RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217402.2

CHMP4B-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4B, Length 1,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4B-201ENST00000217402 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.41■■■■■ 4.7
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CHMP4B-201ENST00000217402 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.37■■■■■ 4.69
CHMP4B-201ENST00000217402 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.36■■■■■ 4.69
CHMP4B-201ENST00000217402 IQGAP2Q13576 1575 aa44.29■■■■■ 4.68
CHMP4B-201ENST00000217402 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.18■■■■■ 4.66
CHMP4B-201ENST00000217402 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
CHMP4B-201ENST00000217402 JPH4Q96JJ6 628 aa44.13■■■■■ 4.65
CHMP4B-201ENST00000217402 SHROOM2Q13796 1616 aa44.1■■■■■ 4.65
CHMP4B-201ENST00000217402 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.04■■■■■ 4.64
CHMP4B-201ENST00000217402 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
CHMP4B-201ENST00000217402 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.93■■■■■ 4.62
CHMP4B-201ENST00000217402 DISP1Q96F81 1524 aa43.91■■■■■ 4.62
CHMP4B-201ENST00000217402 CEP162Q5TB80 1403 aa43.88■■■■■ 4.62
CHMP4B-201ENST00000217402 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.87■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 KIAA0556O60303 1618 aa43.86■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 SAMD9Q5K651 1589 aa43.86■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 CLIP1P30622 1438 aa43.85■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGEF11O15085 1522 aa43.84■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 P3H3Q8IVL6 736 aa43.83■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.82■■■■■ 4.61
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.79■■■■■ 4.6
CHMP4B-201ENST00000217402 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.74■■■■■ 4.59
CHMP4B-201ENST00000217402 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.74■■■■■ 4.59
CHMP4B-201ENST00000217402 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.74■■■■■ 4.59
CHMP4B-201ENST00000217402 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.73■■■■■ 4.59
CHMP4B-201ENST00000217402 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.72■■■■■ 4.59
CHMP4B-201ENST00000217402 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
CHMP4B-201ENST00000217402 ARAP1Q96P48 1450 aa43.6■■■■■ 4.57
CHMP4B-201ENST00000217402 PTPRGP23470 1445 aa43.57■■■■■ 4.57
CHMP4B-201ENST00000217402 FMN1Q68DA7 1419 aa43.41■■■■■ 4.54
CHMP4B-201ENST00000217402 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.41■■■■■ 4.54
CHMP4B-201ENST00000217402 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.37■■■■■ 4.53
CHMP4B-201ENST00000217402 UACAQ9BZF9 1416 aa43.31■■■■■ 4.52
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCA8O94911 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
CHMP4B-201ENST00000217402 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.27■■■■■ 4.52
CHMP4B-201ENST00000217402 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.26■■■■■ 4.52
CHMP4B-201ENST00000217402 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCC2Q92887 1545 aa43.22■■■■■ 4.51
CHMP4B-201ENST00000217402 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.21■■■■■ 4.51
CHMP4B-201ENST00000217402 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
CHMP4B-201ENST00000217402 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.17■■■■■ 4.5
CHMP4B-201ENST00000217402 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.17■■■■■ 4.5
CHMP4B-201ENST00000217402 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.14■■■■■ 4.5
CHMP4B-201ENST00000217402 HECW1Q76N89 1606 aa43.13■■■■■ 4.5
CHMP4B-201ENST00000217402 ARID3CA6NKF2 412 aa43.13■■■■■ 4.49
CHMP4B-201ENST00000217402 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.49
CHMP4B-201ENST00000217402 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
CHMP4B-201ENST00000217402 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.98■■■■■ 4.47
CHMP4B-201ENST00000217402 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.97■■■■■ 4.47
CHMP4B-201ENST00000217402 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CHMP4B-201ENST00000217402 ATP10BO94823 1461 aa42.96■■■■■ 4.47
CHMP4B-201ENST00000217402 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CHMP4B-201ENST00000217402 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.46
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CHMP4B-201ENST00000217402 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.9■■■■■ 4.46
CHMP4B-201ENST00000217402 APLP2Q06481 763 aa42.78■■■■■ 4.44
CHMP4B-201ENST00000217402 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.77■■■■■ 4.44
CHMP4B-201ENST00000217402 TIAM1Q13009 1591 aa42.77■■■■■ 4.44
CHMP4B-201ENST00000217402 ASXL2Q76L83 1435 aa42.72■■■■■ 4.43
CHMP4B-201ENST00000217402 MAPKBP1O60336 1514 aa42.7■■■■■ 4.43
CHMP4B-201ENST00000217402 MAP3K1Q13233 1512 aa42.69■■■■■ 4.42
CHMP4B-201ENST00000217402 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
CHMP4B-201ENST00000217402 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.67■■■■■ 4.42
CHMP4B-201ENST00000217402 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.66■■■■■ 4.42
CHMP4B-201ENST00000217402 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.65■■■■■ 4.42
CHMP4B-201ENST00000217402 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.6■■■■■ 4.41
CHMP4B-201ENST00000217402 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
CHMP4B-201ENST00000217402 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
CHMP4B-201ENST00000217402 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.57■■■■■ 4.4
CHMP4B-201ENST00000217402 KCNH8Q96L42 1107 aa42.54■■■■■ 4.4
CHMP4B-201ENST00000217402 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.53■■■■■ 4.4
CHMP4B-201ENST00000217402 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
CHMP4B-201ENST00000217402 KIF14Q15058 1648 aa42.45■■■■■ 4.39
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.4■■■■■ 4.38
CHMP4B-201ENST00000217402 DIP2BQ9P265 1576 aa42.39■■■■■ 4.38
CHMP4B-201ENST00000217402 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
CHMP4B-201ENST00000217402 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.33■■■■■ 4.37
CHMP4B-201ENST00000217402 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.374e-8■■□□□ 13.3
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CHMP4B-201ENST00000217402 NCOA2Q15596 1464 aa42.31■■■■■ 4.36
CHMP4B-201ENST00000217402 GLI2P10070 1586 aa42.28■■■■■ 4.36
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.27■■■■■ 4.36
CHMP4B-201ENST00000217402 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.26■■■■■ 4.36
CHMP4B-201ENST00000217402 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
CHMP4B-201ENST00000217402 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.18■■■■■ 4.34
CHMP4B-201ENST00000217402 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.16■■■■■ 4.34
CHMP4B-201ENST00000217402 CD109Q6YHK3 1445 aa42.15■■■■■ 4.34
CHMP4B-201ENST00000217402 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.12■■■■■ 4.33
CHMP4B-201ENST00000217402 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.11■■■■■ 4.33
CHMP4B-201ENST00000217402 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
CHMP4B-201ENST00000217402 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.09■■■■■ 4.33
CHMP4B-201ENST00000217402 PREX2Q70Z35 1606 aa42.06■■■■■ 4.32
CHMP4B-201ENST00000217402 PLCH2O75038 1416 aa42.05■■■■■ 4.32
CHMP4B-201ENST00000217402 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.04■■■■■ 4.32
CHMP4B-201ENST00000217402 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.04■■■■■ 4.32
CHMP4B-201ENST00000217402 TSPOAP1O95153 1857 aa42.03■■■■■ 4.32
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.02■■■■■ 4.32
CHMP4B-201ENST00000217402 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42■■■■■ 4.31
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