Protein–RNA interactions for Protein: P38796

PPE1, Protein phosphatase methylesterase 1, yeastyeast

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPE1P38796 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.95■□□□□ 0.94
PPE1P38796 NSR1YGR159C 1245 nt20.83■□□□□ 0.93
PPE1P38796 NOP1YDL014W 984 nt20.29■□□□□ 0.84
PPE1P38796 YKL036CYKL036C 393 nt18.71■□□□□ 0.59
PPE1P38796 MDJ1YFL016C 1536 nt18.61■□□□□ 0.57
PPE1P38796 Q0297Q0297 156 nt17.77■□□□□ 0.44
PPE1P38796 SRX1YKL086W 384 nt17.76■□□□□ 0.43
PPE1P38796 YJL027CYJL027C 417 nt17.46■□□□□ 0.39
PPE1P38796 SCS3YGL126W 1143 nt17.02■□□□□ 0.32
PPE1P38796 YCR051WYCR051W 669 nt16.86■□□□□ 0.29
PPE1P38796 DBP2YNL112W 1641 nt16.45■□□□□ 0.22
PPE1P38796 YOL085CYOL085C 342 nt16.22■□□□□ 0.19
PPE1P38796 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.11■□□□□ 0.17
PPE1P38796 PKP1YIL042C 1185 nt16.02■□□□□ 0.16
PPE1P38796 CCC1YLR220W 969 nt15.97■□□□□ 0.15
PPE1P38796 RPP1BYDL130W 321 nt15.95■□□□□ 0.14
PPE1P38796 YBR190WYBR190W 312 nt15.83■□□□□ 0.12
PPE1P38796 SCJ1YMR214W 1134 nt15.52■□□□□ 0.08
PPE1P38796 RTC3YHR087W 336 nt15.49■□□□□ 0.07
PPE1P38796 RVS167YDR388W 1449 nt15.38■□□□□ 0.05
PPE1P38796 PET122YER153C 765 nt15.28■□□□□ 0.04
PPE1P38796 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.22■□□□□ 0.03
PPE1P38796 ATS1YAL020C 1002 nt15.2■□□□□ 0.02
PPE1P38796 SCR1SCR1 522 nt15.05■□□□□ -0
PPE1P38796 SHR5YOL110W 714 nt14.86□□□□□ -0.03
PPE1P38796 RRN5YLR141W 1092 nt14.82□□□□□ -0.04
PPE1P38796 YDJ1YNL064C 1230 nt14.69□□□□□ -0.06
PPE1P38796 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.53□□□□□ -0.08
PPE1P38796 DEP1YAL013W 1218 nt14.51□□□□□ -0.09
PPE1P38796 RSB1YOR049C 1065 nt14.5□□□□□ -0.09
PPE1P38796 URN1YPR152C 1398 nt14.49□□□□□ -0.09
PPE1P38796 PUT4YOR348C 1884 nt14.45□□□□□ -0.1
PPE1P38796 GAR1YHR089C 618 nt14.41□□□□□ -0.1
PPE1P38796 OPI9YLR338W 858 nt14.28□□□□□ -0.12
PPE1P38796 SAH1YER043C 1350 nt14.23□□□□□ -0.13
PPE1P38796 YNL208WYNL208W 600 nt14.22□□□□□ -0.13
PPE1P38796 RPN10YHR200W 807 nt14.21□□□□□ -0.13
PPE1P38796 ARE1YCR048W 1833 nt14.18□□□□□ -0.14
PPE1P38796 PST2YDR032C 597 nt14.09□□□□□ -0.15
PPE1P38796 POA1YBR022W 534 nt14.01□□□□□ -0.17
PPE1P38796 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.99□□□□□ -0.17
PPE1P38796 TIR1YER011W 765 nt13.92□□□□□ -0.18
PPE1P38796 SSA3YBL075C 1950 nt13.86□□□□□ -0.19
PPE1P38796 PUN1YLR414C 792 nt13.84□□□□□ -0.19
PPE1P38796 YJR018WYJR018W 363 nt13.81□□□□□ -0.2
PPE1P38796 SSA1YAL005C 1929 nt13.8□□□□□ -0.2
