Protein–RNA interactions for Protein: P38090

AGP2, General amino acid permease AGP2, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AGP2P38090 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.81■■□□□ 1.08
AGP2P38090 NSR1YGR159C 1245 nt21.53■■□□□ 1.04
AGP2P38090 NOP1YDL014W 984 nt21.2■□□□□ 0.98
AGP2P38090 YKL036CYKL036C 393 nt19.74■□□□□ 0.75
AGP2P38090 MDJ1YFL016C 1536 nt19.05■□□□□ 0.64
AGP2P38090 Q0297Q0297 156 nt18.66■□□□□ 0.58
AGP2P38090 SRX1YKL086W 384 nt18.58■□□□□ 0.56
AGP2P38090 YJL027CYJL027C 417 nt18.46■□□□□ 0.55
AGP2P38090 SCS3YGL126W 1143 nt18.08■□□□□ 0.48
AGP2P38090 YCR051WYCR051W 669 nt17.63■□□□□ 0.41
AGP2P38090 YOL085CYOL085C 342 nt17.14■□□□□ 0.33
AGP2P38090 DBP2YNL112W 1641 nt16.95■□□□□ 0.3
AGP2P38090 PKP1YIL042C 1185 nt16.88■□□□□ 0.29
AGP2P38090 RPP1BYDL130W 321 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.74■□□□□ 0.27
AGP2P38090 CCC1YLR220W 969 nt16.57■□□□□ 0.24
AGP2P38090 ATS1YAL020C 1002 nt16.21■□□□□ 0.19
AGP2P38090 YBR190WYBR190W 312 nt16.14■□□□□ 0.17
AGP2P38090 SCJ1YMR214W 1134 nt16.13■□□□□ 0.17
AGP2P38090 PET122YER153C 765 nt16.02■□□□□ 0.16
AGP2P38090 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.88■□□□□ 0.13
AGP2P38090 RVS167YDR388W 1449 nt15.84■□□□□ 0.13
AGP2P38090 SCR1SCR1 522 nt15.8■□□□□ 0.12
AGP2P38090 RTC3YHR087W 336 nt15.79■□□□□ 0.12
AGP2P38090 RRN5YLR141W 1092 nt15.57■□□□□ 0.08
AGP2P38090 SHR5YOL110W 714 nt15.36■□□□□ 0.05
AGP2P38090 YDJ1YNL064C 1230 nt15.33■□□□□ 0.04
AGP2P38090 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.27■□□□□ 0.04
AGP2P38090 RSB1YOR049C 1065 nt15.25■□□□□ 0.03
AGP2P38090 PST2YDR032C 597 nt15.01□□□□□ -0.01
AGP2P38090 GAR1YHR089C 618 nt15□□□□□ -0.01
AGP2P38090 DEP1YAL013W 1218 nt14.93□□□□□ -0.02
AGP2P38090 URN1YPR152C 1398 nt14.86□□□□□ -0.03
AGP2P38090 YNL208WYNL208W 600 nt14.66□□□□□ -0.06
AGP2P38090 PUT4YOR348C 1884 nt14.61□□□□□ -0.07
AGP2P38090 OPI9YLR338W 858 nt14.61□□□□□ -0.07
AGP2P38090 RPN10YHR200W 807 nt14.59□□□□□ -0.07
AGP2P38090 SAH1YER043C 1350 nt14.51□□□□□ -0.09
AGP2P38090 TIR1YER011W 765 nt14.47□□□□□ -0.09
AGP2P38090 YKL097CYKL097C 411 nt14.43□□□□□ -0.1
AGP2P38090 ARE1YCR048W 1833 nt14.4□□□□□ -0.1
AGP2P38090 SHU1YHL006C 453 nt14.37□□□□□ -0.11
AGP2P38090 SSA1YAL005C 1929 nt14.33□□□□□ -0.12
AGP2P38090 SRB2YHR041C 633 nt14.19□□□□□ -0.14
AGP2P38090 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.18□□□□□ -0.14
AGP2P38090 YJR018WYJR018W 363 nt14.17□□□□□ -0.14
AGP2P38090 POA1YBR022W 534 nt14.16□□□□□ -0.14
AGP2P38090 PUN1YLR414C 792 nt14.15□□□□□ -0.14
AGP2P38090 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.12□□□□□ -0.15
AGP2P38090 YJR120WYJR120W 351 nt14.08□□□□□ -0.16
AGP2P38090 PTC2YER089C 1395 nt14□□□□□ -0.17
AGP2P38090 YOR139CYOR139C 393 nt13.92□□□□□ -0.18
AGP2P38090 WWM1YFL010C 636 nt13.9□□□□□ -0.18
AGP2P38090 RPP2BYDR382W 333 nt13.87□□□□□ -0.19
AGP2P38090 BUD23YCR047C 828 nt13.84□□□□□ -0.19
AGP2P38090 BSC6YOL137W 1494 nt13.81□□□□□ -0.2
AGP2P38090 HOM6YJR139C 1080 nt13.81□□□□□ -0.2
AGP2P38090 MNP1YGL068W 585 nt13.79□□□□□ -0.2
AGP2P38090 YGR021WYGR021W 873 nt13.78□□□□□ -0.2
AGP2P38090 SSA3YBL075C 1950 nt13.77□□□□□ -0.21
AGP2P38090 NAB2YGL122C 1578 nt13.76□□□□□ -0.21
AGP2P38090 NPL3YDR432W 1245 nt13.67□□□□□ -0.22
AGP2P38090 BDH2YAL061W 1254 nt13.67□□□□□ -0.22
AGP2P38090 FIS1YIL065C 468 nt13.65□□□□□ -0.22
AGP2P38090 DAL1YIR027C 1383 nt13.62□□□□□ -0.23
AGP2P38090 INM2YDR287W 879 nt13.62□□□□□ -0.23
AGP2P38090 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.61□□□□□ -0.23
AGP2P38090 RKM5YLR137W 1104 nt13.6□□□□□ -0.23
AGP2P38090 FPR4YLR449W 1179 nt13.6□□□□□ -0.23
AGP2P38090 YBL100CYBL100C 315 nt13.54□□□□□ -0.24
AGP2P38090 YOL037CYOL037C 354 nt13.53□□□□□ -0.24
AGP2P38090 PHO4YFR034C 939 nt13.51□□□□□ -0.25
AGP2P38090 LSM3YLR438C-A 270 nt13.51□□□□□ -0.25
AGP2P38090 FUN26YAL022C 1554 nt13.41□□□□□ -0.26
AGP2P38090 TRM9YML014W 840 nt13.37□□□□□ -0.27
AGP2P38090 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.34□□□□□ -0.27
AGP2P38090 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.34□□□□□ -0.27
AGP2P38090 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.34□□□□□ -0.27
AGP2P38090 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.34□□□□□ -0.27
AGP2P38090 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.34□□□□□ -0.27
AGP2P38090 YLR281CYLR281C 468 nt13.27□□□□□ -0.29
AGP2P38090 CCT6YDR188W 1641 nt13.25□□□□□ -0.29
AGP2P38090 YPS1YLR120C 1710 nt13.2□□□□□ -0.3
AGP2P38090 WHI5YOR083W 888 nt13.2□□□□□ -0.3
AGP2P38090 PUS2YGL063W 1113 nt13.18□□□□□ -0.3
AGP2P38090 YDR095CYDR095C 411 nt13.14□□□□□ -0.31
AGP2P38090 SPT5YML010W 3192 nt13.12□□□□□ -0.31
AGP2P38090 ALF1YNL148C 765 nt13.12□□□□□ -0.31
AGP2P38090 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.06□□□□□ -0.32
AGP2P38090 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.06□□□□□ -0.32
AGP2P38090 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.05□□□□□ -0.32
AGP2P38090 YPR011CYPR011C 981 nt13.02□□□□□ -0.33
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