Protein–RNA interactions for Protein: Q12059

ULA1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ULA1Q12059 NSR1YGR159C 1245 nt19.38■□□□□ 0.69
ULA1Q12059 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.1■□□□□ 0.65
ULA1Q12059 NOP1YDL014W 984 nt18.4■□□□□ 0.54
ULA1Q12059 MDJ1YFL016C 1536 nt17.61■□□□□ 0.41
ULA1Q12059 YKL036CYKL036C 393 nt16.55■□□□□ 0.24
ULA1Q12059 YJL027CYJL027C 417 nt16.22■□□□□ 0.19
ULA1Q12059 SRX1YKL086W 384 nt16.08■□□□□ 0.16
ULA1Q12059 Q0297Q0297 156 nt15.97■□□□□ 0.15
ULA1Q12059 DBP2YNL112W 1641 nt15.42■□□□□ 0.06
ULA1Q12059 YCR051WYCR051W 669 nt15.19■□□□□ 0.02
ULA1Q12059 YBR190WYBR190W 312 nt15.16■□□□□ 0.02
ULA1Q12059 SCS3YGL126W 1143 nt14.83□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.81□□□□□ -0.04
ULA1Q12059 RTC3YHR087W 336 nt14.76□□□□□ -0.05
ULA1Q12059 CCC1YLR220W 969 nt14.6□□□□□ -0.07
ULA1Q12059 RVS167YDR388W 1449 nt14.41□□□□□ -0.1
ULA1Q12059 YOL085CYOL085C 342 nt14.34□□□□□ -0.11
ULA1Q12059 RPP1BYDL130W 321 nt14.32□□□□□ -0.12
ULA1Q12059 SSA3YBL075C 1950 nt14.25□□□□□ -0.13
ULA1Q12059 SCJ1YMR214W 1134 nt14.23□□□□□ -0.13
ULA1Q12059 PKP1YIL042C 1185 nt14.15□□□□□ -0.14
ULA1Q12059 PUT4YOR348C 1884 nt14.11□□□□□ -0.15
ULA1Q12059 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.85□□□□□ -0.19
ULA1Q12059 SHR5YOL110W 714 nt13.8□□□□□ -0.2
ULA1Q12059 PET122YER153C 765 nt13.72□□□□□ -0.21
ULA1Q12059 ARE1YCR048W 1833 nt13.71□□□□□ -0.21
ULA1Q12059 URN1YPR152C 1398 nt13.67□□□□□ -0.22
ULA1Q12059 POA1YBR022W 534 nt13.59□□□□□ -0.23
ULA1Q12059 SAH1YER043C 1350 nt13.58□□□□□ -0.23
ULA1Q12059 OPI9YLR338W 858 nt13.58□□□□□ -0.24
ULA1Q12059 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.52□□□□□ -0.25
ULA1Q12059 DEP1YAL013W 1218 nt13.5□□□□□ -0.25
ULA1Q12059 SCR1SCR1 522 nt13.47□□□□□ -0.25
ULA1Q12059 YDJ1YNL064C 1230 nt13.42□□□□□ -0.26
ULA1Q12059 BSC6YOL137W 1494 nt13.4□□□□□ -0.26
ULA1Q12059 RPN10YHR200W 807 nt13.39□□□□□ -0.27
ULA1Q12059 YNL208WYNL208W 600 nt13.29□□□□□ -0.28
ULA1Q12059 RRN5YLR141W 1092 nt13.27□□□□□ -0.29
ULA1Q12059 PUN1YLR414C 792 nt13.19□□□□□ -0.3
ULA1Q12059 SPT5YML010W 3192 nt13.16□□□□□ -0.3
ULA1Q12059 BUD23YCR047C 828 nt13.15□□□□□ -0.3
ULA1Q12059 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
ULA1Q12059 ATS1YAL020C 1002 nt13.14□□□□□ -0.31
ULA1Q12059 PTC2YER089C 1395 nt13.07□□□□□ -0.32
ULA1Q12059 YJR018WYJR018W 363 nt13.02□□□□□ -0.33
ULA1Q12059 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.01□□□□□ -0.33
ULA1Q12059 NAB2YGL122C 1578 nt12.99□□□□□ -0.33
ULA1Q12059 SSA4YER103W 1929 nt12.86□□□□□ -0.35
