Protein–RNA interactions for Protein: Q99252

ECM3, Protein ECM3, yeastyeast

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM3Q99252 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.86■■□□□ 1.09
ECM3Q99252 NSR1YGR159C 1245 nt21.67■■□□□ 1.06
ECM3Q99252 NOP1YDL014W 984 nt21.2■□□□□ 0.98
ECM3Q99252 YKL036CYKL036C 393 nt19.59■□□□□ 0.73
ECM3Q99252 MDJ1YFL016C 1536 nt19.3■□□□□ 0.68
ECM3Q99252 Q0297Q0297 156 nt18.58■□□□□ 0.56
ECM3Q99252 SRX1YKL086W 384 nt18.54■□□□□ 0.56
ECM3Q99252 YJL027CYJL027C 417 nt18.3■□□□□ 0.52
ECM3Q99252 SCS3YGL126W 1143 nt17.86■□□□□ 0.45
ECM3Q99252 YCR051WYCR051W 669 nt17.61■□□□□ 0.41
ECM3Q99252 DBP2YNL112W 1641 nt17.07■□□□□ 0.32
ECM3Q99252 YOL085CYOL085C 342 nt16.99■□□□□ 0.31
ECM3Q99252 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.78■□□□□ 0.28
ECM3Q99252 PKP1YIL042C 1185 nt16.76■□□□□ 0.27
ECM3Q99252 RPP1BYDL130W 321 nt16.67■□□□□ 0.26
ECM3Q99252 CCC1YLR220W 969 nt16.62■□□□□ 0.25
ECM3Q99252 YBR190WYBR190W 312 nt16.4■□□□□ 0.22
ECM3Q99252 RTC3YHR087W 336 nt16.05■□□□□ 0.16
ECM3Q99252 RVS167YDR388W 1449 nt16■□□□□ 0.15
ECM3Q99252 SCJ1YMR214W 1134 nt15.99■□□□□ 0.15
ECM3Q99252 PET122YER153C 765 nt15.96■□□□□ 0.15
ECM3Q99252 ATS1YAL020C 1002 nt15.96■□□□□ 0.15
ECM3Q99252 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.88■□□□□ 0.13
ECM3Q99252 SCR1SCR1 522 nt15.75■□□□□ 0.11
ECM3Q99252 RRN5YLR141W 1092 nt15.49■□□□□ 0.07
ECM3Q99252 SHR5YOL110W 714 nt15.47■□□□□ 0.07
ECM3Q99252 YDJ1YNL064C 1230 nt15.33■□□□□ 0.04
ECM3Q99252 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.19■□□□□ 0.02
ECM3Q99252 RSB1YOR049C 1065 nt15.17■□□□□ 0.02
ECM3Q99252 DEP1YAL013W 1218 nt15.06■□□□□ 0
ECM3Q99252 URN1YPR152C 1398 nt15.04■□□□□ -0
ECM3Q99252 GAR1YHR089C 618 nt15.02■□□□□ -0
ECM3Q99252 PUT4YOR348C 1884 nt14.92□□□□□ -0.02
ECM3Q99252 OPI9YLR338W 858 nt14.8□□□□□ -0.04
ECM3Q99252 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
ECM3Q99252 PST2YDR032C 597 nt14.78□□□□□ -0.04
ECM3Q99252 RPN10YHR200W 807 nt14.78□□□□□ -0.04
ECM3Q99252 SAH1YER043C 1350 nt14.73□□□□□ -0.05
ECM3Q99252 ARE1YCR048W 1833 nt14.66□□□□□ -0.06
ECM3Q99252 TIR1YER011W 765 nt14.51□□□□□ -0.09
ECM3Q99252 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.47□□□□□ -0.09
ECM3Q99252 POA1YBR022W 534 nt14.46□□□□□ -0.09
ECM3Q99252 PUN1YLR414C 792 nt14.36□□□□□ -0.11
ECM3Q99252 SSA1YAL005C 1929 nt14.35□□□□□ -0.11
ECM3Q99252 YJR018WYJR018W 363 nt14.33□□□□□ -0.12
ECM3Q99252 PTC2YER089C 1395 nt14.21□□□□□ -0.14
ECM3Q99252 SHU1YHL006C 453 nt14.2□□□□□ -0.14
ECM3Q99252 YKL097CYKL097C 411 nt14.2□□□□□ -0.14
ECM3Q99252 YJR120WYJR120W 351 nt14.17□□□□□ -0.14
ECM3Q99252 SRB2YHR041C 633 nt14.16□□□□□ -0.14
ECM3Q99252 BSC6YOL137W 1494 nt14.14□□□□□ -0.15
ECM3Q99252 BUD23YCR047C 828 nt14.13□□□□□ -0.15
ECM3Q99252 RPP2BYDR382W 333 nt14.03□□□□□ -0.16
ECM3Q99252 NAB2YGL122C 1578 nt14□□□□□ -0.17
ECM3Q99252 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.99□□□□□ -0.17
ECM3Q99252 WWM1YFL010C 636 nt13.89□□□□□ -0.19
ECM3Q99252 FIS1YIL065C 468 nt13.85□□□□□ -0.19
ECM3Q99252 DAL1YIR027C 1383 nt13.83□□□□□ -0.19
ECM3Q99252 SSA3YBL075C 1950 nt13.82□□□□□ -0.2
ECM3Q99252 FPR4YLR449W 1179 nt13.82□□□□□ -0.2
ECM3Q99252 INM2YDR287W 879 nt13.8□□□□□ -0.2
ECM3Q99252 YGR021WYGR021W 873 nt13.77□□□□□ -0.21
ECM3Q99252 BDH2YAL061W 1254 nt13.77□□□□□ -0.21
ECM3Q99252 HOM6YJR139C 1080 nt13.76□□□□□ -0.21
ECM3Q99252 MNP1YGL068W 585 nt13.73□□□□□ -0.21
ECM3Q99252 PHO4YFR034C 939 nt13.72□□□□□ -0.21
ECM3Q99252 YBL100CYBL100C 315 nt13.7□□□□□ -0.22
ECM3Q99252 YOR139CYOR139C 393 nt13.65□□□□□ -0.22
ECM3Q99252 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.64□□□□□ -0.23
ECM3Q99252 LSM3YLR438C-A 270 nt13.57□□□□□ -0.24
ECM3Q99252 RKM5YLR137W 1104 nt13.55□□□□□ -0.24
ECM3Q99252 FUN26YAL022C 1554 nt13.54□□□□□ -0.24
ECM3Q99252 NPL3YDR432W 1245 nt13.51□□□□□ -0.25
ECM3Q99252 TRM9YML014W 840 nt13.49□□□□□ -0.25
ECM3Q99252 YOL037CYOL037C 354 nt13.45□□□□□ -0.26
ECM3Q99252 SPT5YML010W 3192 nt13.44□□□□□ -0.26
ECM3Q99252 YPS1YLR120C 1710 nt13.43□□□□□ -0.26
ECM3Q99252 CCT6YDR188W 1641 nt13.37□□□□□ -0.27
ECM3Q99252 YDR095CYDR095C 411 nt13.36□□□□□ -0.27
ECM3Q99252 ALF1YNL148C 765 nt13.33□□□□□ -0.28
ECM3Q99252 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.29□□□□□ -0.28
ECM3Q99252 MEP2YNL142W 1500 nt13.25□□□□□ -0.29
ECM3Q99252 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.23□□□□□ -0.29
ECM3Q99252 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.23□□□□□ -0.29
ECM3Q99252 YLR281CYLR281C 468 nt13.15□□□□□ -0.3
ECM3Q99252 SIS1YNL007C 1059 nt13.14□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 WHI5YOR083W 888 nt13.12□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.11□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.11□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.11□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.11□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms