Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.61■■□□□ 1.37
VID28P40547 NSR1YGR159C 1245 nt23.55■■□□□ 1.36
VID28P40547 NOP1YDL014W 984 nt22.84■■□□□ 1.25
VID28P40547 MDJ1YFL016C 1536 nt21.08■□□□□ 0.96
VID28P40547 YKL036CYKL036C 393 nt21.02■□□□□ 0.96
VID28P40547 Q0297Q0297 156 nt20.04■□□□□ 0.8
VID28P40547 SRX1YKL086W 384 nt20.02■□□□□ 0.8
VID28P40547 YJL027CYJL027C 417 nt19.6■□□□□ 0.73
VID28P40547 SCS3YGL126W 1143 nt19.13■□□□□ 0.65
VID28P40547 YCR051WYCR051W 669 nt18.96■□□□□ 0.63
VID28P40547 DBP2YNL112W 1641 nt18.67■□□□□ 0.58
VID28P40547 YOL085CYOL085C 342 nt18.26■□□□□ 0.51
VID28P40547 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.2■□□□□ 0.5
VID28P40547 PKP1YIL042C 1185 nt18.01■□□□□ 0.47
VID28P40547 CCC1YLR220W 969 nt17.98■□□□□ 0.47
VID28P40547 RPP1BYDL130W 321 nt17.97■□□□□ 0.47
VID28P40547 YBR190WYBR190W 312 nt17.95■□□□□ 0.46
VID28P40547 RTC3YHR087W 336 nt17.5■□□□□ 0.39
VID28P40547 SCJ1YMR214W 1134 nt17.4■□□□□ 0.38
VID28P40547 RVS167YDR388W 1449 nt17.34■□□□□ 0.37
VID28P40547 PET122YER153C 765 nt17.22■□□□□ 0.35
VID28P40547 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.17■□□□□ 0.34
VID28P40547 ATS1YAL020C 1002 nt17.08■□□□□ 0.32
VID28P40547 SCR1SCR1 522 nt16.89■□□□□ 0.29
VID28P40547 SHR5YOL110W 714 nt16.78■□□□□ 0.28
VID28P40547 RRN5YLR141W 1092 nt16.7■□□□□ 0.26
VID28P40547 YDJ1YNL064C 1230 nt16.59■□□□□ 0.25
VID28P40547 PUT4YOR348C 1884 nt16.46■□□□□ 0.23
VID28P40547 URN1YPR152C 1398 nt16.39■□□□□ 0.21
VID28P40547 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.38■□□□□ 0.21
VID28P40547 DEP1YAL013W 1218 nt16.38■□□□□ 0.21
VID28P40547 RSB1YOR049C 1065 nt16.27■□□□□ 0.2
VID28P40547 GAR1YHR089C 618 nt16.24■□□□□ 0.19
VID28P40547 OPI9YLR338W 858 nt16.19■□□□□ 0.18
VID28P40547 ARE1YCR048W 1833 nt16.15■□□□□ 0.18
VID28P40547 SAH1YER043C 1350 nt16.13■□□□□ 0.17
VID28P40547 YNL208WYNL208W 600 nt16.06■□□□□ 0.16
VID28P40547 RPN10YHR200W 807 nt16.03■□□□□ 0.16
VID28P40547 POA1YBR022W 534 nt15.9■□□□□ 0.14
VID28P40547 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.87■□□□□ 0.13
VID28P40547 PST2YDR032C 597 nt15.86■□□□□ 0.13
VID28P40547 TIR1YER011W 765 nt15.71■□□□□ 0.11
VID28P40547 PUN1YLR414C 792 nt15.67■□□□□ 0.1
VID28P40547 YJR018WYJR018W 363 nt15.62■□□□□ 0.09
VID28P40547 SSA3YBL075C 1950 nt15.61■□□□□ 0.09
VID28P40547 SSA1YAL005C 1929 nt15.6■□□□□ 0.09
VID28P40547 BSC6YOL137W 1494 nt15.58■□□□□ 0.08
VID28P40547 PTC2YER089C 1395 nt15.54■□□□□ 0.08
VID28P40547 YJR120WYJR120W 351 nt15.49■□□□□ 0.07
VID28P40547 BUD23YCR047C 828 nt15.46■□□□□ 0.07
VID28P40547 SRB2YHR041C 633 nt15.41■□□□□ 0.06
VID28P40547 NAB2YGL122C 1578 nt15.33■□□□□ 0.05
VID28P40547 SHU1YHL006C 453 nt15.25■□□□□ 0.03
VID28P40547 RPP2BYDR382W 333 nt15.2■□□□□ 0.02
VID28P40547 FIS1YIL065C 468 nt15.17■□□□□ 0.02
VID28P40547 DAL1YIR027C 1383 nt15.11■□□□□ 0.01
VID28P40547 YKL097CYKL097C 411 nt15.1■□□□□ 0.01
VID28P40547 SPT5YML010W 3192 nt15.08■□□□□ 0
VID28P40547 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.05■□□□□ -0
VID28P40547 INM2YDR287W 879 nt15.04■□□□□ -0
VID28P40547 FPR4YLR449W 1179 nt15.04■□□□□ -0
VID28P40547 WWM1YFL010C 636 nt15.03■□□□□ -0
VID28P40547 PHO4YFR034C 939 nt15□□□□□ -0.01
VID28P40547 BDH2YAL061W 1254 nt14.96□□□□□ -0.01
VID28P40547 YBL100CYBL100C 315 nt14.91□□□□□ -0.02
VID28P40547 HOM6YJR139C 1080 nt14.85□□□□□ -0.03
VID28P40547 YGR021WYGR021W 873 nt14.83□□□□□ -0.04
VID28P40547 MNP1YGL068W 585 nt14.78□□□□□ -0.04
VID28P40547 YPS1YLR120C 1710 nt14.76□□□□□ -0.05
VID28P40547 FUN26YAL022C 1554 nt14.75□□□□□ -0.05
VID28P40547 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.74□□□□□ -0.05
VID28P40547 LSM3YLR438C-A 270 nt14.72□□□□□ -0.05
VID28P40547 TRM9YML014W 840 nt14.65□□□□□ -0.06
VID28P40547 YDR095CYDR095C 411 nt14.64□□□□□ -0.07
VID28P40547 MEP2YNL142W 1500 nt14.63□□□□□ -0.07
VID28P40547 RKM5YLR137W 1104 nt14.62□□□□□ -0.07
VID28P40547 YOR139CYOR139C 393 nt14.62□□□□□ -0.07
VID28P40547 CCT6YDR188W 1641 nt14.56□□□□□ -0.08
VID28P40547 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.54□□□□□ -0.08
VID28P40547 ALF1YNL148C 765 nt14.48□□□□□ -0.09
VID28P40547 DCW1YKL046C 1350 nt14.46□□□□□ -0.1
VID28P40547 SSA4YER103W 1929 nt14.45□□□□□ -0.1
VID28P40547 YOL037CYOL037C 354 nt14.41□□□□□ -0.1
VID28P40547 NPL3YDR432W 1245 nt14.4□□□□□ -0.1
VID28P40547 PTP1YDL230W 1008 nt14.39□□□□□ -0.11
VID28P40547 SIS1YNL007C 1059 nt14.37□□□□□ -0.11
VID28P40547 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.36□□□□□ -0.11
VID28P40547 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.36□□□□□ -0.11
VID28P40547 RPP2AYOL039W 321 nt14.35□□□□□ -0.11
VID28P40547 CAC2YML102W 1407 nt14.29□□□□□ -0.12
VID28P40547 EMI2YDR516C 1503 nt14.22□□□□□ -0.13
VID28P40547 ART5YGR068C 1761 nt14.17□□□□□ -0.14
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