Protein–RNA interactions for Protein: Q03718

NSE5, Non-structural maintenance of chromosome element 5, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE5Q03718 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.31■■□□□ 1
NSE5Q03718 NOP1YDL014W 984 nt20.94■□□□□ 0.94
NSE5Q03718 NSR1YGR159C 1245 nt20.82■□□□□ 0.92
NSE5Q03718 YKL036CYKL036C 393 nt19.67■□□□□ 0.74
NSE5Q03718 YJL027CYJL027C 417 nt18.44■□□□□ 0.54
NSE5Q03718 Q0297Q0297 156 nt18.42■□□□□ 0.54
NSE5Q03718 SRX1YKL086W 384 nt18.26■□□□□ 0.51
NSE5Q03718 SCS3YGL126W 1143 nt18.08■□□□□ 0.48
NSE5Q03718 MDJ1YFL016C 1536 nt18.03■□□□□ 0.48
NSE5Q03718 YCR051WYCR051W 669 nt17.34■□□□□ 0.37
NSE5Q03718 YOL085CYOL085C 342 nt16.98■□□□□ 0.31
NSE5Q03718 PKP1YIL042C 1185 nt16.64■□□□□ 0.25
NSE5Q03718 SCJ1YMR214W 1134 nt16.62■□□□□ 0.25
NSE5Q03718 RPP1BYDL130W 321 nt16.53■□□□□ 0.24
NSE5Q03718 ATS1YAL020C 1002 nt16.28■□□□□ 0.2
NSE5Q03718 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.25■□□□□ 0.19
NSE5Q03718 DBP2YNL112W 1641 nt16.09■□□□□ 0.17
NSE5Q03718 CCC1YLR220W 969 nt16.05■□□□□ 0.16
NSE5Q03718 SCR1SCR1 522 nt15.74■□□□□ 0.11
NSE5Q03718 PET122YER153C 765 nt15.7■□□□□ 0.1
NSE5Q03718 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.49■□□□□ 0.07
NSE5Q03718 RVS167YDR388W 1449 nt15.37■□□□□ 0.05
NSE5Q03718 YBR190WYBR190W 312 nt15.32■□□□□ 0.04
NSE5Q03718 RRN5YLR141W 1092 nt15.28■□□□□ 0.04
NSE5Q03718 RSB1YOR049C 1065 nt15.14■□□□□ 0.01
NSE5Q03718 RTC3YHR087W 336 nt15.04■□□□□ -0
NSE5Q03718 YDJ1YNL064C 1230 nt15.02■□□□□ -0
NSE5Q03718 PST2YDR032C 597 nt14.99□□□□□ -0.01
NSE5Q03718 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.99□□□□□ -0.01
NSE5Q03718 SHR5YOL110W 714 nt14.9□□□□□ -0.02
NSE5Q03718 YKL097CYKL097C 411 nt14.67□□□□□ -0.06
NSE5Q03718 GAR1YHR089C 618 nt14.58□□□□□ -0.08
NSE5Q03718 SSA3YBL075C 1950 nt14.32□□□□□ -0.12
NSE5Q03718 SHU1YHL006C 453 nt14.27□□□□□ -0.13
NSE5Q03718 DEP1YAL013W 1218 nt14.25□□□□□ -0.13
NSE5Q03718 URN1YPR152C 1398 nt14.18□□□□□ -0.14
NSE5Q03718 RPN10YHR200W 807 nt14.17□□□□□ -0.14
NSE5Q03718 YNL208WYNL208W 600 nt14.16□□□□□ -0.14
NSE5Q03718 TIR1YER011W 765 nt14.09□□□□□ -0.15
NSE5Q03718 YOR139CYOR139C 393 nt13.93□□□□□ -0.18
NSE5Q03718 OPI9YLR338W 858 nt13.91□□□□□ -0.18
NSE5Q03718 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.87□□□□□ -0.19
NSE5Q03718 NPL3YDR432W 1245 nt13.82□□□□□ -0.2
NSE5Q03718 SSA1YAL005C 1929 nt13.78□□□□□ -0.2
NSE5Q03718 SAH1YER043C 1350 nt13.67□□□□□ -0.22
NSE5Q03718 YGR021WYGR021W 873 nt13.65□□□□□ -0.22
NSE5Q03718 YJR018WYJR018W 363 nt13.57□□□□□ -0.24
NSE5Q03718 YOL037CYOL037C 354 nt13.57□□□□□ -0.24
NSE5Q03718 SRB2YHR041C 633 nt13.56□□□□□ -0.24
NSE5Q03718 HOM6YJR139C 1080 nt13.56□□□□□ -0.24
NSE5Q03718 PUN1YLR414C 792 nt13.55□□□□□ -0.24
NSE5Q03718 PUT4YOR348C 1884 nt13.53□□□□□ -0.24
NSE5Q03718 MNP1YGL068W 585 nt13.52□□□□□ -0.25
NSE5Q03718 WWM1YFL010C 636 nt13.5□□□□□ -0.25
NSE5Q03718 RPP2BYDR382W 333 nt13.47□□□□□ -0.25
NSE5Q03718 ARE1YCR048W 1833 nt13.41□□□□□ -0.26
NSE5Q03718 YJR120WYJR120W 351 nt13.38□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 RKM5YLR137W 1104 nt13.37□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.36□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.36□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.36□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.36□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.36□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.35□□□□□ -0.27
NSE5Q03718 Q0182Q0182 405 nt13.31□□□□□ -0.28
NSE5Q03718 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.28□□□□□ -0.28
NSE5Q03718 PTC2YER089C 1395 nt13.24□□□□□ -0.29
NSE5Q03718 BDH2YAL061W 1254 nt13.23□□□□□ -0.29
NSE5Q03718 LSM3YLR438C-A 270 nt13.16□□□□□ -0.3
NSE5Q03718 PUS2YGL063W 1113 nt13.14□□□□□ -0.31
NSE5Q03718 YLR281CYLR281C 468 nt13.14□□□□□ -0.31
NSE5Q03718 POA1YBR022W 534 nt13.13□□□□□ -0.31
NSE5Q03718 INM2YDR287W 879 nt13.06□□□□□ -0.32
NSE5Q03718 NAB2YGL122C 1578 nt13.05□□□□□ -0.32
NSE5Q03718 MOT3YMR070W 1473 nt13.04□□□□□ -0.32
NSE5Q03718 WHI5YOR083W 888 nt13.03□□□□□ -0.32
NSE5Q03718 BUD23YCR047C 828 nt13.01□□□□□ -0.33
NSE5Q03718 YBL100CYBL100C 315 nt12.99□□□□□ -0.33
NSE5Q03718 DAL1YIR027C 1383 nt12.97□□□□□ -0.33
NSE5Q03718 FPR4YLR449W 1179 nt12.91□□□□□ -0.34
NSE5Q03718 TRM9YML014W 840 nt12.91□□□□□ -0.34
NSE5Q03718 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
NSE5Q03718 FIS1YIL065C 468 nt12.89□□□□□ -0.35
NSE5Q03718 IMP2'YIL154C 1041 nt12.86□□□□□ -0.35
NSE5Q03718 DSK2YMR276W 1122 nt12.84□□□□□ -0.35
NSE5Q03718 FUN26YAL022C 1554 nt12.83□□□□□ -0.36
NSE5Q03718 FMP45YDL222C 930 nt12.83□□□□□ -0.36
NSE5Q03718 PHO4YFR034C 939 nt12.82□□□□□ -0.36
NSE5Q03718 CCT6YDR188W 1641 nt12.75□□□□□ -0.37
NSE5Q03718 MRPL8YJL063C 717 nt12.75□□□□□ -0.37
NSE5Q03718 YCH1YGR203W 447 nt12.74□□□□□ -0.37
NSE5Q03718 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.74□□□□□ -0.37
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