Protein–RNA interactions for Protein: Q03219

YMR178W, Uncharacterized protein YMR178W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR178WQ03219 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.54■□□□□ 0.88
YMR178WQ03219 NSR1YGR159C 1245 nt20.33■□□□□ 0.85
YMR178WQ03219 NOP1YDL014W 984 nt20.1■□□□□ 0.81
YMR178WQ03219 YKL036CYKL036C 393 nt18.66■□□□□ 0.58
YMR178WQ03219 MDJ1YFL016C 1536 nt17.81■□□□□ 0.44
YMR178WQ03219 Q0297Q0297 156 nt17.63■□□□□ 0.41
YMR178WQ03219 SRX1YKL086W 384 nt17.54■□□□□ 0.4
YMR178WQ03219 YJL027CYJL027C 417 nt17.44■□□□□ 0.38
YMR178WQ03219 SCS3YGL126W 1143 nt17.02■□□□□ 0.32
YMR178WQ03219 YCR051WYCR051W 669 nt16.63■□□□□ 0.25
YMR178WQ03219 YOL085CYOL085C 342 nt16.14■□□□□ 0.17
YMR178WQ03219 PKP1YIL042C 1185 nt15.84■□□□□ 0.13
YMR178WQ03219 DBP2YNL112W 1641 nt15.83■□□□□ 0.13
YMR178WQ03219 RPP1BYDL130W 321 nt15.81■□□□□ 0.12
YMR178WQ03219 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.74■□□□□ 0.11
YMR178WQ03219 CCC1YLR220W 969 nt15.57■□□□□ 0.08
YMR178WQ03219 SCJ1YMR214W 1134 nt15.37■□□□□ 0.05
YMR178WQ03219 ATS1YAL020C 1002 nt15.3■□□□□ 0.04
YMR178WQ03219 YBR190WYBR190W 312 nt15.22■□□□□ 0.03
YMR178WQ03219 PET122YER153C 765 nt15.04■□□□□ -0
YMR178WQ03219 RVS167YDR388W 1449 nt15□□□□□ -0.01
YMR178WQ03219 SCR1SCR1 522 nt14.99□□□□□ -0.01
YMR178WQ03219 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.95□□□□□ -0.02
YMR178WQ03219 RTC3YHR087W 336 nt14.86□□□□□ -0.03
YMR178WQ03219 RRN5YLR141W 1092 nt14.65□□□□□ -0.06
YMR178WQ03219 YDJ1YNL064C 1230 nt14.49□□□□□ -0.09
YMR178WQ03219 SHR5YOL110W 714 nt14.49□□□□□ -0.09
YMR178WQ03219 RSB1YOR049C 1065 nt14.39□□□□□ -0.11
YMR178WQ03219 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.36□□□□□ -0.11
YMR178WQ03219 PST2YDR032C 597 nt14.14□□□□□ -0.15
YMR178WQ03219 GAR1YHR089C 618 nt14.1□□□□□ -0.15
YMR178WQ03219 DEP1YAL013W 1218 nt13.97□□□□□ -0.17
YMR178WQ03219 URN1YPR152C 1398 nt13.96□□□□□ -0.17
YMR178WQ03219 RPN10YHR200W 807 nt13.85□□□□□ -0.19
YMR178WQ03219 YNL208WYNL208W 600 nt13.83□□□□□ -0.2
YMR178WQ03219 OPI9YLR338W 858 nt13.76□□□□□ -0.21
YMR178WQ03219 YKL097CYKL097C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
YMR178WQ03219 PUT4YOR348C 1884 nt13.65□□□□□ -0.22
YMR178WQ03219 TIR1YER011W 765 nt13.64□□□□□ -0.23
YMR178WQ03219 SAH1YER043C 1350 nt13.58□□□□□ -0.23
YMR178WQ03219 SHU1YHL006C 453 nt13.5□□□□□ -0.25
YMR178WQ03219 ARE1YCR048W 1833 nt13.45□□□□□ -0.26
YMR178WQ03219 SSA1YAL005C 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
YMR178WQ03219 PUN1YLR414C 792 nt13.37□□□□□ -0.27
YMR178WQ03219 YJR018WYJR018W 363 nt13.35□□□□□ -0.27
YMR178WQ03219 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.26□□□□□ -0.29
YMR178WQ03219 POA1YBR022W 534 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR178WQ03219 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.22□□□□□ -0.29
YMR178WQ03219 RPP2BYDR382W 333 nt13.16□□□□□ -0.3
YMR178WQ03219 SRB2YHR041C 633 nt13.15□□□□□ -0.3
YMR178WQ03219 PTC2YER089C 1395 nt13.15□□□□□ -0.3
YMR178WQ03219 YJR120WYJR120W 351 nt13.11□□□□□ -0.31
YMR178WQ03219 YGR021WYGR021W 873 nt13.07□□□□□ -0.32
YMR178WQ03219 YOR139CYOR139C 393 nt13.06□□□□□ -0.32
YMR178WQ03219 WWM1YFL010C 636 nt13.04□□□□□ -0.32
YMR178WQ03219 BUD23YCR047C 828 nt12.99□□□□□ -0.33
YMR178WQ03219 HOM6YJR139C 1080 nt12.99□□□□□ -0.33
YMR178WQ03219 NAB2YGL122C 1578 nt12.98□□□□□ -0.33
YMR178WQ03219 NPL3YDR432W 1245 nt12.96□□□□□ -0.33
YMR178WQ03219 MNP1YGL068W 585 nt12.91□□□□□ -0.34
YMR178WQ03219 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
YMR178WQ03219 BDH2YAL061W 1254 nt12.9□□□□□ -0.34
YMR178WQ03219 INM2YDR287W 879 nt12.89□□□□□ -0.35
YMR178WQ03219 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR178WQ03219 DAL1YIR027C 1383 nt12.83□□□□□ -0.36
YMR178WQ03219 YOL037CYOL037C 354 nt12.83□□□□□ -0.36
YMR178WQ03219 SSA3YBL075C 1950 nt12.8□□□□□ -0.36
YMR178WQ03219 RKM5YLR137W 1104 nt12.8□□□□□ -0.36
YMR178WQ03219 LSM3YLR438C-A 270 nt12.79□□□□□ -0.36
YMR178WQ03219 FPR4YLR449W 1179 nt12.78□□□□□ -0.36
YMR178WQ03219 FIS1YIL065C 468 nt12.75□□□□□ -0.37
YMR178WQ03219 YBL100CYBL100C 315 nt12.75□□□□□ -0.37
YMR178WQ03219 PHO4YFR034C 939 nt12.68□□□□□ -0.38
YMR178WQ03219 TRM9YML014W 840 nt12.65□□□□□ -0.38
YMR178WQ03219 FUN26YAL022C 1554 nt12.6□□□□□ -0.39
YMR178WQ03219 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.57□□□□□ -0.4
YMR178WQ03219 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.57□□□□□ -0.4
YMR178WQ03219 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.57□□□□□ -0.4
YMR178WQ03219 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.57□□□□□ -0.4
YMR178WQ03219 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.57□□□□□ -0.4
YMR178WQ03219 YLR281CYLR281C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
YMR178WQ03219 CCT6YDR188W 1641 nt12.5□□□□□ -0.41
YMR178WQ03219 WHI5YOR083W 888 nt12.44□□□□□ -0.42
YMR178WQ03219 PUS2YGL063W 1113 nt12.43□□□□□ -0.42
YMR178WQ03219 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.41□□□□□ -0.42
YMR178WQ03219 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.41□□□□□ -0.42
YMR178WQ03219 ALF1YNL148C 765 nt12.41□□□□□ -0.42
YMR178WQ03219 YPS1YLR120C 1710 nt12.38□□□□□ -0.43
YMR178WQ03219 YDR095CYDR095C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
YMR178WQ03219 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.3□□□□□ -0.44
YMR178WQ03219 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.24□□□□□ -0.45
YMR178WQ03219 IMP2'YIL154C 1041 nt12.23□□□□□ -0.45
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