RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35■■■■□ 3.19
CGRRF1-201ENST00000216420 HRCP23327 699 aa31.32■■■□□ 2.6
CGRRF1-201ENST00000216420 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CGRRF1-201ENST00000216420 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.44■■■□□ 2.46
CGRRF1-201ENST00000216420 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.37■■■□□ 2.45
CGRRF1-201ENST00000216420 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CGRRF1-201ENST00000216420 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.31■■■□□ 2.44
CGRRF1-201ENST00000216420 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CGRRF1-201ENST00000216420 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.21■■■□□ 2.43
CGRRF1-201ENST00000216420 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.19■■■□□ 2.42
CGRRF1-201ENST00000216420 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.86■■■□□ 2.37
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CGRRF1-201ENST00000216420 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CGRRF1-201ENST00000216420 MYT1Q01538 1121 aa29.54■■■□□ 2.32
CGRRF1-201ENST00000216420 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CGRRF1-201ENST00000216420 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.23■■■□□ 2.27
CGRRF1-201ENST00000216420 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CGRRF1-201ENST00000216420 NEUROD1Q13562 356 aa28.66■■■□□ 2.18
CGRRF1-201ENST00000216420 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CGRRF1-201ENST00000216420 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.49■■■□□ 2.15
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC9O60706 1549 aa28.44■■■□□ 2.14
CGRRF1-201ENST00000216420 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.27■■■□□ 2.12
CGRRF1-201ENST00000216420 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM41Q8WV44 630 aa28.23■■■□□ 2.11
CGRRF1-201ENST00000216420 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CGRRF1-201ENST00000216420 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.06■■■□□ 2.08
CGRRF1-201ENST00000216420 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CGRRF1-201ENST00000216420 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CGRRF1-201ENST00000216420 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.61■■■□□ 2.01
CGRRF1-201ENST00000216420 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.5■■□□□ 1.99
CGRRF1-201ENST00000216420 SCRIBQ14160 1630 aa27.49■■□□□ 1.99
CGRRF1-201ENST00000216420 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CGRRF1-201ENST00000216420 MIER1Q8N108 512 aa27.47■■□□□ 1.99
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP162Q5TB80 1403 aa27.33■■□□□ 1.97
CGRRF1-201ENST00000216420 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.31■■□□□ 1.96
CGRRF1-201ENST00000216420 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.26■■□□□ 1.95
CGRRF1-201ENST00000216420 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1-201ENST00000216420 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.22■■□□□ 1.95
CGRRF1-201ENST00000216420 BCL11AQ9H165 835 aa27.2■■□□□ 1.94
CGRRF1-201ENST00000216420 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CGRRF1-201ENST00000216420 WIZO95785 1651 aa27.15■■□□□ 1.94
CGRRF1-201ENST00000216420 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.13■■□□□ 1.93
CGRRF1-201ENST00000216420 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.13■■□□□ 1.93
CGRRF1-201ENST00000216420 EEA1Q15075 1411 aa27.09■■□□□ 1.93
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.99■■□□□ 1.91
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC8Q09428 1581 aa26.93■■□□□ 1.9
CGRRF1-201ENST00000216420 NACADO15069 1562 aa26.91■■□□□ 1.9
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA3Q08378 1498 aa26.89■■□□□ 1.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SOGA1O94964 1423 aa26.85■■□□□ 1.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.85■■□□□ 1.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CGRRF1-201ENST00000216420 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF21BO75037 1637 aa26.69■■□□□ 1.86
CGRRF1-201ENST00000216420 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CGRRF1-201ENST00000216420 SMARCA2P51531 1590 aa26.68■■□□□ 1.86
CGRRF1-201ENST00000216420 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1-201ENST00000216420 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.66■■□□□ 1.86
CGRRF1-201ENST00000216420 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.62■■□□□ 1.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CLIP1P30622 1438 aa26.58■■□□□ 1.85
CGRRF1-201ENST00000216420 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CGRRF1-201ENST00000216420 SMARCA4P51532 1647 aa26.43■■□□□ 1.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CUX2O14529 1486 aa26.42■■□□□ 1.82
CGRRF1-201ENST00000216420 APLP2Q06481 763 aa26.38■■□□□ 1.81
CGRRF1-201ENST00000216420 FKBP8Q14318 412 aa26.35■■□□□ 1.81
CGRRF1-201ENST00000216420 BCANQ96GW7 911 aa26.27■■□□□ 1.8
CGRRF1-201ENST00000216420 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CGRRF1-201ENST00000216420 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.24■■□□□ 1.79
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNH8Q96L42 1107 aa26.24■■□□□ 1.79
CGRRF1-201ENST00000216420 NEFLP07196 543 aa26.23■■□□□ 1.79
CGRRF1-201ENST00000216420 SYNJ1O43426 1573 aa26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1-201ENST00000216420 MSH5O43196 834 aa26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1-201ENST00000216420 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1-201ENST00000216420 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1-201ENST00000216420 CCER2I3L3R5 266 aa26.11■■□□□ 1.77
CGRRF1-201ENST00000216420 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1-201ENST00000216420 MAPKBP1O60336 1514 aa26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1-201ENST00000216420 ARAP1Q96P48 1450 aa26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1-201ENST00000216420 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CGRRF1-201ENST00000216420 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.98■■□□□ 1.75
CGRRF1-201ENST00000216420 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.96■■□□□ 1.75
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR97A6NE52 1622 aa25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1-201ENST00000216420 ITGAEP38570 1179 aa25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1-201ENST00000216420 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1-201ENST00000216420 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1-201ENST00000216420 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.91■■□□□ 1.74
CGRRF1-201ENST00000216420 PRXQ9BXM0 1461 aa25.89■■□□□ 1.73
CGRRF1-201ENST00000216420 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.88■■□□□ 1.73
CGRRF1-201ENST00000216420 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CGRRF1-201ENST00000216420 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.87■■□□□ 1.73
CGRRF1-201ENST00000216420 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
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