RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 CEP170Q5SW79 1584 aa37.14■■■■□ 3.54
USF2-201ENST00000222305 NUP160Q12769 1436 aa37.05■■■■□ 3.52
USF2-201ENST00000222305 CEP162Q5TB80 1403 aa37.01■■■■□ 3.52
USF2-201ENST00000222305 IQGAP2Q13576 1575 aa36.99■■■■□ 3.51
USF2-201ENST00000222305 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
USF2-201ENST00000222305 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.96■■■■□ 3.51
USF2-201ENST00000222305 CLIP1P30622 1438 aa36.88■■■■□ 3.5
USF2-201ENST00000222305 OSCARQ8IYS5 282 aa36.82■■■■□ 3.49
USF2-201ENST00000222305 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.81■■■■□ 3.48
USF2-201ENST00000222305 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.77■■■■□ 3.48
USF2-201ENST00000222305 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.77■■■■□ 3.48
USF2-201ENST00000222305 SAMD9Q5K651 1589 aa36.76■■■■□ 3.47
USF2-201ENST00000222305 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.74■■■■□ 3.47
USF2-201ENST00000222305 SHROOM2Q13796 1616 aa36.71■■■■□ 3.47
USF2-201ENST00000222305 JPH4Q96JJ6 628 aa36.67■■■■□ 3.46
USF2-201ENST00000222305 ARAP1Q96P48 1450 aa36.66■■■■□ 3.46
USF2-201ENST00000222305 KIAA0556O60303 1618 aa36.64■■■■□ 3.46
USF2-201ENST00000222305 P3H3Q8IVL6 736 aa36.64■■■■□ 3.46
USF2-201ENST00000222305 DISP1Q96F81 1524 aa36.64■■■■□ 3.46
USF2-201ENST00000222305 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.6■■■■□ 3.45
USF2-201ENST00000222305 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
USF2-201ENST00000222305 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.51■■■■□ 3.44
USF2-201ENST00000222305 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.51■■■■□ 3.43
USF2-201ENST00000222305 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.46■■■■□ 3.43
USF2-201ENST00000222305 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
USF2-201ENST00000222305 FMN1Q68DA7 1419 aa36.36■■■■□ 3.41
USF2-201ENST00000222305 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
USF2-201ENST00000222305 ARHGEF11O15085 1522 aa36.28■■■■□ 3.4
USF2-201ENST00000222305 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 PTPRGP23470 1445 aa36.22■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.21■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.2■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.2■■■■□ 3.39
USF2-201ENST00000222305 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.19■■■■□ 3.38
USF2-201ENST00000222305 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.17■■■■□ 3.38
USF2-201ENST00000222305 HECW1Q76N89 1606 aa36.15■■■■□ 3.38
USF2-201ENST00000222305 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
USF2-201ENST00000222305 ABCA8O94911 1581 aa36.14■■■■□ 3.38
USF2-201ENST00000222305 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.05■■■■□ 3.36
USF2-201ENST00000222305 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
USF2-201ENST00000222305 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.02■■■■□ 3.36
USF2-201ENST00000222305 UACAQ9BZF9 1416 aa36.02■■■■□ 3.36
USF2-201ENST00000222305 TIAM1Q13009 1591 aa36.01■■■■□ 3.36
USF2-201ENST00000222305 APLP2Q06481 763 aa36■■■■□ 3.35
USF2-201ENST00000222305 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
USF2-201ENST00000222305 ARID3CA6NKF2 412 aa35.97■■■■□ 3.35
USF2-201ENST00000222305 ABCC2Q92887 1545 aa35.97■■■■□ 3.35
USF2-201ENST00000222305 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
USF2-201ENST00000222305 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.95■■■■□ 3.34
USF2-201ENST00000222305 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.94■■■■□ 3.34
USF2-201ENST00000222305 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
USF2-201ENST00000222305 MAP3K1Q13233 1512 aa35.94■■■■□ 3.34
USF2-201ENST00000222305 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.93■■■■□ 3.34
USF2-201ENST00000222305 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.89■■■■□ 3.34
USF2-201ENST00000222305 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
USF2-201ENST00000222305 ATP10BO94823 1461 aa35.83■■■■□ 3.33
USF2-201ENST00000222305 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
USF2-201ENST00000222305 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.8■■■■□ 3.32
USF2-201ENST00000222305 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
USF2-201ENST00000222305 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
USF2-201ENST00000222305 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.78■■■■□ 3.32
USF2-201ENST00000222305 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.76■■■■□ 3.31
USF2-201ENST00000222305 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.71■■■■□ 3.31
USF2-201ENST00000222305 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.7■■■■□ 3.31
USF2-201ENST00000222305 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
USF2-201ENST00000222305 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
USF2-201ENST00000222305 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
USF2-201ENST00000222305 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.57■■■■□ 3.28
USF2-201ENST00000222305 KIF14Q15058 1648 aa35.55■■■■□ 3.28
USF2-201ENST00000222305 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
USF2-201ENST00000222305 NCOA2Q15596 1464 aa35.51■■■■□ 3.27
USF2-201ENST00000222305 ASXL2Q76L83 1435 aa35.46■■■■□ 3.27
USF2-201ENST00000222305 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.45■■■■□ 3.27
USF2-201ENST00000222305 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.42■■■■□ 3.26
USF2-201ENST00000222305 MAPKBP1O60336 1514 aa35.39■■■■□ 3.26
USF2-201ENST00000222305 KCNH8Q96L42 1107 aa35.37■■■■□ 3.25
USF2-201ENST00000222305 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.35■■■■□ 3.25
USF2-201ENST00000222305 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.34■■■■□ 3.25
USF2-201ENST00000222305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.252e-6■□□□□ 9.6
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USF2-201ENST00000222305 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.31■■■■□ 3.24
USF2-201ENST00000222305 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.3■■■■□ 3.24
USF2-201ENST00000222305 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.28■■■■□ 3.24
USF2-201ENST00000222305 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
USF2-201ENST00000222305 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.26■■■■□ 3.24
USF2-201ENST00000222305 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
USF2-201ENST00000222305 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
USF2-201ENST00000222305 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.23■■■■□ 3.23
USF2-201ENST00000222305 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.23■■■■□ 3.23
USF2-201ENST00000222305 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.23■■■■□ 3.23
USF2-201ENST00000222305 PREX2Q70Z35 1606 aa35.22■■■■□ 3.23
USF2-201ENST00000222305 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.18■■■■□ 3.22
USF2-201ENST00000222305 DIP2BQ9P265 1576 aa35.14■■■■□ 3.22
USF2-201ENST00000222305 MIA2Q96PC5 1412 aa35.13■■■■□ 3.21
USF2-201ENST00000222305 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.1■■■■□ 3.21
USF2-201ENST00000222305 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
USF2-201ENST00000222305 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.08■■■■□ 3.21
USF2-201ENST00000222305 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.08■■■■□ 3.21
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