ULA1Q12059 RSB1YOR049C 1065 nt12.86□□□□□ -0.35
ULA1Q12059 FIS1YIL065C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
ULA1Q12059 TIR1YER011W 765 nt12.75□□□□□ -0.37
ULA1Q12059 DAL1YIR027C 1383 nt12.74□□□□□ -0.37
ULA1Q12059 YJR120WYJR120W 351 nt12.73□□□□□ -0.37
ULA1Q12059 SSA1YAL005C 1929 nt12.68□□□□□ -0.38
ULA1Q12059 FPR4YLR449W 1179 nt12.65□□□□□ -0.38
ULA1Q12059 MEP2YNL142W 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
ULA1Q12059 RPP2BYDR382W 333 nt12.64□□□□□ -0.39
ULA1Q12059 INM2YDR287W 879 nt12.62□□□□□ -0.39
ULA1Q12059 PHO4YFR034C 939 nt12.61□□□□□ -0.39
ULA1Q12059 YPS1YLR120C 1710 nt12.54□□□□□ -0.4
ULA1Q12059 BDF1YLR399C 2061 nt12.44□□□□□ -0.42
ULA1Q12059 YBL100CYBL100C 315 nt12.42□□□□□ -0.42
ULA1Q12059 DCW1YKL046C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
ULA1Q12059 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.4□□□□□ -0.42
ULA1Q12059 YDR095CYDR095C 411 nt12.39□□□□□ -0.43
ULA1Q12059 SRB2YHR041C 633 nt12.37□□□□□ -0.43
ULA1Q12059 BDH2YAL061W 1254 nt12.32□□□□□ -0.44
ULA1Q12059 TAT1YBR069C 1860 nt12.27□□□□□ -0.45
ULA1Q12059 EMI2YDR516C 1503 nt12.26□□□□□ -0.45
ULA1Q12059 FUN26YAL022C 1554 nt12.26□□□□□ -0.45
ULA1Q12059 PST2YDR032C 597 nt12.25□□□□□ -0.45
ULA1Q12059 YMR090WYMR090W 684 nt12.21□□□□□ -0.45
ULA1Q12059 YBR220CYBR220C 1683 nt12.17□□□□□ -0.46
ULA1Q12059 ALF1YNL148C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
ULA1Q12059 PTP1YDL230W 1008 nt12.14□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 TRM9YML014W 840 nt12.14□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 RPP2AYOL039W 321 nt12.14□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 YDL221WYDL221W 552 nt12.13□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 CAC2YML102W 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 WWM1YFL010C 636 nt12.09□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 LSM3YLR438C-A 270 nt12.09□□□□□ -0.47
ULA1Q12059 SDH1YKL148C 1923 nt12.08□□□□□ -0.48
ULA1Q12059 CCT6YDR188W 1641 nt12.08□□□□□ -0.48
ULA1Q12059 SIS1YNL007C 1059 nt12.01□□□□□ -0.49
ULA1Q12059 SUF2tP(AGG)C 72 nt12□□□□□ -0.49
ULA1Q12059 SUF10tP(AGG)N 72 nt12□□□□□ -0.49
ULA1Q12059 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.94□□□□□ -0.5
ULA1Q12059 SCC4YER147C 1875 nt11.93□□□□□ -0.5
ULA1Q12059 IRC15YPL017C 1500 nt11.93□□□□□ -0.5
ULA1Q12059 YGR021WYGR021W 873 nt11.93□□□□□ -0.5
ULA1Q12059 GIS3YLR094C 1509 nt11.86□□□□□ -0.51
ULA1Q12059 SHU1YHL006C 453 nt11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7 ms