ENST00000254301 GOLGA3Q08378 1498 aa45.66■■■■■ 4.9
LGALS3-201ENST00000254301 UACAQ9BZF9 1416 aa45.59■■■■■ 4.89
LGALS3-201ENST00000254301 MAPKBP1O60336 1514 aa45.53■■■■■ 4.88
LGALS3-201ENST00000254301 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.53■■■■■ 4.88
LGALS3-201ENST00000254301 KIF21BO75037 1637 aa45.52■■■■■ 4.88
LGALS3-201ENST00000254301 ABCC2Q92887 1545 aa45.5■■■■■ 4.87
LGALS3-201ENST00000254301 P3H3Q8IVL6 736 aa45.43■■■■■ 4.86
LGALS3-201ENST00000254301 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.41■■■■■ 4.86
LGALS3-201ENST00000254301 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.41■■■■■ 4.86
LGALS3-201ENST00000254301 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.38■■■■■ 4.86
LGALS3-201ENST00000254301 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
LGALS3-201ENST00000254301 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.35■■■■■ 4.85
LGALS3-201ENST00000254301 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
LGALS3-201ENST00000254301 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.31■■■■■ 4.84
LGALS3-201ENST00000254301 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.29■■■■■ 4.84
LGALS3-201ENST00000254301 SAMD9Q5K651 1589 aa45.28■■■■■ 4.84
LGALS3-201ENST00000254301 ASXL2Q76L83 1435 aa45.26■■■■■ 4.84
LGALS3-201ENST00000254301 DIP2BQ9P265 1576 aa45.24■■■■■ 4.83
LGALS3-201ENST00000254301 ABCA8O94911 1581 aa45.24■■■■■ 4.83
LGALS3-201ENST00000254301 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
LGALS3-201ENST00000254301 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.09■■■■■ 4.81
LGALS3-201ENST00000254301 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.06■■■■■ 4.8
LGALS3-201ENST00000254301 ARID3CA6NKF2 412 aa44.99■■■■■ 4.79
LGALS3-201ENST00000254301 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
LGALS3-201ENST00000254301 GLI2P10070 1586 aa44.97■■■■■ 4.79
LGALS3-201ENST00000254301 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.97■■■■■ 4.79
LGALS3-201ENST00000254301 ATP10BO94823 1461 aa44.92■■■■■ 4.78
LGALS3-201ENST00000254301 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.92■■■■■ 4.78
LGALS3-201ENST00000254301 KCNH8Q96L42 1107 aa44.86■■■■■ 4.77
LGALS3-201ENST00000254301 TSPOAP1O95153 1857 aa44.84■■■■■ 4.77
LGALS3-201ENST00000254301 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
LGALS3-201ENST00000254301 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
LGALS3-201ENST00000254301 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.83■■■■■ 4.77
LGALS3-201ENST00000254301 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
LGALS3-201ENST00000254301 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.72■■■■■ 4.75
LGALS3-201ENST00000254301 FMN1Q68DA7 1419 aa44.71■■■■■ 4.75
LGALS3-201ENST00000254301 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
LGALS3-201ENST00000254301 CD109Q6YHK3 1445 aa44.64■■■■■ 4.74
LGALS3-201ENST00000254301 KDM6BO15054 1643 aa44.62■■■■■ 4.73
LGALS3-201ENST00000254301 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.62■■■■■ 4.73
LGALS3-201ENST00000254301 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
LGALS3-201ENST00000254301 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.59■■■■■ 4.73
LGALS3-201ENST00000254301 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.53■■■■■ 4.72
LGALS3-201ENST00000254301 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.51■■■■■ 4.72
LGALS3-201ENST00000254301 CLIP1P30622 1438 aa44.5■■■■■ 4.71
LGALS3-201ENST00000254301 HECW1Q76N89 1606 aa44.45■■■■■ 4.71
LGALS3-201ENST00000254301 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
LGALS3-201ENST00000254301 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.41■■■■■ 4.7
LGALS3-201ENST00000254301 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
LGALS3-201ENST00000254301 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
LGALS3-201ENST00000254301 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.32■■■■■ 4.68
LGALS3-201ENST00000254301 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.28■■■■■ 4.68
LGALS3-201ENST00000254301 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
LGALS3-201ENST00000254301 CEP162Q5TB80 1403 aa44.22■■■■■ 4.67
LGALS3-201ENST00000254301 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.21■■■■■ 4.67
LGALS3-201ENST00000254301 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.2■■■■■ 4.67
LGALS3-201ENST00000254301 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.16■■■■■ 4.66
LGALS3-201ENST00000254301 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.15■■■■■ 4.66
LGALS3-201ENST00000254301 NEO1Q92859 1461 aa44.14■■■■■ 4.66
LGALS3-201ENST00000254301 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.14■■■■■ 4.66
LGALS3-201ENST00000254301 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
LGALS3-201ENST00000254301 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.1■■■■■ 4.65
LGALS3-201ENST00000254301 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.09■■■■■ 4.65
LGALS3-201ENST00000254301 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
LGALS3-201ENST00000254301 FANCAO15360 1455 aa44.02■■■■■ 4.64
LGALS3-201ENST00000254301 PLCH2O75038 1416 aa43.99■■■■■ 4.63
LGALS3-201ENST00000254301 RAPGEF3O95398 923 aa43.98■■■■■ 4.63
LGALS3-201ENST00000254301 KIF14Q15058 1648 aa43.98■■■■■ 4.63
LGALS3-201ENST00000254301 AKNAQ7Z591 1439 aa43.98■■■■■ 4.63
LGALS3-201ENST00000254301 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.91■■■■■ 4.62
LGALS3-201ENST00000254301 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.88■■■■■ 4.62
LGALS3-201ENST00000254301 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
LGALS3-201ENST00000254301 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.85■■■■■ 4.61
LGALS3-201ENST00000254301 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.81■■■■■ 4.6
LGALS3-201ENST00000254301 ADGRL1O94910 1474 aa43.76■■■■■ 4.6
LGALS3-201ENST00000254301 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.75■■■■■ 4.59
LGALS3-201ENST00000254301 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.75■■■■■ 4.59
LGALS3-201ENST00000254301 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.74■■■■■ 4.59
LGALS3-201ENST00000254301 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.74■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms