RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007390.2

TSR3-201, Transcript of TSR3, acp transferase ribosome maturation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSR3, Length 1,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3-201ENST00000007390 JPH4Q96JJ6 628 aa42.66■■■■■ 4.42
TSR3-201ENST00000007390 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
TSR3-201ENST00000007390 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.62■■■■■ 4.41
TSR3-201ENST00000007390 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
TSR3-201ENST00000007390 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.4■■■■■ 4.38
TSR3-201ENST00000007390 IQGAP2Q13576 1575 aa42.29■■■■■ 4.36
TSR3-201ENST00000007390 PRXQ9BXM0 1461 aa42.17■■■■■ 4.34
TSR3-201ENST00000007390 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.17■■■■■ 4.34
TSR3-201ENST00000007390 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.08■■■■■ 4.33
TSR3-201ENST00000007390 PTPRGP23470 1445 aa42.06■■■■■ 4.32
TSR3-201ENST00000007390 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.06■■■■■ 4.32
TSR3-201ENST00000007390 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.06■■■■■ 4.32
TSR3-201ENST00000007390 DISP1Q96F81 1524 aa42.05■■■■■ 4.32
TSR3-201ENST00000007390 EEA1Q15075 1411 aa41.99■■■■■ 4.31
TSR3-201ENST00000007390 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.99■■■■■ 4.31
TSR3-201ENST00000007390 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.95■■■■■ 4.31
TSR3-201ENST00000007390 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.3
TSR3-201ENST00000007390 MAPKBP1O60336 1514 aa41.93■■■■■ 4.3
TSR3-201ENST00000007390 KIAA0556O60303 1618 aa41.9■■■■■ 4.3
TSR3-201ENST00000007390 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
TSR3-201ENST00000007390 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.81■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 GOLGA3Q08378 1498 aa41.79■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 ABCC2Q92887 1545 aa41.78■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.78■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.78■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 UACAQ9BZF9 1416 aa41.78■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.77■■■■■ 4.28
TSR3-201ENST00000007390 DIP2BQ9P265 1576 aa41.68■■■■■ 4.26
TSR3-201ENST00000007390 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.64■■■■■ 4.26
TSR3-201ENST00000007390 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
TSR3-201ENST00000007390 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.59■■■■■ 4.25
TSR3-201ENST00000007390 KIF21BO75037 1637 aa41.57■■■■■ 4.25
TSR3-201ENST00000007390 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.54■■■■■ 4.24
TSR3-201ENST00000007390 ASXL2Q76L83 1435 aa41.54■■■■■ 4.24
TSR3-201ENST00000007390 ABCA8O94911 1581 aa41.49■■■■■ 4.23
TSR3-201ENST00000007390 SAMD9Q5K651 1589 aa41.48■■■■■ 4.23
TSR3-201ENST00000007390 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
TSR3-201ENST00000007390 GLI2P10070 1586 aa41.39■■■■■ 4.22
TSR3-201ENST00000007390 P3H3Q8IVL6 736 aa41.35■■■■■ 4.21
TSR3-201ENST00000007390 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
TSR3-201ENST00000007390 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.27■■■■■ 4.2
TSR3-201ENST00000007390 TSPOAP1O95153 1857 aa41.23■■■■■ 4.19
TSR3-201ENST00000007390 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.22■■■■■ 4.19
TSR3-201ENST00000007390 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
TSR3-201ENST00000007390 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.17■■■■■ 4.18
TSR3-201ENST00000007390 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.15■■■■■ 4.18
TSR3-201ENST00000007390 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.15■■■■■ 4.18
TSR3-201ENST00000007390 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
TSR3-201ENST00000007390 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
TSR3-201ENST00000007390 ATP10BO94823 1461 aa41.12■■■■■ 4.17
TSR3-201ENST00000007390 KDM6BO15054 1643 aa41.11■■■■■ 4.17
TSR3-201ENST00000007390 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.06■■■■■ 4.16
TSR3-201ENST00000007390 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
TSR3-201ENST00000007390 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.01■■■■■ 4.16
TSR3-201ENST00000007390 ARID3CA6NKF2 412 aa41■■■■■ 4.15
TSR3-201ENST00000007390 KCNH8Q96L42 1107 aa40.96■■■■■ 4.15
TSR3-201ENST00000007390 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.95■■■■■ 4.15
TSR3-201ENST00000007390 CD109Q6YHK3 1445 aa40.92■■■■■ 4.14
TSR3-201ENST00000007390 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.91■■■■■ 4.14
TSR3-201ENST00000007390 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.91■■■■■ 4.14
TSR3-201ENST00000007390 FMN1Q68DA7 1419 aa40.83■■■■■ 4.13
TSR3-201ENST00000007390 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
TSR3-201ENST00000007390 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
TSR3-201ENST00000007390 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
TSR3-201ENST00000007390 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.79■■■■■ 4.12
TSR3-201ENST00000007390 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.69■■■■■ 4.1
TSR3-201ENST00000007390 HECW1Q76N89 1606 aa40.67■■■■■ 4.1
TSR3-201ENST00000007390 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TSR3-201ENST00000007390 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
TSR3-201ENST00000007390 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.58■■■■■ 4.09
TSR3-201ENST00000007390 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.57■■■■■ 4.08
TSR3-201ENST00000007390 NEO1Q92859 1461 aa40.52■■■■■ 4.08
TSR3-201ENST00000007390 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
TSR3-201ENST00000007390 CLIP1P30622 1438 aa40.5■■■■■ 4.07
TSR3-201ENST00000007390 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.076e-6■■■■□ 21.5
TSR3-201ENST00000007390 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.46■■■■■ 4.07
TSR3-201ENST00000007390 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
TSR3-201ENST00000007390 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.44■■■■■ 4.06
TSR3-201ENST00000007390 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
TSR3-201ENST00000007390 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.38■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.38■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.35■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.35■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 FANCAO15360 1455 aa40.33■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.33■■■■■ 4.05
TSR3-201ENST00000007390 AKNAQ7Z591 1439 aa40.28■■■■■ 4.04
TSR3-201ENST00000007390 KIF14Q15058 1648 aa40.27■■■■■ 4.04
TSR3-201ENST00000007390 PLCH2O75038 1416 aa40.27■■■■■ 4.04
TSR3-201ENST00000007390 ADGRL1O94910 1474 aa40.26■■■■■ 4.03
TSR3-201ENST00000007390 RAPGEF3O95398 923 aa40.25■■■■■ 4.03
TSR3-201ENST00000007390 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.25■■■■■ 4.03
TSR3-201ENST00000007390 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
TSR3-201ENST00000007390 CEP162Q5TB80 1403 aa40.21■■■■■ 4.03
TSR3-201ENST00000007390 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.17■■■■■ 4.02
TSR3-201ENST00000007390 RICTORQ6R327 1708 aa40.14■■■■■ 4.02
TSR3-201ENST00000007390 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.09■■■■■ 4.01
TSR3-201ENST00000007390 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.06■■■■■ 4
TSR3-201ENST00000007390 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.04■■■■■ 4
TSR3-201ENST00000007390 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.02■■■■■ 4
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