RNA–Protein interactions for RNA: YGL079W

KXD1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene KXD1, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KXD1	YGL079W	DID4	P36108	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	DIP5	P53388	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	UFO1	Q04511	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	STP4	Q07351	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	APM4	Q99186	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	DUN1	P39009	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	PXA1	P41909	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	HOF1	Q05080	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	HFI1	Q12060	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	UBP12	P39538	1254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	IES1	P43579	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	SPO1	P53541	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	PPN1	Q04119	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	TPK2	P06245	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	YMC1	P32331	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	FAT1	P38225	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	SNM1	P40993	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	TAF4	P50105	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	FMP30	Q02883	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	YEN1	P40028	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	VID28	P40547	921 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	NSE5	Q03718	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KXD1	YGL079W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	STE4	P18851	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	PRE4	P30657	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TMN3	P40071	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	RIM13	Q03792	727 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	AFT2	Q08957	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	ULA1	Q12059	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
KXD1	YGL079W	FDC1	Q03034	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	SEG1	Q04279	960 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	ERG11	P10614	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	CDC26	P14724	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TUP1	P16649	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
KXD1	YGL079W	DAL3	P32459	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	GRX4	P32642	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	CDS1	P38221	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	YHR033W	P38690	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	FTR1	P40088	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	YGL117W	P53133	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	CPR8	P53728	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TIM50	Q02776	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TRS23	Q03784	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	HLR1	Q04429	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	ARG7	Q04728	441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	RMP1	Q12530	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TSR4	P25040	408 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	MRPL7	P36519	292 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	PRM2	P40534	656 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TRE2	Q08693	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
KXD1	YGL079W	HXT4	P32467	576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	EUG1	P32474	517 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	PPE1	P38796	400 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	TAX4	P47030	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	YIP4	P53093	235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	SKY1	Q03656	742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KXD1	YGL079W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	TOP1	P04786	769 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	AEP2	P22136	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	MTC7	P32633	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	THI6	P41835	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	NUP1	P20676	1076 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	AAD3	P25612	363 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	DGR2	P32330	852 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	NIT2	P47016	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	MFM1	Q02783	413 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	ICT1	Q12385	394 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	TMA17	Q12513	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KXD1	YGL079W	HMG2	P12684	1045 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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