RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219551.2

RHBDL1-201, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDL1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-201ENST00000219551 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.96■■■□□ 2.55
RHBDL1-201ENST00000219551 OSCARQ8IYS5 282 aa30.96■■■□□ 2.55
RHBDL1-201ENST00000219551 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.94■■■□□ 2.54
RHBDL1-201ENST00000219551 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.94■■■□□ 2.54
RHBDL1-201ENST00000219551 IQGAP2Q13576 1575 aa30.86■■■□□ 2.53
RHBDL1-201ENST00000219551 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.84■■■□□ 2.53
RHBDL1-201ENST00000219551 JPH4Q96JJ6 628 aa30.76■■■□□ 2.52
RHBDL1-201ENST00000219551 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.71■■■□□ 2.51
RHBDL1-201ENST00000219551 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
RHBDL1-201ENST00000219551 SHROOM2Q13796 1616 aa30.7■■■□□ 2.51
RHBDL1-201ENST00000219551 CEP162Q5TB80 1403 aa30.67■■■□□ 2.5
RHBDL1-201ENST00000219551 CLIP1P30622 1438 aa30.64■■■□□ 2.5
RHBDL1-201ENST00000219551 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
RHBDL1-201ENST00000219551 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.61■■■□□ 2.49
RHBDL1-201ENST00000219551 SAMD9Q5K651 1589 aa30.6■■■□□ 2.49
RHBDL1-201ENST00000219551 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.59■■■□□ 2.49
RHBDL1-201ENST00000219551 DISP1Q96F81 1524 aa30.59■■■□□ 2.49
RHBDL1-201ENST00000219551 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.57■■■□□ 2.48
RHBDL1-201ENST00000219551 KIAA0556O60303 1618 aa30.55■■■□□ 2.48
RHBDL1-201ENST00000219551 P3H3Q8IVL6 736 aa30.52■■■□□ 2.48
RHBDL1-201ENST00000219551 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.49■■■□□ 2.47
RHBDL1-201ENST00000219551 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.45■■■□□ 2.47
RHBDL1-201ENST00000219551 ARAP1Q96P48 1450 aa30.44■■■□□ 2.46
RHBDL1-201ENST00000219551 ARHGEF11O15085 1522 aa30.41■■■□□ 2.46
RHBDL1-201ENST00000219551 PTPRGP23470 1445 aa30.36■■■□□ 2.45
RHBDL1-201ENST00000219551 FMN1Q68DA7 1419 aa30.33■■■□□ 2.45
RHBDL1-201ENST00000219551 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
RHBDL1-201ENST00000219551 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.32■■■□□ 2.44
RHBDL1-201ENST00000219551 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.32■■■□□ 2.44
RHBDL1-201ENST00000219551 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.32■■■□□ 2.44
RHBDL1-201ENST00000219551 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.26■■■□□ 2.43
RHBDL1-201ENST00000219551 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.26■■■□□ 2.43
RHBDL1-201ENST00000219551 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.18■■■□□ 2.42
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCA8O94911 1581 aa30.17■■■□□ 2.42
RHBDL1-201ENST00000219551 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.17■■■□□ 2.42
RHBDL1-201ENST00000219551 UACAQ9BZF9 1416 aa30.17■■■□□ 2.42
RHBDL1-201ENST00000219551 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.16■■■□□ 2.42
RHBDL1-201ENST00000219551 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
RHBDL1-201ENST00000219551 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.12■■■□□ 2.41
RHBDL1-201ENST00000219551 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.11■■■□□ 2.41
RHBDL1-201ENST00000219551 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
RHBDL1-201ENST00000219551 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.1■■■□□ 2.41
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCC2Q92887 1545 aa30.08■■■□□ 2.41
RHBDL1-201ENST00000219551 HECW1Q76N89 1606 aa30.08■■■□□ 2.41
RHBDL1-201ENST00000219551 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RHBDL1-201ENST00000219551 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.02■■■□□ 2.4
RHBDL1-201ENST00000219551 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
RHBDL1-201ENST00000219551 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.98■■■□□ 2.39
RHBDL1-201ENST00000219551 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.96■■■□□ 2.39
RHBDL1-201ENST00000219551 APLP2Q06481 763 aa29.95■■■□□ 2.39
RHBDL1-201ENST00000219551 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.95■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 ARID3CA6NKF2 412 aa29.94■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 ATP10BO94823 1461 aa29.94■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 MAP3K1Q13233 1512 aa29.92■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
RHBDL1-201ENST00000219551 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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RHBDL1-201ENST00000219551 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
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RHBDL1-201ENST00000219551 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
RHBDL1-201ENST00000219551 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.75■■■□□ 2.35
RHBDL1-201ENST00000219551 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.74■■■□□ 2.35
RHBDL1-201ENST00000219551 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.73■■■□□ 2.35
RHBDL1-201ENST00000219551 MAPKBP1O60336 1514 aa29.71■■■□□ 2.35
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RHBDL1-201ENST00000219551 ASXL2Q76L83 1435 aa29.7■■■□□ 2.35
RHBDL1-201ENST00000219551 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.69■■■□□ 2.34
RHBDL1-201ENST00000219551 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.67■■■□□ 2.34
RHBDL1-201ENST00000219551 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
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RHBDL1-201ENST00000219551 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.43■■■□□ 2.3
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RHBDL1-201ENST00000219551 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.35■■■□□ 2.29
RHBDL1-201ENST00000219551 PLCH2O75038 1416 aa29.33■■■□□ 2.29
RHBDL1-201ENST00000219551 CD109Q6YHK3 1445 aa29.33■■■□□ 2.29
RHBDL1-201ENST00000219551 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.33■■■□□ 2.29
RHBDL1-201ENST00000219551 PREX2Q70Z35 1606 aa29.32■■■□□ 2.28
RHBDL1-201ENST00000219551 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.3■■■□□ 2.28
RHBDL1-201ENST00000219551 MIA2Q96PC5 1412 aa29.3■■■□□ 2.28
RHBDL1-201ENST00000219551 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
RHBDL1-201ENST00000219551 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.29■■■□□ 2.28
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