PPE1P38796 PTC2YER089C 1395 nt13.72□□□□□ -0.21
PPE1P38796 BSC6YOL137W 1494 nt13.7□□□□□ -0.22
PPE1P38796 BUD23YCR047C 828 nt13.67□□□□□ -0.22
PPE1P38796 YJR120WYJR120W 351 nt13.64□□□□□ -0.23
PPE1P38796 SRB2YHR041C 633 nt13.61□□□□□ -0.23
PPE1P38796 SHU1YHL006C 453 nt13.55□□□□□ -0.24
PPE1P38796 NAB2YGL122C 1578 nt13.53□□□□□ -0.24
PPE1P38796 YKL097CYKL097C 411 nt13.52□□□□□ -0.25
PPE1P38796 RPP2BYDR382W 333 nt13.49□□□□□ -0.25
PPE1P38796 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.39□□□□□ -0.27
PPE1P38796 Q0182Q0182 405 nt13.38□□□□□ -0.27
PPE1P38796 FIS1YIL065C 468 nt13.37□□□□□ -0.27
PPE1P38796 DAL1YIR027C 1383 nt13.34□□□□□ -0.27
PPE1P38796 FPR4YLR449W 1179 nt13.34□□□□□ -0.27
PPE1P38796 WWM1YFL010C 636 nt13.33□□□□□ -0.28
PPE1P38796 INM2YDR287W 879 nt13.3□□□□□ -0.28
PPE1P38796 PHO4YFR034C 939 nt13.24□□□□□ -0.29
PPE1P38796 BDH2YAL061W 1254 nt13.24□□□□□ -0.29
PPE1P38796 YBL100CYBL100C 315 nt13.2□□□□□ -0.3
PPE1P38796 YGR021WYGR021W 873 nt13.17□□□□□ -0.3
PPE1P38796 HOM6YJR139C 1080 nt13.17□□□□□ -0.3
PPE1P38796 MNP1YGL068W 585 nt13.13□□□□□ -0.31
PPE1P38796 SPT5YML010W 3192 nt13.1□□□□□ -0.31
PPE1P38796 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.06□□□□□ -0.32
PPE1P38796 FUN26YAL022C 1554 nt13.04□□□□□ -0.32
PPE1P38796 LSM3YLR438C-A 270 nt13.04□□□□□ -0.32
PPE1P38796 YOR139CYOR139C 393 nt13□□□□□ -0.33
PPE1P38796 YPS1YLR120C 1710 nt12.99□□□□□ -0.33
PPE1P38796 TRM9YML014W 840 nt12.99□□□□□ -0.33
PPE1P38796 RKM5YLR137W 1104 nt12.97□□□□□ -0.33
PPE1P38796 YDR095CYDR095C 411 nt12.89□□□□□ -0.35
PPE1P38796 CCT6YDR188W 1641 nt12.87□□□□□ -0.35
PPE1P38796 NPL3YDR432W 1245 nt12.86□□□□□ -0.35
PPE1P38796 MEP2YNL142W 1500 nt12.85□□□□□ -0.35
PPE1P38796 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.85□□□□□ -0.35
PPE1P38796 ALF1YNL148C 765 nt12.84□□□□□ -0.35
PPE1P38796 YOL037CYOL037C 354 nt12.82□□□□□ -0.36
PPE1P38796 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.73□□□□□ -0.37
PPE1P38796 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.73□□□□□ -0.37
PPE1P38796 DCW1YKL046C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
PPE1P38796 SIS1YNL007C 1059 nt12.67□□□□□ -0.38
PPE1P38796 MOT3YMR070W 1473 nt12.66□□□□□ -0.38
PPE1P38796 RPP2AYOL039W 321 nt12.65□□□□□ -0.38
PPE1P38796 PTP1YDL230W 1008 nt12.64□□□□□ -0.39
PPE1P38796 SSA4YER103W 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
PPE1P38796 YLR281CYLR281C 468 nt12.56□□□□□ -0.4
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