RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	COQ5	P49017	307 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YGL140C	P53120	1219 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TGL2	P54857	326 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TRE1	Q08919	783 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	AFT2	Q08957	416 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ECM3	Q99252	613 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PPH22	P23595	377 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SRB2	P34162	210 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SLD2	P34252	453 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	CSG2	P35206	410 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PXL1	P36166	706 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	DSE1	P40077	573 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	APC11	Q12157	165 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	LIP5	P32875	414 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YKL097C	P34245	136 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	DYS1	P38791	387 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PIK1	P39104	1066 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	STU2	P46675	888 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	AIM39	Q08223	395 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	THI21	Q08975	551 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SAM3	Q08986	587 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	CHS1	P08004	1131 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	GPA1	P08539	472 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	KIN3	P22209	435 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TFB1	P32776	642 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YEL1	P34225	687 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	FIG4	P42837	879 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ZAP1	P47043	880 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	NNF1	P47149	201 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PPN1	Q04119	674 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	EAF1	Q06337	982 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	HMI1	Q12039	706 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YRR1	Q12172	810 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SPO11	P23179	398 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PTC4	P38089	393 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PCL10	P53124	433 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TPK1	P06244	397 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	NDI1	P32340	513 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ELM1	P32801	640 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	MIC60	P36112	540 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	AGP2	P38090	596 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	LYS9	P38999	446 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	HEM14	P40012	539 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	LCB2	P40970	561 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	FET5	P43561	622 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ESBP6	P53918	673 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	ADI1	Q03677	179 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SIL1	Q08199	421 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	MSF1	P08425	469 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	DBF4	P32325	704 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YKL151C	P36059	337 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YAP5	P40574	245 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YGR237C	P50089	785 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RSC4	Q02206	625 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SIZ1	Q04195	904 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	HRD3	Q05787	833 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	CCP1	P00431	361 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PDR1	P12383	1068 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	DAL2	P25335	343 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TRK2	P28584	889 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	TFA2	P36145	328 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	LAM1	P38851	1228 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	EXO1	P39875	702 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SPC105	P53148	917 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	BNA5	Q05979	453 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	OPT2	Q06593	877 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	PMS1	P14242	873 aa		2.66	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	SWE1	P32944	819 aa		2.66	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	RPC25	P35718	212 aa		2.66	□□□□□ -1.98
FKS3	YMR306W	STL1	P39932	569 aa		2.66	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms