Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.72■□□□□ 0.91
MSF1P08425 NSR1YGR159C 1245 nt20.36■□□□□ 0.85
MSF1P08425 NOP1YDL014W 984 nt20.3■□□□□ 0.84
MSF1P08425 YKL036CYKL036C 393 nt19.04■□□□□ 0.64
MSF1P08425 Q0297Q0297 156 nt17.89■□□□□ 0.45
MSF1P08425 YJL027CYJL027C 417 nt17.82■□□□□ 0.44
MSF1P08425 SRX1YKL086W 384 nt17.75■□□□□ 0.43
MSF1P08425 MDJ1YFL016C 1536 nt17.73■□□□□ 0.43
MSF1P08425 SCS3YGL126W 1143 nt17.48■□□□□ 0.39
MSF1P08425 YCR051WYCR051W 669 nt16.84■□□□□ 0.29
MSF1P08425 YOL085CYOL085C 342 nt16.49■□□□□ 0.23
MSF1P08425 PKP1YIL042C 1185 nt16.18■□□□□ 0.18
MSF1P08425 RPP1BYDL130W 321 nt16.04■□□□□ 0.16
MSF1P08425 SCJ1YMR214W 1134 nt15.92■□□□□ 0.14
MSF1P08425 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.85■□□□□ 0.13
MSF1P08425 DBP2YNL112W 1641 nt15.84■□□□□ 0.13
MSF1P08425 ATS1YAL020C 1002 nt15.74■□□□□ 0.11
MSF1P08425 CCC1YLR220W 969 nt15.68■□□□□ 0.1
MSF1P08425 PET122YER153C 765 nt15.28■□□□□ 0.04
MSF1P08425 SCR1SCR1 522 nt15.2■□□□□ 0.02
MSF1P08425 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.11■□□□□ 0.01
MSF1P08425 YBR190WYBR190W 312 nt15.06■□□□□ 0
MSF1P08425 RVS167YDR388W 1449 nt14.95□□□□□ -0.02
MSF1P08425 RRN5YLR141W 1092 nt14.9□□□□□ -0.02
MSF1P08425 RTC3YHR087W 336 nt14.72□□□□□ -0.05
MSF1P08425 RSB1YOR049C 1065 nt14.66□□□□□ -0.06
MSF1P08425 YDJ1YNL064C 1230 nt14.62□□□□□ -0.07
MSF1P08425 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.6□□□□□ -0.07
MSF1P08425 PST2YDR032C 597 nt14.54□□□□□ -0.08
MSF1P08425 SHR5YOL110W 714 nt14.52□□□□□ -0.09
MSF1P08425 GAR1YHR089C 618 nt14.22□□□□□ -0.13
MSF1P08425 YKL097CYKL097C 411 nt14.11□□□□□ -0.15
MSF1P08425 DEP1YAL013W 1218 nt13.99□□□□□ -0.17
MSF1P08425 URN1YPR152C 1398 nt13.91□□□□□ -0.18
MSF1P08425 SHU1YHL006C 453 nt13.85□□□□□ -0.19
MSF1P08425 YNL208WYNL208W 600 nt13.82□□□□□ -0.2
MSF1P08425 RPN10YHR200W 807 nt13.78□□□□□ -0.2
MSF1P08425 PUT4YOR348C 1884 nt13.76□□□□□ -0.21
MSF1P08425 TIR1YER011W 765 nt13.74□□□□□ -0.21
MSF1P08425 OPI9YLR338W 858 nt13.65□□□□□ -0.22
MSF1P08425 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.53□□□□□ -0.24
MSF1P08425 SSA1YAL005C 1929 nt13.51□□□□□ -0.25
MSF1P08425 YOR139CYOR139C 393 nt13.49□□□□□ -0.25
MSF1P08425 ARE1YCR048W 1833 nt13.48□□□□□ -0.25
MSF1P08425 SAH1YER043C 1350 nt13.47□□□□□ -0.25
MSF1P08425 SRB2YHR041C 633 nt13.35□□□□□ -0.27
MSF1P08425 YJR018WYJR018W 363 nt13.3□□□□□ -0.28
MSF1P08425 NPL3YDR432W 1245 nt13.28□□□□□ -0.28
MSF1P08425 PUN1YLR414C 792 nt13.26□□□□□ -0.29
MSF1P08425 POA1YBR022W 534 nt13.25□□□□□ -0.29
MSF1P08425 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.24□□□□□ -0.29
MSF1P08425 YGR021WYGR021W 873 nt13.2□□□□□ -0.3
MSF1P08425 WWM1YFL010C 636 nt13.19□□□□□ -0.3
MSF1P08425 HOM6YJR139C 1080 nt13.19□□□□□ -0.3
MSF1P08425 YJR120WYJR120W 351 nt13.17□□□□□ -0.3
MSF1P08425 MNP1YGL068W 585 nt13.14□□□□□ -0.31
MSF1P08425 RPP2BYDR382W 333 nt13.11□□□□□ -0.31
MSF1P08425 SSA3YBL075C 1950 nt13.09□□□□□ -0.31
MSF1P08425 YOL037CYOL037C 354 nt13.07□□□□□ -0.32
MSF1P08425 PTC2YER089C 1395 nt13.03□□□□□ -0.32
MSF1P08425 BSC6YOL137W 1494 nt13.01□□□□□ -0.33
MSF1P08425 RKM5YLR137W 1104 nt12.99□□□□□ -0.33
MSF1P08425 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.97□□□□□ -0.33
MSF1P08425 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.96□□□□□ -0.33
MSF1P08425 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.96□□□□□ -0.33
MSF1P08425 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.96□□□□□ -0.33
MSF1P08425 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.96□□□□□ -0.33
MSF1P08425 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.96□□□□□ -0.33
MSF1P08425 BDH2YAL061W 1254 nt12.92□□□□□ -0.34
MSF1P08425 BUD23YCR047C 828 nt12.87□□□□□ -0.35
MSF1P08425 LSM3YLR438C-A 270 nt12.83□□□□□ -0.36
MSF1P08425 NAB2YGL122C 1578 nt12.81□□□□□ -0.36
MSF1P08425 INM2YDR287W 879 nt12.8□□□□□ -0.36
MSF1P08425 YLR281CYLR281C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
MSF1P08425 PUS2YGL063W 1113 nt12.74□□□□□ -0.37
MSF1P08425 DAL1YIR027C 1383 nt12.71□□□□□ -0.37
MSF1P08425 YBL100CYBL100C 315 nt12.7□□□□□ -0.38
MSF1P08425 FIS1YIL065C 468 nt12.69□□□□□ -0.38
MSF1P08425 FPR4YLR449W 1179 nt12.68□□□□□ -0.38
MSF1P08425 WHI5YOR083W 888 nt12.67□□□□□ -0.38
MSF1P08425 SPT5YML010W 3192 nt12.64□□□□□ -0.39
MSF1P08425 TRM9YML014W 840 nt12.62□□□□□ -0.39
MSF1P08425 PHO4YFR034C 939 nt12.58□□□□□ -0.4
MSF1P08425 FUN26YAL022C 1554 nt12.58□□□□□ -0.4
MSF1P08425 MOT3YMR070W 1473 nt12.56□□□□□ -0.4
MSF1P08425 CCT6YDR188W 1641 nt12.47□□□□□ -0.41
MSF1P08425 YPR011CYPR011C 981 nt12.44□□□□□ -0.42
MSF1P08425 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.42□□□□□ -0.42
MSF1P08425 DSK2YMR276W 1122 nt12.42□□□□□ -0.42
MSF1P08425 FMP45YDL222C 930 nt12.4□□□□□ -0.42
MSF1P08425 IMP2'YIL154C 1041 nt12.39□□□□□ -0.43
MSF1P08425 YLR236CYLR236C 324 nt12.37□□□□□ -0.43
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