RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	CEP3	P40969	608 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	PFD1	P46988	109 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SEC5	P89102	971 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	TAF11	Q04226	346 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	AIM33	Q04516	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	GAD1	Q04792	585 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CRF1	Q04930	467 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YCG1	Q06680	1035 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	ATG9	Q12142	997 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SPO11	P23179	398 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	MRPL25	P23369	157 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	AGP1	P25376	633 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	FUN30	P31380	1131 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	ISC10	P32645	267 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	NPL6	P32832	435 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YBR197C	P38306	217 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CCC2	P38995	1004 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YEL076C	P39971	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	LAM5	P43560	674 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SPO74	P45819	413 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CBK1	P53894	756 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YKU80	Q04437	629 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CSM3	Q04659	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	REX3	Q12090	404 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SFI1	Q12369	946 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	DBF4	P32325	704 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	ATG19	P35193	415 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	RPC25	P35718	212 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	HSM3	P38348	480 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	PAN5	P38787	379 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YHR131C	P38835	850 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	DSS1	P39112	969 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SPC72	P39723	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	AXL1	P40851	1208 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	ERR3	P42222	437 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	NIT2	P47016	307 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	HFM1	P51979	1187 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	GUP1	P53154	560 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YAP7	Q08182	245 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
VMA13	YPR036W	HMI1	Q12039	706 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	MDM12	Q92328	271 aa		5.74	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	GCR1	P07261	785 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	MSS18	P08593	268 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SPO12	P17123	173 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CKA2	P19454	339 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	RPC53	P25441	422 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	LYP1	P32487	611 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	MKK2	P32491	506 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	TFB1	P32776	642 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SMC1	P32908	1225 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SPC29	P33419	253 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	VBA5	P36172	582 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	GAA1	P39012	614 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	PSY2	P40164	858 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	TOK1	P40310	691 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	AIM20	P40451	204 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	FIG4	P42837	879 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	AAD14	P42884	376 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	IRC6	P43615	237 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	EEB1	Q02891	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	ARA2	Q04212	335 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	VPS38	Q05919	439 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	YPR084W	Q06821	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	CBP1	P07252	654 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	PDX1	P16451	410 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	GSY1	P23337	708 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	FTH1	P38310	465 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	EFM2	P38347	419 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	SUL1	P38359	859 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	VFA1	P40080	203 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VMA13	YPR036W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49

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