Protein–RNA interactions for Protein: Q12734

CSR2, Transcription factor CSR2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSR2Q12734 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.02■■□□□ 1.44
CSR2Q12734 NOP1YDL014W 984 nt23.52■■□□□ 1.36
CSR2Q12734 NSR1YGR159C 1245 nt23.32■■□□□ 1.32
CSR2Q12734 YKL036CYKL036C 393 nt22.28■■□□□ 1.16
CSR2Q12734 YJL027CYJL027C 417 nt20.93■□□□□ 0.94
CSR2Q12734 Q0297Q0297 156 nt20.76■□□□□ 0.91
CSR2Q12734 SCS3YGL126W 1143 nt20.64■□□□□ 0.89
CSR2Q12734 SRX1YKL086W 384 nt20.55■□□□□ 0.88
CSR2Q12734 MDJ1YFL016C 1536 nt20.26■□□□□ 0.83
CSR2Q12734 YCR051WYCR051W 669 nt19.6■□□□□ 0.73
CSR2Q12734 YOL085CYOL085C 342 nt19.27■□□□□ 0.68
CSR2Q12734 SCJ1YMR214W 1134 nt19.16■□□□□ 0.66
CSR2Q12734 PKP1YIL042C 1185 nt18.95■□□□□ 0.62
CSR2Q12734 ATS1YAL020C 1002 nt18.65■□□□□ 0.58
CSR2Q12734 RPP1BYDL130W 321 nt18.64■□□□□ 0.57
CSR2Q12734 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.27■□□□□ 0.52
CSR2Q12734 CCC1YLR220W 969 nt18.15■□□□□ 0.5
CSR2Q12734 DBP2YNL112W 1641 nt18.1■□□□□ 0.49
CSR2Q12734 PET122YER153C 765 nt17.78■□□□□ 0.44
CSR2Q12734 SCR1SCR1 522 nt17.72■□□□□ 0.43
CSR2Q12734 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.48■□□□□ 0.39
CSR2Q12734 RTC3YHR087W 336 nt17.42■□□□□ 0.38
CSR2Q12734 RRN5YLR141W 1092 nt17.32■□□□□ 0.36
CSR2Q12734 RVS167YDR388W 1449 nt17.15■□□□□ 0.34
CSR2Q12734 PST2YDR032C 597 nt17.15■□□□□ 0.34
CSR2Q12734 RSB1YOR049C 1065 nt17.15■□□□□ 0.34
CSR2Q12734 YBR190WYBR190W 312 nt17.06■□□□□ 0.32
CSR2Q12734 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.98■□□□□ 0.31
CSR2Q12734 YDJ1YNL064C 1230 nt16.86■□□□□ 0.29
CSR2Q12734 YKL097CYKL097C 411 nt16.85■□□□□ 0.29
CSR2Q12734 SHR5YOL110W 714 nt16.68■□□□□ 0.26
CSR2Q12734 GAR1YHR089C 618 nt16.47■□□□□ 0.23
CSR2Q12734 SHU1YHL006C 453 nt16.29■□□□□ 0.2
CSR2Q12734 DEP1YAL013W 1218 nt16.09■□□□□ 0.17
CSR2Q12734 YOR139CYOR139C 393 nt16.05■□□□□ 0.16
CSR2Q12734 URN1YPR152C 1398 nt15.89■□□□□ 0.13
CSR2Q12734 TIR1YER011W 765 nt15.87■□□□□ 0.13
CSR2Q12734 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.87■□□□□ 0.13
CSR2Q12734 YNL208WYNL208W 600 nt15.84■□□□□ 0.13
CSR2Q12734 NPL3YDR432W 1245 nt15.76■□□□□ 0.11
CSR2Q12734 RPN10YHR200W 807 nt15.76■□□□□ 0.11
CSR2Q12734 SSA1YAL005C 1929 nt15.56■□□□□ 0.08
CSR2Q12734 OPI9YLR338W 858 nt15.52■□□□□ 0.08
CSR2Q12734 SRB2YHR041C 633 nt15.44■□□□□ 0.06
CSR2Q12734 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.37■□□□□ 0.05
CSR2Q12734 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.37■□□□□ 0.05
CSR2Q12734 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.37■□□□□ 0.05
CSR2Q12734 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.37■□□□□ 0.05
CSR2Q12734 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.37■□□□□ 0.05
CSR2Q12734 MNP1YGL068W 585 nt15.36■□□□□ 0.05
CSR2Q12734 YGR021WYGR021W 873 nt15.32■□□□□ 0.04
CSR2Q12734 YOL037CYOL037C 354 nt15.32■□□□□ 0.04
CSR2Q12734 SAH1YER043C 1350 nt15.32■□□□□ 0.04
CSR2Q12734 HOM6YJR139C 1080 nt15.31■□□□□ 0.04
CSR2Q12734 WWM1YFL010C 636 nt15.28■□□□□ 0.04
CSR2Q12734 YJR018WYJR018W 363 nt15.19■□□□□ 0.02
CSR2Q12734 RKM5YLR137W 1104 nt15.09■□□□□ 0.01
CSR2Q12734 YJR120WYJR120W 351 nt15.08■□□□□ 0
CSR2Q12734 PUN1YLR414C 792 nt15.08■□□□□ 0
CSR2Q12734 PUT4YOR348C 1884 nt15.07■□□□□ 0
CSR2Q12734 MOT3YMR070W 1473 nt15.07■□□□□ 0
CSR2Q12734 BSC6YOL137W 1494 nt15.03■□□□□ -0
CSR2Q12734 RPP2BYDR382W 333 nt15.03■□□□□ -0
CSR2Q12734 PUS2YGL063W 1113 nt15□□□□□ -0.01
CSR2Q12734 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.99□□□□□ -0.01
CSR2Q12734 ARE1YCR048W 1833 nt14.99□□□□□ -0.01
CSR2Q12734 YLR281CYLR281C 468 nt14.9□□□□□ -0.02
CSR2Q12734 SSA3YBL075C 1950 nt14.83□□□□□ -0.04
CSR2Q12734 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.82□□□□□ -0.04
CSR2Q12734 PTC2YER089C 1395 nt14.82□□□□□ -0.04
CSR2Q12734 BDH2YAL061W 1254 nt14.81□□□□□ -0.04
CSR2Q12734 WHI5YOR083W 888 nt14.77□□□□□ -0.05
CSR2Q12734 MRPL8YJL063C 717 nt14.72□□□□□ -0.05
CSR2Q12734 LSM3YLR438C-A 270 nt14.7□□□□□ -0.06
CSR2Q12734 POA1YBR022W 534 nt14.69□□□□□ -0.06
CSR2Q12734 FMP45YDL222C 930 nt14.63□□□□□ -0.07
CSR2Q12734 BUD23YCR047C 828 nt14.55□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 INM2YDR287W 879 nt14.55□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 YPR011CYPR011C 981 nt14.55□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 YCH1YGR203W 447 nt14.53□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 DSK2YMR276W 1122 nt14.53□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 YBL100CYBL100C 315 nt14.53□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 NAB2YGL122C 1578 nt14.52□□□□□ -0.08
CSR2Q12734 FPR4YLR449W 1179 nt14.49□□□□□ -0.09
CSR2Q12734 UBX6YJL048C 1191 nt14.48□□□□□ -0.09
CSR2Q12734 YLR236CYLR236C 324 nt14.47□□□□□ -0.09
CSR2Q12734 DAL1YIR027C 1383 nt14.46□□□□□ -0.1
CSR2Q12734 ADO1YJR105W 1023 nt14.45□□□□□ -0.1
CSR2Q12734 TRM9YML014W 840 nt14.45□□□□□ -0.1
CSR2Q12734 IMP2'YIL154C 1041 nt14.42□□□□□ -0.1
CSR2Q12734 FIS1YIL065C 468 nt14.38□□□□□ -0.11
CSR2Q12734 FUN26YAL022C 1554 nt14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms