Protein–RNA interactions for Protein: Q12387

MDM20, N-terminal acetyltransferase B complex subunit MDM20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM20Q12387 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.8■■□□□ 1.24
MDM20Q12387 NOP1YDL014W 984 nt22.4■■□□□ 1.18
MDM20Q12387 NSR1YGR159C 1245 nt22.1■■□□□ 1.13
MDM20Q12387 YKL036CYKL036C 393 nt21.23■□□□□ 0.99
MDM20Q12387 YJL027CYJL027C 417 nt19.95■□□□□ 0.78
MDM20Q12387 Q0297Q0297 156 nt19.78■□□□□ 0.76
MDM20Q12387 SCS3YGL126W 1143 nt19.61■□□□□ 0.73
MDM20Q12387 SRX1YKL086W 384 nt19.56■□□□□ 0.72
MDM20Q12387 MDJ1YFL016C 1536 nt19.08■□□□□ 0.64
MDM20Q12387 YCR051WYCR051W 669 nt18.65■□□□□ 0.58
MDM20Q12387 YOL085CYOL085C 342 nt18.37■□□□□ 0.53
MDM20Q12387 SCJ1YMR214W 1134 nt18.11■□□□□ 0.49
MDM20Q12387 PKP1YIL042C 1185 nt18.05■□□□□ 0.48
MDM20Q12387 RPP1BYDL130W 321 nt17.76■□□□□ 0.43
MDM20Q12387 ATS1YAL020C 1002 nt17.72■□□□□ 0.43
MDM20Q12387 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.32■□□□□ 0.36
MDM20Q12387 CCC1YLR220W 969 nt17.21■□□□□ 0.35
MDM20Q12387 DBP2YNL112W 1641 nt17.08■□□□□ 0.32
MDM20Q12387 PET122YER153C 765 nt16.9■□□□□ 0.3
MDM20Q12387 SCR1SCR1 522 nt16.9■□□□□ 0.3
MDM20Q12387 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.6■□□□□ 0.25
MDM20Q12387 RTC3YHR087W 336 nt16.51■□□□□ 0.23
MDM20Q12387 RRN5YLR141W 1092 nt16.49■□□□□ 0.23
MDM20Q12387 RSB1YOR049C 1065 nt16.35■□□□□ 0.21
MDM20Q12387 PST2YDR032C 597 nt16.29■□□□□ 0.2
MDM20Q12387 RVS167YDR388W 1449 nt16.25■□□□□ 0.19
MDM20Q12387 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.16■□□□□ 0.18
MDM20Q12387 YBR190WYBR190W 312 nt16.09■□□□□ 0.17
MDM20Q12387 YDJ1YNL064C 1230 nt16.04■□□□□ 0.16
MDM20Q12387 YKL097CYKL097C 411 nt16■□□□□ 0.15
MDM20Q12387 SHR5YOL110W 714 nt15.81■□□□□ 0.12
MDM20Q12387 GAR1YHR089C 618 nt15.63■□□□□ 0.09
MDM20Q12387 SHU1YHL006C 453 nt15.5■□□□□ 0.07
MDM20Q12387 YOR139CYOR139C 393 nt15.22■□□□□ 0.03
MDM20Q12387 DEP1YAL013W 1218 nt15.19■□□□□ 0.02
MDM20Q12387 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.1■□□□□ 0.01
MDM20Q12387 TIR1YER011W 765 nt15.06■□□□□ 0
MDM20Q12387 URN1YPR152C 1398 nt15□□□□□ -0.01
MDM20Q12387 YNL208WYNL208W 600 nt15□□□□□ -0.01
MDM20Q12387 SSA3YBL075C 1950 nt15□□□□□ -0.01
MDM20Q12387 NPL3YDR432W 1245 nt14.99□□□□□ -0.01
MDM20Q12387 RPN10YHR200W 807 nt14.93□□□□□ -0.02
MDM20Q12387 SSA1YAL005C 1929 nt14.74□□□□□ -0.05
MDM20Q12387 OPI9YLR338W 858 nt14.65□□□□□ -0.06
MDM20Q12387 MNP1YGL068W 585 nt14.61□□□□□ -0.07
MDM20Q12387 SRB2YHR041C 633 nt14.61□□□□□ -0.07
MDM20Q12387 YGR021WYGR021W 873 nt14.59□□□□□ -0.07
MDM20Q12387 YOL037CYOL037C 354 nt14.59□□□□□ -0.07
MDM20Q12387 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM20Q12387 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM20Q12387 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM20Q12387 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM20Q12387 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM20Q12387 HOM6YJR139C 1080 nt14.56□□□□□ -0.08
MDM20Q12387 WWM1YFL010C 636 nt14.5□□□□□ -0.09
MDM20Q12387 SAH1YER043C 1350 nt14.42□□□□□ -0.1
MDM20Q12387 RKM5YLR137W 1104 nt14.36□□□□□ -0.11
MDM20Q12387 YJR018WYJR018W 363 nt14.35□□□□□ -0.11
MDM20Q12387 PUS2YGL063W 1113 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM20Q12387 PUT4YOR348C 1884 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM20Q12387 MOT3YMR070W 1473 nt14.27□□□□□ -0.12
MDM20Q12387 RPP2BYDR382W 333 nt14.24□□□□□ -0.13
MDM20Q12387 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.24□□□□□ -0.13
MDM20Q12387 PUN1YLR414C 792 nt14.24□□□□□ -0.13
MDM20Q12387 YJR120WYJR120W 351 nt14.23□□□□□ -0.13
MDM20Q12387 BSC6YOL137W 1494 nt14.21□□□□□ -0.13
MDM20Q12387 YLR281CYLR281C 468 nt14.2□□□□□ -0.14
MDM20Q12387 WHI5YOR083W 888 nt14.08□□□□□ -0.16
MDM20Q12387 ARE1YCR048W 1833 nt14.06□□□□□ -0.16
MDM20Q12387 BDH2YAL061W 1254 nt14.03□□□□□ -0.16
MDM20Q12387 PTC2YER089C 1395 nt13.96□□□□□ -0.17
MDM20Q12387 LSM3YLR438C-A 270 nt13.96□□□□□ -0.17
MDM20Q12387 FMP45YDL222C 930 nt13.93□□□□□ -0.18
MDM20Q12387 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.91□□□□□ -0.18
MDM20Q12387 MRPL8YJL063C 717 nt13.9□□□□□ -0.18
MDM20Q12387 YPR011CYPR011C 981 nt13.85□□□□□ -0.19
MDM20Q12387 DSK2YMR276W 1122 nt13.84□□□□□ -0.19
MDM20Q12387 YCH1YGR203W 447 nt13.82□□□□□ -0.2
MDM20Q12387 POA1YBR022W 534 nt13.8□□□□□ -0.2
MDM20Q12387 YLR236CYLR236C 324 nt13.78□□□□□ -0.2
MDM20Q12387 INM2YDR287W 879 nt13.76□□□□□ -0.21
MDM20Q12387 IMP2'YIL154C 1041 nt13.75□□□□□ -0.21
MDM20Q12387 YBL100CYBL100C 315 nt13.73□□□□□ -0.21
MDM20Q12387 ADO1YJR105W 1023 nt13.69□□□□□ -0.22
MDM20Q12387 TRM9YML014W 840 nt13.69□□□□□ -0.22
MDM20Q12387 NAB2YGL122C 1578 nt13.68□□□□□ -0.22
MDM20Q12387 BUD23YCR047C 828 nt13.67□□□□□ -0.22
MDM20Q12387 UBX6YJL048C 1191 nt13.67□□□□□ -0.22
MDM20Q12387 FPR4YLR449W 1179 nt13.66□□□□□ -0.22
MDM20Q12387 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.64□□□□□ -0.23
MDM20Q12387 DAL1YIR027C 1383 nt13.63□□□□□ -0.23
MDM20Q12387 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.6□□□□□ -0.23
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