Protein–RNA interactions for Protein: P53093

YIP4, Protein YIP4, yeastyeast

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YIP4P53093 NSR1YGR159C 1245 nt17.76■□□□□ 0.43
YIP4P53093 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.63■□□□□ 0.41
YIP4P53093 NOP1YDL014W 984 nt16.98■□□□□ 0.31
YIP4P53093 MDJ1YFL016C 1536 nt16.09■□□□□ 0.17
YIP4P53093 YKL036CYKL036C 393 nt15.5■□□□□ 0.07
YIP4P53093 SRX1YKL086W 384 nt14.87□□□□□ -0.03
YIP4P53093 Q0297Q0297 156 nt14.81□□□□□ -0.04
YIP4P53093 YJL027CYJL027C 417 nt14.77□□□□□ -0.05
YIP4P53093 DBP2YNL112W 1641 nt14.15□□□□□ -0.14
YIP4P53093 SCS3YGL126W 1143 nt14.12□□□□□ -0.15
YIP4P53093 YCR051WYCR051W 669 nt14.08□□□□□ -0.16
YIP4P53093 YBR190WYBR190W 312 nt13.75□□□□□ -0.21
YIP4P53093 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.63□□□□□ -0.23
YIP4P53093 CCC1YLR220W 969 nt13.49□□□□□ -0.25
YIP4P53093 RTC3YHR087W 336 nt13.42□□□□□ -0.26
YIP4P53093 YOL085CYOL085C 342 nt13.41□□□□□ -0.26
YIP4P53093 RPP1BYDL130W 321 nt13.29□□□□□ -0.28
YIP4P53093 PKP1YIL042C 1185 nt13.25□□□□□ -0.29
YIP4P53093 RVS167YDR388W 1449 nt13.13□□□□□ -0.31
YIP4P53093 SCJ1YMR214W 1134 nt13.1□□□□□ -0.31
YIP4P53093 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.81□□□□□ -0.36
YIP4P53093 PUT4YOR348C 1884 nt12.76□□□□□ -0.37
YIP4P53093 PET122YER153C 765 nt12.76□□□□□ -0.37
YIP4P53093 ATS1YAL020C 1002 nt12.7□□□□□ -0.38
YIP4P53093 SHR5YOL110W 714 nt12.65□□□□□ -0.38
YIP4P53093 SSA3YBL075C 1950 nt12.6□□□□□ -0.39
YIP4P53093 SCR1SCR1 522 nt12.49□□□□□ -0.41
YIP4P53093 URN1YPR152C 1398 nt12.48□□□□□ -0.41
YIP4P53093 ARE1YCR048W 1833 nt12.44□□□□□ -0.42
YIP4P53093 DEP1YAL013W 1218 nt12.41□□□□□ -0.42
YIP4P53093 SAH1YER043C 1350 nt12.38□□□□□ -0.43
YIP4P53093 YDJ1YNL064C 1230 nt12.37□□□□□ -0.43
YIP4P53093 RRN5YLR141W 1092 nt12.35□□□□□ -0.43
YIP4P53093 OPI9YLR338W 858 nt12.35□□□□□ -0.43
YIP4P53093 POA1YBR022W 534 nt12.33□□□□□ -0.44
YIP4P53093 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.25□□□□□ -0.45
YIP4P53093 RPN10YHR200W 807 nt12.17□□□□□ -0.46
YIP4P53093 GAR1YHR089C 618 nt12.16□□□□□ -0.46
YIP4P53093 YNL208WYNL208W 600 nt12.15□□□□□ -0.46
YIP4P53093 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.12□□□□□ -0.47
YIP4P53093 BSC6YOL137W 1494 nt12.1□□□□□ -0.47
YIP4P53093 RSB1YOR049C 1065 nt11.99□□□□□ -0.49
YIP4P53093 PUN1YLR414C 792 nt11.96□□□□□ -0.49
YIP4P53093 BUD23YCR047C 828 nt11.92□□□□□ -0.5
YIP4P53093 PTC2YER089C 1395 nt11.9□□□□□ -0.5
YIP4P53093 YJR018WYJR018W 363 nt11.87□□□□□ -0.51
YIP4P53093 SPT5YML010W 3192 nt11.84□□□□□ -0.51
YIP4P53093 NAB2YGL122C 1578 nt11.77□□□□□ -0.53
YIP4P53093 TIR1YER011W 765 nt11.75□□□□□ -0.53
YIP4P53093 SSA1YAL005C 1929 nt11.72□□□□□ -0.53
YIP4P53093 PST2YDR032C 597 nt11.71□□□□□ -0.53
YIP4P53093 YJR120WYJR120W 351 nt11.71□□□□□ -0.53
YIP4P53093 Q0182Q0182 405 nt11.66□□□□□ -0.54
YIP4P53093 FIS1YIL065C 468 nt11.62□□□□□ -0.55
YIP4P53093 DAL1YIR027C 1383 nt11.56□□□□□ -0.56
YIP4P53093 SRB2YHR041C 633 nt11.53□□□□□ -0.56
YIP4P53093 FPR4YLR449W 1179 nt11.52□□□□□ -0.57
YIP4P53093 RPP2BYDR382W 333 nt11.51□□□□□ -0.57
YIP4P53093 SSA4YER103W 1929 nt11.48□□□□□ -0.57
YIP4P53093 INM2YDR287W 879 nt11.47□□□□□ -0.57
YIP4P53093 PHO4YFR034C 939 nt11.47□□□□□ -0.57
YIP4P53093 YKL097CYKL097C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
YIP4P53093 MEP2YNL142W 1500 nt11.39□□□□□ -0.59
YIP4P53093 YPS1YLR120C 1710 nt11.36□□□□□ -0.59
YIP4P53093 MOT3YMR070W 1473 nt11.34□□□□□ -0.59
YIP4P53093 YBL100CYBL100C 315 nt11.33□□□□□ -0.6
YIP4P53093 BDH2YAL061W 1254 nt11.28□□□□□ -0.6
YIP4P53093 DCW1YKL046C 1350 nt11.24□□□□□ -0.61
YIP4P53093 YDR095CYDR095C 411 nt11.23□□□□□ -0.61
YIP4P53093 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.22□□□□□ -0.61
YIP4P53093 WWM1YFL010C 636 nt11.21□□□□□ -0.61
YIP4P53093 FUN26YAL022C 1554 nt11.2□□□□□ -0.62
YIP4P53093 SHU1YHL006C 453 nt11.16□□□□□ -0.62
YIP4P53093 BDF1YLR399C 2061 nt11.1□□□□□ -0.63
YIP4P53093 TRM9YML014W 840 nt11.09□□□□□ -0.63
YIP4P53093 LSM3YLR438C-A 270 nt11.07□□□□□ -0.64
YIP4P53093 PTP1YDL230W 1008 nt11.06□□□□□ -0.64
YIP4P53093 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.06□□□□□ -0.64
YIP4P53093 EMI2YDR516C 1503 nt11.05□□□□□ -0.64
YIP4P53093 ALF1YNL148C 765 nt11.05□□□□□ -0.64
YIP4P53093 CCT6YDR188W 1641 nt11.03□□□□□ -0.64
YIP4P53093 CAC2YML102W 1407 nt11.02□□□□□ -0.64
YIP4P53093 RPP2AYOL039W 321 nt11.01□□□□□ -0.65
YIP4P53093 YGR021WYGR021W 873 nt11□□□□□ -0.65
YIP4P53093 HOM6YJR139C 1080 nt11□□□□□ -0.65
YIP4P53093 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.99□□□□□ -0.65
YIP4P53093 YBR220CYBR220C 1683 nt10.97□□□□□ -0.65
YIP4P53093 YDL221WYDL221W 552 nt10.96□□□□□ -0.65
YIP4P53093 SIS1YNL007C 1059 nt10.95□□□□□ -0.66
YIP4P53093 TAT1YBR069C 1860 nt10.93□□□□□ -0.66
YIP4P53093 YMR090WYMR090W 684 nt10.93□□□□□ -0.66
YIP4P53093 MNP1YGL068W 585 nt10.92□□□□□ -0.66
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