Protein–RNA interactions for Protein: Q12090

REX3, RNA exonuclease 3, yeastyeast

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REX3Q12090 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.99■□□□□ 0.63
REX3Q12090 NSR1YGR159C 1245 nt18.76■□□□□ 0.59
REX3Q12090 NOP1YDL014W 984 nt18.59■□□□□ 0.57
REX3Q12090 YKL036CYKL036C 393 nt17.19■□□□□ 0.34
REX3Q12090 MDJ1YFL016C 1536 nt16.47■□□□□ 0.23
REX3Q12090 Q0297Q0297 156 nt16.18■□□□□ 0.18
REX3Q12090 SRX1YKL086W 384 nt16.14■□□□□ 0.17
REX3Q12090 YJL027CYJL027C 417 nt16.09■□□□□ 0.17
REX3Q12090 SCS3YGL126W 1143 nt15.62■□□□□ 0.09
REX3Q12090 YCR051WYCR051W 669 nt15.39■□□□□ 0.05
REX3Q12090 YOL085CYOL085C 342 nt14.82□□□□□ -0.04
REX3Q12090 PKP1YIL042C 1185 nt14.59□□□□□ -0.07
REX3Q12090 RPP1BYDL130W 321 nt14.55□□□□□ -0.08
REX3Q12090 DBP2YNL112W 1641 nt14.53□□□□□ -0.08
REX3Q12090 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.48□□□□□ -0.09
REX3Q12090 CCC1YLR220W 969 nt14.42□□□□□ -0.1
REX3Q12090 YBR190WYBR190W 312 nt14.07□□□□□ -0.16
REX3Q12090 SCJ1YMR214W 1134 nt14.05□□□□□ -0.16
REX3Q12090 ATS1YAL020C 1002 nt14.02□□□□□ -0.17
REX3Q12090 RVS167YDR388W 1449 nt13.95□□□□□ -0.18
REX3Q12090 SCR1SCR1 522 nt13.88□□□□□ -0.19
REX3Q12090 RTC3YHR087W 336 nt13.85□□□□□ -0.19
REX3Q12090 PET122YER153C 765 nt13.84□□□□□ -0.19
REX3Q12090 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.77□□□□□ -0.21
REX3Q12090 RRN5YLR141W 1092 nt13.48□□□□□ -0.25
REX3Q12090 SHR5YOL110W 714 nt13.39□□□□□ -0.27
REX3Q12090 SSA3YBL075C 1950 nt13.39□□□□□ -0.27
REX3Q12090 YDJ1YNL064C 1230 nt13.33□□□□□ -0.28
REX3Q12090 RSB1YOR049C 1065 nt13.3□□□□□ -0.28
REX3Q12090 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.2□□□□□ -0.3
REX3Q12090 GAR1YHR089C 618 nt13.03□□□□□ -0.32
REX3Q12090 DEP1YAL013W 1218 nt12.95□□□□□ -0.34
REX3Q12090 URN1YPR152C 1398 nt12.94□□□□□ -0.34
REX3Q12090 PST2YDR032C 597 nt12.92□□□□□ -0.34
REX3Q12090 RPN10YHR200W 807 nt12.89□□□□□ -0.35
REX3Q12090 YNL208WYNL208W 600 nt12.81□□□□□ -0.36
REX3Q12090 Q0182Q0182 405 nt12.72□□□□□ -0.37
REX3Q12090 OPI9YLR338W 858 nt12.7□□□□□ -0.38
REX3Q12090 TIR1YER011W 765 nt12.58□□□□□ -0.4
REX3Q12090 YKL097CYKL097C 411 nt12.58□□□□□ -0.4
REX3Q12090 PUT4YOR348C 1884 nt12.58□□□□□ -0.4
REX3Q12090 SAH1YER043C 1350 nt12.57□□□□□ -0.4
REX3Q12090 PUN1YLR414C 792 nt12.4□□□□□ -0.42
REX3Q12090 ARE1YCR048W 1833 nt12.39□□□□□ -0.43
REX3Q12090 SHU1YHL006C 453 nt12.37□□□□□ -0.43
REX3Q12090 YJR018WYJR018W 363 nt12.36□□□□□ -0.43
REX3Q12090 SSA1YAL005C 1929 nt12.32□□□□□ -0.44
REX3Q12090 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.3□□□□□ -0.44
