Protein–RNA interactions for Protein: P36051

MCD4, GPI ethanolamine phosphate transferase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD4P36051 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.5■■□□□ 1.35
MCD4P36051 NOP1YDL014W 984 nt23.11■■□□□ 1.29
MCD4P36051 NSR1YGR159C 1245 nt22.95■■□□□ 1.26
MCD4P36051 YKL036CYKL036C 393 nt21.77■■□□□ 1.08
MCD4P36051 YJL027CYJL027C 417 nt20.4■□□□□ 0.86
MCD4P36051 Q0297Q0297 156 nt20.38■□□□□ 0.85
MCD4P36051 SRX1YKL086W 384 nt20.17■□□□□ 0.82
MCD4P36051 SCS3YGL126W 1143 nt20.03■□□□□ 0.8
MCD4P36051 MDJ1YFL016C 1536 nt19.83■□□□□ 0.77
MCD4P36051 YCR051WYCR051W 669 nt19.16■□□□□ 0.66
MCD4P36051 YOL085CYOL085C 342 nt18.82■□□□□ 0.6
MCD4P36051 SCJ1YMR214W 1134 nt18.46■□□□□ 0.55
MCD4P36051 PKP1YIL042C 1185 nt18.43■□□□□ 0.54
MCD4P36051 RPP1BYDL130W 321 nt18.28■□□□□ 0.52
MCD4P36051 ATS1YAL020C 1002 nt18.08■□□□□ 0.48
MCD4P36051 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.93■□□□□ 0.46
MCD4P36051 DBP2YNL112W 1641 nt17.76■□□□□ 0.43
MCD4P36051 CCC1YLR220W 969 nt17.71■□□□□ 0.43
MCD4P36051 SCR1SCR1 522 nt17.38■□□□□ 0.37
MCD4P36051 PET122YER153C 765 nt17.36■□□□□ 0.37
MCD4P36051 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.12■□□□□ 0.33
MCD4P36051 RRN5YLR141W 1092 nt16.93■□□□□ 0.3
MCD4P36051 RVS167YDR388W 1449 nt16.88■□□□□ 0.29
MCD4P36051 YBR190WYBR190W 312 nt16.83■□□□□ 0.28
MCD4P36051 RSB1YOR049C 1065 nt16.74■□□□□ 0.27
MCD4P36051 RTC3YHR087W 336 nt16.72■□□□□ 0.27
MCD4P36051 PST2YDR032C 597 nt16.66■□□□□ 0.26
MCD4P36051 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.61■□□□□ 0.25
MCD4P36051 YDJ1YNL064C 1230 nt16.59■□□□□ 0.25
MCD4P36051 SHR5YOL110W 714 nt16.4■□□□□ 0.22
MCD4P36051 YKL097CYKL097C 411 nt16.28■□□□□ 0.2
MCD4P36051 GAR1YHR089C 618 nt16.1■□□□□ 0.17
MCD4P36051 SHU1YHL006C 453 nt15.84■□□□□ 0.13
MCD4P36051 DEP1YAL013W 1218 nt15.71■□□□□ 0.11
MCD4P36051 URN1YPR152C 1398 nt15.6■□□□□ 0.09
MCD4P36051 YNL208WYNL208W 600 nt15.58■□□□□ 0.08
MCD4P36051 TIR1YER011W 765 nt15.55■□□□□ 0.08
MCD4P36051 RPN10YHR200W 807 nt15.55■□□□□ 0.08
MCD4P36051 YOR139CYOR139C 393 nt15.49■□□□□ 0.07
MCD4P36051 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.41■□□□□ 0.06
MCD4P36051 PUT4YOR348C 1884 nt15.36■□□□□ 0.05
MCD4P36051 NPL3YDR432W 1245 nt15.3■□□□□ 0.04
MCD4P36051 OPI9YLR338W 858 nt15.3■□□□□ 0.04
MCD4P36051 SSA1YAL005C 1929 nt15.23■□□□□ 0.03
MCD4P36051 YGR021WYGR021W 873 nt15.06■□□□□ 0
MCD4P36051 SSA3YBL075C 1950 nt15.03■□□□□ -0
MCD4P36051 SAH1YER043C 1350 nt15.02■□□□□ -0
MCD4P36051 SRB2YHR041C 633 nt15.02■□□□□ -0
MCD4P36051 ARE1YCR048W 1833 nt15□□□□□ -0.01
MCD4P36051 HOM6YJR139C 1080 nt14.99□□□□□ -0.01
MCD4P36051 YOL037CYOL037C 354 nt14.98□□□□□ -0.01
MCD4P36051 MNP1YGL068W 585 nt14.96□□□□□ -0.01
MCD4P36051 YJR018WYJR018W 363 nt14.93□□□□□ -0.02
MCD4P36051 WWM1YFL010C 636 nt14.92□□□□□ -0.02
MCD4P36051 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.87□□□□□ -0.03
MCD4P36051 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.87□□□□□ -0.03
MCD4P36051 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.87□□□□□ -0.03
MCD4P36051 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.87□□□□□ -0.03
MCD4P36051 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.87□□□□□ -0.03
MCD4P36051 PUN1YLR414C 792 nt14.87□□□□□ -0.03
MCD4P36051 RPP2BYDR382W 333 nt14.8□□□□□ -0.04
MCD4P36051 POA1YBR022W 534 nt14.8□□□□□ -0.04
MCD4P36051 RKM5YLR137W 1104 nt14.77□□□□□ -0.05
MCD4P36051 YJR120WYJR120W 351 nt14.76□□□□□ -0.05
MCD4P36051 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.74□□□□□ -0.05
MCD4P36051 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.73□□□□□ -0.05
MCD4P36051 PUS2YGL063W 1113 nt14.58□□□□□ -0.08
MCD4P36051 BDH2YAL061W 1254 nt14.57□□□□□ -0.08
MCD4P36051 YLR281CYLR281C 468 nt14.57□□□□□ -0.08
MCD4P36051 PTC2YER089C 1395 nt14.56□□□□□ -0.08
MCD4P36051 BSC6YOL137W 1494 nt14.55□□□□□ -0.08
MCD4P36051 LSM3YLR438C-A 270 nt14.51□□□□□ -0.09
MCD4P36051 MOT3YMR070W 1473 nt14.5□□□□□ -0.09
MCD4P36051 WHI5YOR083W 888 nt14.44□□□□□ -0.1
MCD4P36051 INM2YDR287W 879 nt14.36□□□□□ -0.11
MCD4P36051 BUD23YCR047C 828 nt14.33□□□□□ -0.12
MCD4P36051 NAB2YGL122C 1578 nt14.33□□□□□ -0.12
MCD4P36051 YBL100CYBL100C 315 nt14.28□□□□□ -0.12
MCD4P36051 SPT5YML010W 3192 nt14.25□□□□□ -0.13
MCD4P36051 DAL1YIR027C 1383 nt14.24□□□□□ -0.13
MCD4P36051 TRM9YML014W 840 nt14.21□□□□□ -0.13
MCD4P36051 FMP45YDL222C 930 nt14.2□□□□□ -0.14
MCD4P36051 DSK2YMR276W 1122 nt14.2□□□□□ -0.14
MCD4P36051 IMP2'YIL154C 1041 nt14.19□□□□□ -0.14
MCD4P36051 FPR4YLR449W 1179 nt14.18□□□□□ -0.14
MCD4P36051 MRPL8YJL063C 717 nt14.17□□□□□ -0.14
MCD4P36051 FIS1YIL065C 468 nt14.14□□□□□ -0.15
MCD4P36051 YPR011CYPR011C 981 nt14.14□□□□□ -0.15
MCD4P36051 YCH1YGR203W 447 nt14.12□□□□□ -0.15
MCD4P36051 FUN26YAL022C 1554 nt14.12□□□□□ -0.15
MCD4P36051 YLR236CYLR236C 324 nt14.09□□□□□ -0.15
MCD4P36051 PHO4YFR034C 939 nt14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms