RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXD3-201ENST00000249440 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXD3-201ENST00000249440 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD3-201ENST00000249440 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD3-201ENST00000249440 MAP3K1Q13233 1512 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD3-201ENST00000249440 WDR62O43379 1518 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD3-201ENST00000249440 TIAM1Q13009 1591 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD3-201ENST00000249440 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD3-201ENST00000249440 MIER1Q8N108 512 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD3-201ENST00000249440 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD3-201ENST00000249440 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD3-201ENST00000249440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD3-201ENST00000249440 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXD3-201ENST00000249440 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD3-201ENST00000249440 WDR97A6NE52 1622 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXD3-201ENST00000249440 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXD3-201ENST00000249440 ITGAEP38570 1179 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD3-201ENST00000249440 CUL7Q14999 1698 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD3-201ENST00000249440 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 P3H3Q8IVL6 736 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD3-201ENST00000249440 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 IFT140Q96RY7 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXD3-201ENST00000249440 MAPKBP1O60336 1514 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD3-201ENST00000249440 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXD3-201ENST00000249440 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXD3-201ENST00000249440 FMN1Q68DA7 1419 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXD3-201ENST00000249440 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
HOXD3-201ENST00000249440 PBRM1Q86U86 1689 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXD3-201ENST00000249440 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD3-201ENST00000249440 SAMD9Q5K651 1589 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD3-201ENST00000249440 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD3-201ENST00000249440 GRIN2BQ13224 1484 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD3-201ENST00000249440 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD3-201ENST00000249440 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD3-201ENST00000249440 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD3-201ENST00000249440 ADAMTS12P58397 1594 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD3-201ENST00000249440 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD3-201ENST00000249440 FBLN2P98095 1184 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD3-201ENST00000249440 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXD3-201ENST00000249440 NCOA2Q15596 1464 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD3-201ENST00000249440 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD3-201ENST00000249440 HFM1A2PYH4 1435 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD3-201ENST00000249440 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD3-201ENST00000249440 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXD3-201ENST00000249440 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 PTPRKQ15262 1439 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 UACAQ9BZF9 1416 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 GRIN2AQ12879 1464 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 SYNJ2O15056 1496 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF11O15085 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 NAIPQ13075 1403 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD3-201ENST00000249440 IQGAP2Q13576 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 HECW1Q76N89 1606 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 TONSLQ96HA7 1378 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 CHD1O14646 1710 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 CEP170Q5SW79 1584 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD3-201ENST00000249440 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD3-201ENST00000249440 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD3-201ENST00000249440 KCNH8Q96L42 1107 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD3-201ENST00000249440 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD3-201ENST00000249440 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 MIA2Q96PC5 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 AKNAQ7Z591 1439 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 NUP160Q12769 1436 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD3-201ENST00000249440 CCER2I3L3R5 266 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD3-201ENST00000249440 ANP32CO43423 234 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD3-201ENST00000249440 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD3-201ENST00000249440 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD3-201ENST00000249440 TRIM52Q96A61 297 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA0556O60303 1618 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 DISP1Q96F81 1524 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 JPH4Q96JJ6 628 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 KDM6BO15054 1643 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 ARID3CA6NKF2 412 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD3-201ENST00000249440 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.07■■□□□ 1.28
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