Protein–RNA interactions for Protein: Q04659

CSM3, Chromosome segregation in meiosis protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSM3Q04659 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.08■■□□□ 1.29
CSM3Q04659 NSR1YGR159C 1245 nt22.93■■□□□ 1.26
CSM3Q04659 NOP1YDL014W 984 nt22.53■■□□□ 1.2
CSM3Q04659 YKL036CYKL036C 393 nt20.81■□□□□ 0.92
CSM3Q04659 MDJ1YFL016C 1536 nt20.23■□□□□ 0.83
CSM3Q04659 Q0297Q0297 156 nt19.71■□□□□ 0.75
CSM3Q04659 SRX1YKL086W 384 nt19.66■□□□□ 0.74
CSM3Q04659 YJL027CYJL027C 417 nt19.43■□□□□ 0.7
CSM3Q04659 SCS3YGL126W 1143 nt18.92■□□□□ 0.62
CSM3Q04659 YCR051WYCR051W 669 nt18.64■□□□□ 0.57
CSM3Q04659 YOL085CYOL085C 342 nt18.01■□□□□ 0.47
CSM3Q04659 DBP2YNL112W 1641 nt17.93■□□□□ 0.46
CSM3Q04659 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.71■□□□□ 0.43
CSM3Q04659 PKP1YIL042C 1185 nt17.7■□□□□ 0.42
CSM3Q04659 RPP1BYDL130W 321 nt17.68■□□□□ 0.42
CSM3Q04659 CCC1YLR220W 969 nt17.53■□□□□ 0.4
CSM3Q04659 YBR190WYBR190W 312 nt17.3■□□□□ 0.36
CSM3Q04659 ATS1YAL020C 1002 nt16.97■□□□□ 0.31
CSM3Q04659 RVS167YDR388W 1449 nt16.94■□□□□ 0.3
CSM3Q04659 RTC3YHR087W 336 nt16.91■□□□□ 0.3
CSM3Q04659 SCJ1YMR214W 1134 nt16.9■□□□□ 0.3
CSM3Q04659 PET122YER153C 765 nt16.85■□□□□ 0.29
CSM3Q04659 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.79■□□□□ 0.28
CSM3Q04659 SCR1SCR1 522 nt16.75■□□□□ 0.27
CSM3Q04659 RRN5YLR141W 1092 nt16.4■□□□□ 0.22
CSM3Q04659 SHR5YOL110W 714 nt16.34■□□□□ 0.21
CSM3Q04659 YDJ1YNL064C 1230 nt16.26■□□□□ 0.19
CSM3Q04659 RSB1YOR049C 1065 nt16.08■□□□□ 0.16
CSM3Q04659 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.07■□□□□ 0.16
CSM3Q04659 GAR1YHR089C 618 nt15.86■□□□□ 0.13
CSM3Q04659 URN1YPR152C 1398 nt15.84■□□□□ 0.13
CSM3Q04659 DEP1YAL013W 1218 nt15.82■□□□□ 0.12
CSM3Q04659 PST2YDR032C 597 nt15.7■□□□□ 0.1
CSM3Q04659 RPN10YHR200W 807 nt15.66■□□□□ 0.1
CSM3Q04659 YNL208WYNL208W 600 nt15.63■□□□□ 0.09
CSM3Q04659 PUT4YOR348C 1884 nt15.61■□□□□ 0.09
CSM3Q04659 OPI9YLR338W 858 nt15.61■□□□□ 0.09
CSM3Q04659 SAH1YER043C 1350 nt15.46■□□□□ 0.07
CSM3Q04659 ARE1YCR048W 1833 nt15.34■□□□□ 0.05
CSM3Q04659 TIR1YER011W 765 nt15.33■□□□□ 0.04
CSM3Q04659 PUN1YLR414C 792 nt15.18■□□□□ 0.02
CSM3Q04659 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.15■□□□□ 0.02
CSM3Q04659 POA1YBR022W 534 nt15.15■□□□□ 0.02
CSM3Q04659 YJR018WYJR018W 363 nt15.13■□□□□ 0.01
CSM3Q04659 YKL097CYKL097C 411 nt15.12■□□□□ 0.01
CSM3Q04659 SSA1YAL005C 1929 nt15.11■□□□□ 0.01
CSM3Q04659 SHU1YHL006C 453 nt15.03■□□□□ -0
CSM3Q04659 PTC2YER089C 1395 nt14.94□□□□□ -0.02
CSM3Q04659 RPP2BYDR382W 333 nt14.87□□□□□ -0.03
CSM3Q04659 YJR120WYJR120W 351 nt14.84□□□□□ -0.03
CSM3Q04659 BUD23YCR047C 828 nt14.83□□□□□ -0.04
CSM3Q04659 SRB2YHR041C 633 nt14.81□□□□□ -0.04
CSM3Q04659 BSC6YOL137W 1494 nt14.79□□□□□ -0.04
CSM3Q04659 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.77□□□□□ -0.05
CSM3Q04659 NAB2YGL122C 1578 nt14.77□□□□□ -0.05
CSM3Q04659 WWM1YFL010C 636 nt14.65□□□□□ -0.06
CSM3Q04659 YGR021WYGR021W 873 nt14.63□□□□□ -0.07
CSM3Q04659 INM2YDR287W 879 nt14.62□□□□□ -0.07
CSM3Q04659 DAL1YIR027C 1383 nt14.58□□□□□ -0.08
CSM3Q04659 BDH2YAL061W 1254 nt14.56□□□□□ -0.08
CSM3Q04659 HOM6YJR139C 1080 nt14.54□□□□□ -0.08
CSM3Q04659 FPR4YLR449W 1179 nt14.53□□□□□ -0.08
CSM3Q04659 FIS1YIL065C 468 nt14.5□□□□□ -0.09
CSM3Q04659 YOR139CYOR139C 393 nt14.46□□□□□ -0.09
CSM3Q04659 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.45□□□□□ -0.1
CSM3Q04659 MNP1YGL068W 585 nt14.44□□□□□ -0.1
CSM3Q04659 YBL100CYBL100C 315 nt14.44□□□□□ -0.1
CSM3Q04659 PHO4YFR034C 939 nt14.41□□□□□ -0.1
CSM3Q04659 LSM3YLR438C-A 270 nt14.41□□□□□ -0.1
CSM3Q04659 SSA3YBL075C 1950 nt14.41□□□□□ -0.1
CSM3Q04659 NPL3YDR432W 1245 nt14.38□□□□□ -0.11
CSM3Q04659 RKM5YLR137W 1104 nt14.33□□□□□ -0.12
CSM3Q04659 TRM9YML014W 840 nt14.3□□□□□ -0.12
CSM3Q04659 YOL037CYOL037C 354 nt14.29□□□□□ -0.12
CSM3Q04659 FUN26YAL022C 1554 nt14.27□□□□□ -0.12
CSM3Q04659 CCT6YDR188W 1641 nt14.12□□□□□ -0.15
CSM3Q04659 YPS1YLR120C 1710 nt14.12□□□□□ -0.15
CSM3Q04659 ALF1YNL148C 765 nt14.08□□□□□ -0.16
CSM3Q04659 YDR095CYDR095C 411 nt14.04□□□□□ -0.16
CSM3Q04659 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.03□□□□□ -0.16
CSM3Q04659 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.03□□□□□ -0.16
CSM3Q04659 SPT5YML010W 3192 nt13.99□□□□□ -0.17
CSM3Q04659 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.96□□□□□ -0.17
CSM3Q04659 YLR281CYLR281C 468 nt13.94□□□□□ -0.18
CSM3Q04659 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.93□□□□□ -0.18
CSM3Q04659 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.93□□□□□ -0.18
CSM3Q04659 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.93□□□□□ -0.18
CSM3Q04659 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.93□□□□□ -0.18
CSM3Q04659 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.93□□□□□ -0.18
CSM3Q04659 WHI5YOR083W 888 nt13.89□□□□□ -0.19
CSM3Q04659 MEP2YNL142W 1500 nt13.89□□□□□ -0.19
CSM3Q04659 SIS1YNL007C 1059 nt13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms