Protein–RNA interactions for Protein: Q04119

PPN1, Endopolyphosphatase, yeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPN1	Q04119	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		20.54	■□□□□ 0.88
PPN1	Q04119	NSR1	YGR159C	1245 nt		20.33	■□□□□ 0.85
PPN1	Q04119	NOP1	YDL014W	984 nt		20.1	■□□□□ 0.81
PPN1	Q04119	YKL036C	YKL036C	393 nt		18.63	■□□□□ 0.57
PPN1	Q04119	MDJ1	YFL016C	1536 nt		17.84	■□□□□ 0.45
PPN1	Q04119	Q0297	Q0297	156 nt		17.59	■□□□□ 0.41
PPN1	Q04119	SRX1	YKL086W	384 nt		17.52	■□□□□ 0.4
PPN1	Q04119	YJL027C	YJL027C	417 nt		17.42	■□□□□ 0.38
PPN1	Q04119	SCS3	YGL126W	1143 nt		16.98	■□□□□ 0.31
PPN1	Q04119	YCR051W	YCR051W	669 nt		16.63	■□□□□ 0.25
PPN1	Q04119	YOL085C	YOL085C	342 nt		16.11	■□□□□ 0.17
PPN1	Q04119	PKP1	YIL042C	1185 nt		15.82	■□□□□ 0.12
PPN1	Q04119	DBP2	YNL112W	1641 nt		15.82	■□□□□ 0.12
PPN1	Q04119	RPP1B	YDL130W	321 nt		15.79	■□□□□ 0.12
PPN1	Q04119	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		15.73	■□□□□ 0.11
PPN1	Q04119	CCC1	YLR220W	969 nt		15.58	■□□□□ 0.08
PPN1	Q04119	SCJ1	YMR214W	1134 nt		15.29	■□□□□ 0.04
PPN1	Q04119	ATS1	YAL020C	1002 nt		15.24	■□□□□ 0.03
PPN1	Q04119	YBR190W	YBR190W	312 nt		15.24	■□□□□ 0.03
PPN1	Q04119	RVS167	YDR388W	1449 nt		15.03	■□□□□ -0
PPN1	Q04119	PET122	YER153C	765 nt		15.03	■□□□□ -0
PPN1	Q04119	SCR1	SCR1	522 nt		14.99	□□□□□ -0.01
PPN1	Q04119	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		14.94	□□□□□ -0.02
PPN1	Q04119	RTC3	YHR087W	336 nt		14.92	□□□□□ -0.02
PPN1	Q04119	RRN5	YLR141W	1092 nt		14.62	□□□□□ -0.07
PPN1	Q04119	SHR5	YOL110W	714 nt		14.5	□□□□□ -0.09
PPN1	Q04119	YDJ1	YNL064C	1230 nt		14.47	□□□□□ -0.09
PPN1	Q04119	RSB1	YOR049C	1065 nt		14.39	□□□□□ -0.11
PPN1	Q04119	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		14.33	□□□□□ -0.12
PPN1	Q04119	GAR1	YHR089C	618 nt		14.1	□□□□□ -0.15
PPN1	Q04119	PST2	YDR032C	597 nt		14.08	□□□□□ -0.16
PPN1	Q04119	DEP1	YAL013W	1218 nt		14	□□□□□ -0.17
PPN1	Q04119	SSA3	YBL075C	1950 nt		14	□□□□□ -0.17
PPN1	Q04119	URN1	YPR152C	1398 nt		13.99	□□□□□ -0.17
PPN1	Q04119	RPN10	YHR200W	807 nt		13.89	□□□□□ -0.19
PPN1	Q04119	YNL208W	YNL208W	600 nt		13.85	□□□□□ -0.19
PPN1	Q04119	PUT4	YOR348C	1884 nt		13.8	□□□□□ -0.2
PPN1	Q04119	OPI9	YLR338W	858 nt		13.76	□□□□□ -0.21
PPN1	Q04119	TIR1	YER011W	765 nt		13.63	□□□□□ -0.23
PPN1	Q04119	YKL097C	YKL097C	411 nt		13.63	□□□□□ -0.23
PPN1	Q04119	SAH1	YER043C	1350 nt		13.61	□□□□□ -0.23
PPN1	Q04119	ARE1	YCR048W	1833 nt		13.5	□□□□□ -0.25
PPN1	Q04119	SHU1	YHL006C	453 nt		13.46	□□□□□ -0.25
PPN1	Q04119	PUN1	YLR414C	792 nt		13.4	□□□□□ -0.26
PPN1	Q04119	SSA1	YAL005C	1929 nt		13.39	□□□□□ -0.27
PPN1	Q04119	YJR018W	YJR018W	363 nt		13.37	□□□□□ -0.27
PPN1	Q04119	POA1	YBR022W	534 nt		13.32	□□□□□ -0.28
PPN1	Q04119	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		13.31	□□□□□ -0.28
PPN1	Q04119	RPP2B	YDR382W	333 nt		13.19	□□□□□ -0.3
PPN1	Q04119	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		13.19	□□□□□ -0.3
PPN1	Q04119	PTC2	YER089C	1395 nt		13.17	□□□□□ -0.3
PPN1	Q04119	SRB2	YHR041C	633 nt		13.12	□□□□□ -0.31
PPN1	Q04119	YJR120W	YJR120W	351 nt		13.1	□□□□□ -0.31
PPN1	Q04119	BSC6	YOL137W	1494 nt		13.09	□□□□□ -0.31
PPN1	Q04119	YGR021W	YGR021W	873 nt		13.07	□□□□□ -0.32
PPN1	Q04119	BUD23	YCR047C	828 nt		13.04	□□□□□ -0.32
PPN1	Q04119	WWM1	YFL010C	636 nt		13.02	□□□□□ -0.33
PPN1	Q04119	NAB2	YGL122C	1578 nt		13	□□□□□ -0.33
PPN1	Q04119	YOR139C	YOR139C	393 nt		12.99	□□□□□ -0.33
PPN1	Q04119	HOM6	YJR139C	1080 nt		12.97	□□□□□ -0.33
PPN1	Q04119	NPL3	YDR432W	1245 nt		12.94	□□□□□ -0.34
PPN1	Q04119	INM2	YDR287W	879 nt		12.91	□□□□□ -0.34
PPN1	Q04119	BDH2	YAL061W	1254 nt		12.91	□□□□□ -0.34
PPN1	Q04119	MNP1	YGL068W	585 nt		12.9	□□□□□ -0.34
PPN1	Q04119	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		12.86	□□□□□ -0.35
PPN1	Q04119	SPT5	YML010W	3192 nt		12.86	□□□□□ -0.35
PPN1	Q04119	DAL1	YIR027C	1383 nt		12.85	□□□□□ -0.35
PPN1	Q04119	FPR4	YLR449W	1179 nt		12.83	□□□□□ -0.36
PPN1	Q04119	YOL037C	YOL037C	354 nt		12.81	□□□□□ -0.36
PPN1	Q04119	RKM5	YLR137W	1104 nt		12.79	□□□□□ -0.36
PPN1	Q04119	LSM3	YLR438C-A	270 nt		12.79	□□□□□ -0.36
PPN1	Q04119	YBL100C	YBL100C	315 nt		12.78	□□□□□ -0.36
PPN1	Q04119	FIS1	YIL065C	468 nt		12.77	□□□□□ -0.37
PPN1	Q04119	PHO4	YFR034C	939 nt		12.71	□□□□□ -0.37
PPN1	Q04119	TRM9	YML014W	840 nt		12.66	□□□□□ -0.38
PPN1	Q04119	Q0182	Q0182	405 nt		12.64	□□□□□ -0.39
PPN1	Q04119	FUN26	YAL022C	1554 nt		12.62	□□□□□ -0.39
PPN1	Q04119	SSA4	YER103W	1929 nt		12.6	□□□□□ -0.39
PPN1	Q04119	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		12.5	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		12.5	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		12.5	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		12.5	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		12.5	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	CCT6	YDR188W	1641 nt		12.5	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	YLR281C	YLR281C	468 nt		12.47	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	ALF1	YNL148C	765 nt		12.46	□□□□□ -0.41
PPN1	Q04119	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		12.43	□□□□□ -0.42
PPN1	Q04119	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		12.43	□□□□□ -0.42
PPN1	Q04119	WHI5	YOR083W	888 nt		12.41	□□□□□ -0.42
PPN1	Q04119	YPS1	YLR120C	1710 nt		12.4	□□□□□ -0.42
PPN1	Q04119	PUS2	YGL063W	1113 nt		12.4	□□□□□ -0.42
PPN1	Q04119	YDR095C	YDR095C	411 nt		12.36	□□□□□ -0.43

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms