RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 ANP32CO43423 234 aa25.81■■□□□ 1.72
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM52Q96A61 297 aa25.79■■□□□ 1.72
CGRRF1-201ENST00000216420 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.79■■□□□ 1.72
CGRRF1-201ENST00000216420 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1-201ENST00000216420 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1-201ENST00000216420 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.77■■□□□ 1.72
CGRRF1-201ENST00000216420 MAP3K1Q13233 1512 aa25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1-201ENST00000216420 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1-201ENST00000216420 TIAM1Q13009 1591 aa25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1-201ENST00000216420 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1-201ENST00000216420 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1-201ENST00000216420 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1-201ENST00000216420 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.43■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.42■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF27Q86VH2 1401 aa25.42■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.41■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.4■■□□□ 1.66
CGRRF1-201ENST00000216420 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CGRRF1-201ENST00000216420 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CGRRF1-201ENST00000216420 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.36■■□□□ 1.65
CGRRF1-201ENST00000216420 TONSLQ96HA7 1378 aa25.33■■□□□ 1.64
CGRRF1-201ENST00000216420 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CGRRF1-201ENST00000216420 NCOA2Q15596 1464 aa25.3■■□□□ 1.64
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.29■■□□□ 1.64
CGRRF1-201ENST00000216420 CUX1P39880 1505 aa25.28■■□□□ 1.64
CGRRF1-201ENST00000216420 NBR1Q14596 966 aa25.27■■□□□ 1.64
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 NCAPD3P42695 1498 aa25.26■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.24■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 UACAQ9BZF9 1416 aa25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1-201ENST00000216420 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.2■■□□□ 1.62
CGRRF1-201ENST00000216420 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.19■■□□□ 1.62
CGRRF1-201ENST00000216420 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
CGRRF1-201ENST00000216420 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CGRRF1-201ENST00000216420 HFM1A2PYH4 1435 aa25.14■■□□□ 1.61
CGRRF1-201ENST00000216420 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.12■■□□□ 1.61
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.11■■□□□ 1.61
CGRRF1-201ENST00000216420 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CGRRF1-201ENST00000216420 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 USP35Q9P2H5 1018 aa25.07■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.06■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC184Q52MB2 194 aa25.05■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 IL27Q8NEV9 243 aa25.05■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.03■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.03■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.03■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 IGF1RP08069 1367 aa25.02■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 NCOA1Q15788 1441 aa25.02■■□□□ 1.6
CGRRF1-201ENST00000216420 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.01■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 NAIPQ13075 1403 aa24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC7Q96M83 1385 aa24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 MRS2Q9HD23 443 aa24.95■■□□□ 1.59
CGRRF1-201ENST00000216420 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 HECW1Q76N89 1606 aa24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 PTPRKQ15262 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 FMN1Q68DA7 1419 aa24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 NUDCQ9Y266 331 aa24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 HMGXB3Q12766 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 AKNAQ7Z591 1439 aa24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1-201ENST00000216420 PRDM2Q13029 1718 aa24.89■■□□□ 1.57
CGRRF1-201ENST00000216420 CFTRP13569 1480 aa24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1-201ENST00000216420 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1-201ENST00000216420 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1-201ENST00000216420 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1-201ENST00000216420 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1-201ENST00000216420 NEFMP07197 916 aa24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1-201ENST00000216420 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1-201ENST00000216420 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1-201ENST00000216420 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1-201ENST00000216420 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1-201ENST00000216420 MS4A1P11836 297 aa24.74■■□□□ 1.55
CGRRF1-201ENST00000216420 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.74■■□□□ 1.55
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 BACH2Q9BYV9 841 aa24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1-201ENST00000216420 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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