RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
NME4-201ENST00000219479 CUL7Q14999 1698 aa37.48■■■■□ 3.59
NME4-201ENST00000219479 IGF1RP08069 1367 aa37.46■■■■□ 3.59
NME4-201ENST00000219479 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.46■■■■□ 3.59
NME4-201ENST00000219479 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.45■■■■□ 3.59
NME4-201ENST00000219479 KIF27Q86VH2 1401 aa37.44■■■■□ 3.58
NME4-201ENST00000219479 MAPKBP1O60336 1514 aa37.42■■■■□ 3.58
NME4-201ENST00000219479 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.4■■■■□ 3.58
NME4-201ENST00000219479 DIP2BQ9P265 1576 aa37.35■■■■□ 3.57
NME4-201ENST00000219479 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.33■■■■□ 3.57
NME4-201ENST00000219479 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.32■■■■□ 3.56
NME4-201ENST00000219479 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.2■■■■□ 3.55
NME4-201ENST00000219479 TSPOAP1O95153 1857 aa37.13■■■■□ 3.53
NME4-201ENST00000219479 PTPRGP23470 1445 aa37.12■■■■□ 3.53
NME4-201ENST00000219479 IQGAP2Q13576 1575 aa37.09■■■■□ 3.53
NME4-201ENST00000219479 KDM6BO15054 1643 aa37.07■■■■□ 3.53
NME4-201ENST00000219479 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.05■■■■□ 3.52
NME4-201ENST00000219479 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.04■■■■□ 3.52
NME4-201ENST00000219479 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
NME4-201ENST00000219479 ABCC2Q92887 1545 aa37■■■■□ 3.51
NME4-201ENST00000219479 DISP1Q96F81 1524 aa36.93■■■■□ 3.5
NME4-201ENST00000219479 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.91■■■■□ 3.5
NME4-201ENST00000219479 ASXL2Q76L83 1435 aa36.9■■■■□ 3.5
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NME4-201ENST00000219479 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.87■■■■□ 3.49
NME4-201ENST00000219479 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.86■■■■□ 3.49
NME4-201ENST00000219479 GLI2P10070 1586 aa36.86■■■■□ 3.49
NME4-201ENST00000219479 UACAQ9BZF9 1416 aa36.85■■■■□ 3.49
NME4-201ENST00000219479 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.84■■■■□ 3.49
NME4-201ENST00000219479 KIAA0556O60303 1618 aa36.78■■■■□ 3.48
NME4-201ENST00000219479 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.77■■■■□ 3.48
NME4-201ENST00000219479 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.75■■■■□ 3.47
NME4-201ENST00000219479 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
NME4-201ENST00000219479 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
NME4-201ENST00000219479 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.68■■■■□ 3.46
NME4-201ENST00000219479 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.67■■■■□ 3.46
NME4-201ENST00000219479 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
NME4-201ENST00000219479 PRXQ9BXM0 1461 aa36.54■■■■□ 3.44
NME4-201ENST00000219479 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.53■■■■□ 3.44
NME4-201ENST00000219479 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.5■■■■□ 3.43
NME4-201ENST00000219479 GOLGA3Q08378 1498 aa36.48■■■■□ 3.43
NME4-201ENST00000219479 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.47■■■■□ 3.43
NME4-201ENST00000219479 ADGRL1O94910 1474 aa36.46■■■■□ 3.43
NME4-201ENST00000219479 ABCA8O94911 1581 aa36.44■■■■□ 3.42
NME4-201ENST00000219479 EEA1Q15075 1411 aa36.42■■■■□ 3.42
NME4-201ENST00000219479 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.36■■■■□ 3.41
NME4-201ENST00000219479 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
NME4-201ENST00000219479 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.29■■■■□ 3.4
NME4-201ENST00000219479 CD109Q6YHK3 1445 aa36.28■■■■□ 3.4
NME4-201ENST00000219479 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.25■■■■□ 3.39
NME4-201ENST00000219479 KCNH8Q96L42 1107 aa36.24■■■■□ 3.39
NME4-201ENST00000219479 SAMD9Q5K651 1589 aa36.1■■■■□ 3.37
NME4-201ENST00000219479 P3H3Q8IVL6 736 aa36.1■■■■□ 3.37
NME4-201ENST00000219479 ATP10BO94823 1461 aa36.1■■■■□ 3.37
NME4-201ENST00000219479 ARID3CA6NKF2 412 aa36.09■■■■□ 3.37
NME4-201ENST00000219479 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.07■■■■□ 3.37
NME4-201ENST00000219479 KIF21BO75037 1637 aa36.04■■■■□ 3.36
NME4-201ENST00000219479 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.02■■■■□ 3.36
NME4-201ENST00000219479 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
NME4-201ENST00000219479 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.02■■■■□ 3.36
NME4-201ENST00000219479 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.01■■■■□ 3.36
NME4-201ENST00000219479 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.93■■■■□ 3.34
NME4-201ENST00000219479 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
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NME4-201ENST00000219479 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
NME4-201ENST00000219479 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.86■■■■□ 3.33
NME4-201ENST00000219479 NEO1Q92859 1461 aa35.82■■■■□ 3.32
NME4-201ENST00000219479 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.82■■■■□ 3.32
NME4-201ENST00000219479 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.78■■■■□ 3.32
NME4-201ENST00000219479 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
NME4-201ENST00000219479 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
NME4-201ENST00000219479 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.75■■■■□ 3.31
NME4-201ENST00000219479 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.75■■■■□ 3.31
NME4-201ENST00000219479 RAPGEF3O95398 923 aa35.75■■■■□ 3.31
NME4-201ENST00000219479 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.65■■■■□ 3.3
NME4-201ENST00000219479 PTPRMP28827 1452 aa35.65■■■■□ 3.3
NME4-201ENST00000219479 RICTORQ6R327 1708 aa35.62■■■■□ 3.29
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.6■■■■□ 3.29
NME4-201ENST00000219479 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.291e-6■■■□□ 18.6
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NME4-201ENST00000219479 MADDQ8WXG6 1647 aa35.58■■■■□ 3.29
NME4-201ENST00000219479 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.58■■■■□ 3.29
NME4-201ENST00000219479 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.57■■■■□ 3.28
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NME4-201ENST00000219479 AKNAQ7Z591 1439 aa35.54■■■■□ 3.28
NME4-201ENST00000219479 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
NME4-201ENST00000219479 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.48■■■■□ 3.27
NME4-201ENST00000219479 FMN1Q68DA7 1419 aa35.48■■■■□ 3.27
NME4-201ENST00000219479 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.46■■■■□ 3.27
NME4-201ENST00000219479 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
NME4-201ENST00000219479 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
NME4-201ENST00000219479 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
NME4-201ENST00000219479 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.4■■■■□ 3.26
NME4-201ENST00000219479 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.38■■■■□ 3.25
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NME4-201ENST00000219479 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.35■■■■□ 3.25
NME4-201ENST00000219479 HECW1Q76N89 1606 aa35.35■■■■□ 3.25
NME4-201ENST00000219479 PLCH2O75038 1416 aa35.32■■■■□ 3.24
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