REX3Q12090 POA1YBR022W 534 nt12.27□□□□□ -0.45
REX3Q12090 RPP2BYDR382W 333 nt12.25□□□□□ -0.45
REX3Q12090 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
REX3Q12090 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.16□□□□□ -0.46
REX3Q12090 BUD23YCR047C 828 nt12.1□□□□□ -0.47
REX3Q12090 YGR021WYGR021W 873 nt12.07□□□□□ -0.48
REX3Q12090 NAB2YGL122C 1578 nt12.03□□□□□ -0.48
REX3Q12090 SRB2YHR041C 633 nt12.01□□□□□ -0.49
REX3Q12090 WWM1YFL010C 636 nt12□□□□□ -0.49
REX3Q12090 YJR120WYJR120W 351 nt12□□□□□ -0.49
REX3Q12090 NPL3YDR432W 1245 nt11.96□□□□□ -0.49
REX3Q12090 BSC6YOL137W 1494 nt11.95□□□□□ -0.5
REX3Q12090 INM2YDR287W 879 nt11.95□□□□□ -0.5
REX3Q12090 FPR4YLR449W 1179 nt11.93□□□□□ -0.5
REX3Q12090 HOM6YJR139C 1080 nt11.92□□□□□ -0.5
REX3Q12090 BDH2YAL061W 1254 nt11.92□□□□□ -0.5
REX3Q12090 YOR139CYOR139C 393 nt11.9□□□□□ -0.5
REX3Q12090 DAL1YIR027C 1383 nt11.89□□□□□ -0.51
REX3Q12090 MOT3YMR070W 1473 nt11.89□□□□□ -0.51
REX3Q12090 MNP1YGL068W 585 nt11.87□□□□□ -0.51
REX3Q12090 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.86□□□□□ -0.51
REX3Q12090 FPS1YLL043W 2010 nt11.84□□□□□ -0.51
REX3Q12090 YBL100CYBL100C 315 nt11.82□□□□□ -0.52
REX3Q12090 YOL037CYOL037C 354 nt11.82□□□□□ -0.52
REX3Q12090 LSM3YLR438C-A 270 nt11.81□□□□□ -0.52
REX3Q12090 RKM5YLR137W 1104 nt11.78□□□□□ -0.52
REX3Q12090 FIS1YIL065C 468 nt11.75□□□□□ -0.53
REX3Q12090 PHO4YFR034C 939 nt11.74□□□□□ -0.53
REX3Q12090 TRM9YML014W 840 nt11.74□□□□□ -0.53
REX3Q12090 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
REX3Q12090 FUN26YAL022C 1554 nt11.67□□□□□ -0.54
REX3Q12090 PAC11YDR488C 1602 nt11.6□□□□□ -0.55
REX3Q12090 ALF1YNL148C 765 nt11.58□□□□□ -0.56
REX3Q12090 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.54□□□□□ -0.56
REX3Q12090 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.54□□□□□ -0.56
REX3Q12090 CCT6YDR188W 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
REX3Q12090 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.48□□□□□ -0.57
REX3Q12090 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.48□□□□□ -0.57
REX3Q12090 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.48□□□□□ -0.57
REX3Q12090 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.48□□□□□ -0.57
REX3Q12090 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.48□□□□□ -0.57
REX3Q12090 YLR281CYLR281C 468 nt11.46□□□□□ -0.57
REX3Q12090 YPS1YLR120C 1710 nt11.44□□□□□ -0.58
REX3Q12090 PUS2YGL063W 1113 nt11.44□□□□□ -0.58
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