RNA–Protein interactions for RNA: YHR216W

IMD2, Transcript of Inosine monophosphate dehydrogenase, yeast

Gene IMD2, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMD2	YHR216W	SEC6	P32844	805 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YEL1	P34225	687 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	MCD4	P36051	919 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	VPS41	P38959	992 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
IMD2	YHR216W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NIT1	P40447	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SMC3	P47037	1230 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RTA1	P53047	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	TOF1	P53840	1238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	TFB2	Q02939	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SIL1	Q08199	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	MED1	Q12321	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RMP1	Q12530	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RAD1	P06777	1100 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SRD1	P09007	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CLN3	P13365	580 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CDC11	P32458	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CNS1	P33313	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NNK1	P36003	928 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	GEM1	P39722	662 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	ACA1	P39970	489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SOL4	P53315	255 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SEC5	P89102	971 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
IMD2	YHR216W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	DAS2	Q12084	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	ERG11	P10614	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RAD18	P10862	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NFS1	P25374	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	MSH1	P25846	959 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	DEP1	P31385	405 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	UBP11	P36026	717 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
IMD2	YHR216W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CTR1	P49573	406 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	LIF1	P53150	421 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YGR117C	P53270	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	MRS2	Q01926	470 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	UGO1	Q03327	502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YML037C	Q03703	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	URH1	Q04179	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SFH1	Q06168	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	OMS1	Q06668	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	MLH2	Q07980	695 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NUR1	Q12066	484 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CDC8	P00572	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SWI6	P09959	803 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CLB1	P24868	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NFU1	P32860	256 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PEX6	P33760	1030 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	BET3	P36149	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PNT1	P38969	423 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	BTN2	P53286	410 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	ARK1	P53974	638 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	VTI1	Q04338	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	HPF1	Q05164	967 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SPO21	Q12411	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	TMA17	Q12513	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PCK1	P10963	549 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	KAR1	P11927	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	CHS2	P14180	963 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	KIP1	P28742	1111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	ERC1	P38767	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SIT1	P39980	628 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	SDS3	P40505	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	PMT3	P47190	753 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	KAP114	P53067	1004 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	VID30	P53076	958 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IMD2	YHR216W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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