RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252813.5

PGPEP1-201, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGPEP1, Length 1,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-201ENST00000252813 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.6■■□□□ 1.69
PGPEP1-201ENST00000252813 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.58■■□□□ 1.69
PGPEP1-201ENST00000252813 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PGPEP1-201ENST00000252813 ARAP1Q96P48 1450 aa25.57■■□□□ 1.68
PGPEP1-201ENST00000252813 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PGPEP1-201ENST00000252813 PRXQ9BXM0 1461 aa25.52■■□□□ 1.68
PGPEP1-201ENST00000252813 EEA1Q15075 1411 aa25.52■■□□□ 1.68
PGPEP1-201ENST00000252813 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.48■■□□□ 1.67
PGPEP1-201ENST00000252813 SHROOM2Q13796 1616 aa25.48■■□□□ 1.67
PGPEP1-201ENST00000252813 IQGAP2Q13576 1575 aa25.33■■□□□ 1.65
PGPEP1-201ENST00000252813 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.32■■□□□ 1.64
PGPEP1-201ENST00000252813 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PGPEP1-201ENST00000252813 PTPRGP23470 1445 aa25.28■■□□□ 1.64
PGPEP1-201ENST00000252813 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.26■■□□□ 1.63
PGPEP1-201ENST00000252813 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.25■■□□□ 1.63
PGPEP1-201ENST00000252813 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.25■■□□□ 1.63
PGPEP1-201ENST00000252813 DISP1Q96F81 1524 aa25.23■■□□□ 1.63
PGPEP1-201ENST00000252813 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
PGPEP1-201ENST00000252813 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PGPEP1-201ENST00000252813 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PGPEP1-201ENST00000252813 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PGPEP1-201ENST00000252813 P3H3Q8IVL6 736 aa25.15■■□□□ 1.62
PGPEP1-201ENST00000252813 KIF21BO75037 1637 aa25.14■■□□□ 1.61
PGPEP1-201ENST00000252813 GOLGA3Q08378 1498 aa25.14■■□□□ 1.61
PGPEP1-201ENST00000252813 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.12■■□□□ 1.61
PGPEP1-201ENST00000252813 KIAA0556O60303 1618 aa25.07■■□□□ 1.6
PGPEP1-201ENST00000252813 UACAQ9BZF9 1416 aa25.06■■□□□ 1.6
PGPEP1-201ENST00000252813 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.01■■□□□ 1.59
PGPEP1-201ENST00000252813 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.99■■□□□ 1.59
PGPEP1-201ENST00000252813 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.94■■□□□ 1.58
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCC2Q92887 1545 aa24.94■■□□□ 1.58
PGPEP1-201ENST00000252813 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.91■■□□□ 1.58
PGPEP1-201ENST00000252813 SAMD9Q5K651 1589 aa24.91■■□□□ 1.58
PGPEP1-201ENST00000252813 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.88■■□□□ 1.57
PGPEP1-201ENST00000252813 MAPKBP1O60336 1514 aa24.87■■□□□ 1.57
PGPEP1-201ENST00000252813 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.87■■□□□ 1.57
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCA8O94911 1581 aa24.84■■□□□ 1.57
PGPEP1-201ENST00000252813 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.83■■□□□ 1.57
PGPEP1-201ENST00000252813 ARID3CA6NKF2 412 aa24.83■■□□□ 1.57
PGPEP1-201ENST00000252813 ASXL2Q76L83 1435 aa24.83■■□□□ 1.56
PGPEP1-201ENST00000252813 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.82■■□□□ 1.56
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.82■■□□□ 1.56
PGPEP1-201ENST00000252813 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.8■■□□□ 1.56
PGPEP1-201ENST00000252813 ATP10BO94823 1461 aa24.76■■□□□ 1.55
PGPEP1-201ENST00000252813 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PGPEP1-201ENST00000252813 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PGPEP1-201ENST00000252813 KCNH8Q96L42 1107 aa24.74■■□□□ 1.55
PGPEP1-201ENST00000252813 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PGPEP1-201ENST00000252813 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PGPEP1-201ENST00000252813 FMN1Q68DA7 1419 aa24.7■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 CLIP1P30622 1438 aa24.69■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.68■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 DIP2BQ9P265 1576 aa24.66■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.65■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.65■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PGPEP1-201ENST00000252813 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.63■■□□□ 1.53
PGPEP1-201ENST00000252813 GLI2P10070 1586 aa24.59■■□□□ 1.53
PGPEP1-201ENST00000252813 CEP162Q5TB80 1403 aa24.55■■□□□ 1.52
PGPEP1-201ENST00000252813 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PGPEP1-201ENST00000252813 CD109Q6YHK3 1445 aa24.51■■□□□ 1.51
PGPEP1-201ENST00000252813 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.51■■□□□ 1.51
PGPEP1-201ENST00000252813 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PGPEP1-201ENST00000252813 HECW1Q76N89 1606 aa24.44■■□□□ 1.5
PGPEP1-201ENST00000252813 TSPOAP1O95153 1857 aa24.42■■□□□ 1.5
PGPEP1-201ENST00000252813 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.42■■□□□ 1.5
PGPEP1-201ENST00000252813 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.39■■□□□ 1.5
PGPEP1-201ENST00000252813 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.39■■□□□ 1.5
PGPEP1-201ENST00000252813 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.38■■□□□ 1.49
PGPEP1-201ENST00000252813 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PGPEP1-201ENST00000252813 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PGPEP1-201ENST00000252813 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.34■■□□□ 1.49
PGPEP1-201ENST00000252813 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PGPEP1-201ENST00000252813 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.33■■□□□ 1.49
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.33■■□□□ 1.48
PGPEP1-201ENST00000252813 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PGPEP1-201ENST00000252813 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
PGPEP1-201ENST00000252813 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.28■■□□□ 1.48
PGPEP1-201ENST00000252813 KDM6BO15054 1643 aa24.27■■□□□ 1.48
PGPEP1-201ENST00000252813 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.26■■□□□ 1.47
PGPEP1-201ENST00000252813 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.25■■□□□ 1.47
PGPEP1-201ENST00000252813 PLCH2O75038 1416 aa24.24■■□□□ 1.47
PGPEP1-201ENST00000252813 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.23■■□□□ 1.47
PGPEP1-201ENST00000252813 NEO1Q92859 1461 aa24.22■■□□□ 1.47
PGPEP1-201ENST00000252813 RAPGEF3O95398 923 aa24.2■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.2■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.19■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.18■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 AKNAQ7Z591 1439 aa24.18■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 FANCAO15360 1455 aa24.18■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 KIF14Q15058 1648 aa24.16■■□□□ 1.46
PGPEP1-201ENST00000252813 APLP2Q06481 763 aa24.11■■□□□ 1.45
PGPEP1-201ENST00000252813 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PGPEP1-201ENST00000252813 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.08■■□□□ 1.45
PGPEP1-201ENST00000252813 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.07■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms