Protein–RNA interactions for Protein: P0CX17

YLR464W, Putative uncharacterized protein YLR464W, yeastyeast

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR464WP0CX17 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.77■■□□□ 1.24
YLR464WP0CX17 NSR1YGR159C 1245 nt22.54■■□□□ 1.2
YLR464WP0CX17 NOP1YDL014W 984 nt22.04■■□□□ 1.12
YLR464WP0CX17 YKL036CYKL036C 393 nt20.38■□□□□ 0.85
YLR464WP0CX17 MDJ1YFL016C 1536 nt20.13■□□□□ 0.81
YLR464WP0CX17 Q0297Q0297 156 nt19.32■□□□□ 0.68
YLR464WP0CX17 SRX1YKL086W 384 nt19.29■□□□□ 0.68
YLR464WP0CX17 YJL027CYJL027C 417 nt19.06■□□□□ 0.64
YLR464WP0CX17 SCS3YGL126W 1143 nt18.6■□□□□ 0.57
YLR464WP0CX17 YCR051WYCR051W 669 nt18.35■□□□□ 0.53
YLR464WP0CX17 DBP2YNL112W 1641 nt17.8■□□□□ 0.44
YLR464WP0CX17 YOL085CYOL085C 342 nt17.7■□□□□ 0.42
YLR464WP0CX17 PKP1YIL042C 1185 nt17.5■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR464WP0CX17 RPP1BYDL130W 321 nt17.35■□□□□ 0.37
YLR464WP0CX17 CCC1YLR220W 969 nt17.35■□□□□ 0.37
YLR464WP0CX17 YBR190WYBR190W 312 nt17.06■□□□□ 0.32
YLR464WP0CX17 RTC3YHR087W 336 nt16.74■□□□□ 0.27
YLR464WP0CX17 SCJ1YMR214W 1134 nt16.68■□□□□ 0.26
YLR464WP0CX17 RVS167YDR388W 1449 nt16.63■□□□□ 0.25
YLR464WP0CX17 PET122YER153C 765 nt16.63■□□□□ 0.25
YLR464WP0CX17 ATS1YAL020C 1002 nt16.62■□□□□ 0.25
YLR464WP0CX17 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.54■□□□□ 0.24
YLR464WP0CX17 SCR1SCR1 522 nt16.37■□□□□ 0.21
YLR464WP0CX17 RRN5YLR141W 1092 nt16.15■□□□□ 0.18
YLR464WP0CX17 SHR5YOL110W 714 nt16.09■□□□□ 0.17
YLR464WP0CX17 YDJ1YNL064C 1230 nt15.94■□□□□ 0.14
YLR464WP0CX17 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.83■□□□□ 0.12
YLR464WP0CX17 RSB1YOR049C 1065 nt15.8■□□□□ 0.12
YLR464WP0CX17 DEP1YAL013W 1218 nt15.73■□□□□ 0.11
YLR464WP0CX17 URN1YPR152C 1398 nt15.68■□□□□ 0.1
YLR464WP0CX17 GAR1YHR089C 618 nt15.67■□□□□ 0.1
YLR464WP0CX17 PUT4YOR348C 1884 nt15.54■□□□□ 0.08
YLR464WP0CX17 OPI9YLR338W 858 nt15.41■□□□□ 0.06
YLR464WP0CX17 PST2YDR032C 597 nt15.4■□□□□ 0.06
YLR464WP0CX17 YNL208WYNL208W 600 nt15.38■□□□□ 0.05
YLR464WP0CX17 SAH1YER043C 1350 nt15.37■□□□□ 0.05
YLR464WP0CX17 RPN10YHR200W 807 nt15.35■□□□□ 0.05
YLR464WP0CX17 ARE1YCR048W 1833 nt15.29■□□□□ 0.04
YLR464WP0CX17 TIR1YER011W 765 nt15.11■□□□□ 0.01
YLR464WP0CX17 POA1YBR022W 534 nt15.09■□□□□ 0.01
YLR464WP0CX17 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.08■□□□□ 0
YLR464WP0CX17 SSA1YAL005C 1929 nt14.98□□□□□ -0.01
YLR464WP0CX17 YJR018WYJR018W 363 nt14.93□□□□□ -0.02
YLR464WP0CX17 PUN1YLR414C 792 nt14.93□□□□□ -0.02
YLR464WP0CX17 SRB2YHR041C 633 nt14.82□□□□□ -0.04
YLR464WP0CX17 PTC2YER089C 1395 nt14.82□□□□□ -0.04
YLR464WP0CX17 SHU1YHL006C 453 nt14.81□□□□□ -0.04
YLR464WP0CX17 YJR120WYJR120W 351 nt14.78□□□□□ -0.04
YLR464WP0CX17 YKL097CYKL097C 411 nt14.77□□□□□ -0.05
YLR464WP0CX17 BUD23YCR047C 828 nt14.74□□□□□ -0.05
YLR464WP0CX17 BSC6YOL137W 1494 nt14.74□□□□□ -0.05
YLR464WP0CX17 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.63□□□□□ -0.07
YLR464WP0CX17 RPP2BYDR382W 333 nt14.58□□□□□ -0.08
YLR464WP0CX17 NAB2YGL122C 1578 nt14.57□□□□□ -0.08
YLR464WP0CX17 WWM1YFL010C 636 nt14.49□□□□□ -0.09
YLR464WP0CX17 FIS1YIL065C 468 nt14.43□□□□□ -0.1
YLR464WP0CX17 SSA3YBL075C 1950 nt14.43□□□□□ -0.1
YLR464WP0CX17 FPR4YLR449W 1179 nt14.42□□□□□ -0.1
YLR464WP0CX17 DAL1YIR027C 1383 nt14.4□□□□□ -0.1
YLR464WP0CX17 INM2YDR287W 879 nt14.35□□□□□ -0.11
YLR464WP0CX17 MNP1YGL068W 585 nt14.32□□□□□ -0.12
YLR464WP0CX17 HOM6YJR139C 1080 nt14.32□□□□□ -0.12
YLR464WP0CX17 BDH2YAL061W 1254 nt14.32□□□□□ -0.12
YLR464WP0CX17 YGR021WYGR021W 873 nt14.3□□□□□ -0.12
YLR464WP0CX17 PHO4YFR034C 939 nt14.29□□□□□ -0.12
YLR464WP0CX17 YBL100CYBL100C 315 nt14.27□□□□□ -0.13
YLR464WP0CX17 YOR139CYOR139C 393 nt14.23□□□□□ -0.13
YLR464WP0CX17 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.17□□□□□ -0.14
YLR464WP0CX17 RKM5YLR137W 1104 nt14.11□□□□□ -0.15
YLR464WP0CX17 FUN26YAL022C 1554 nt14.1□□□□□ -0.15
YLR464WP0CX17 LSM3YLR438C-A 270 nt14.1□□□□□ -0.15
YLR464WP0CX17 NPL3YDR432W 1245 nt14.05□□□□□ -0.16
YLR464WP0CX17 TRM9YML014W 840 nt14.04□□□□□ -0.16
YLR464WP0CX17 SPT5YML010W 3192 nt14.04□□□□□ -0.16
YLR464WP0CX17 YPS1YLR120C 1710 nt14□□□□□ -0.17
YLR464WP0CX17 YOL037CYOL037C 354 nt13.97□□□□□ -0.17
YLR464WP0CX17 CCT6YDR188W 1641 nt13.9□□□□□ -0.18
YLR464WP0CX17 YDR095CYDR095C 411 nt13.9□□□□□ -0.18
YLR464WP0CX17 ALF1YNL148C 765 nt13.87□□□□□ -0.19
YLR464WP0CX17 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.85□□□□□ -0.19
YLR464WP0CX17 MEP2YNL142W 1500 nt13.81□□□□□ -0.2
YLR464WP0CX17 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.74□□□□□ -0.21
YLR464WP0CX17 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.74□□□□□ -0.21
YLR464WP0CX17 YLR281CYLR281C 468 nt13.69□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 SIS1YNL007C 1059 nt13.68□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.67□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.67□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.67□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.67□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.67□□□□□ -0.22
YLR464WP0CX17 DCW1YKL046C 1350 nt13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms