Protein–RNA interactions for Protein: Q01329

PTA1, Pre-tRNA-processing protein PTA1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTA1Q01329 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.09■■□□□ 1.29
PTA1Q01329 NSR1YGR159C 1245 nt22.65■■□□□ 1.22
PTA1Q01329 NOP1YDL014W 984 nt22.51■■□□□ 1.19
PTA1Q01329 YKL036CYKL036C 393 nt21.03■□□□□ 0.96
PTA1Q01329 MDJ1YFL016C 1536 nt19.93■□□□□ 0.78
PTA1Q01329 Q0297Q0297 156 nt19.77■□□□□ 0.76
PTA1Q01329 YJL027CYJL027C 417 nt19.71■□□□□ 0.75
PTA1Q01329 SRX1YKL086W 384 nt19.66■□□□□ 0.74
PTA1Q01329 SCS3YGL126W 1143 nt19.29■□□□□ 0.68
PTA1Q01329 YCR051WYCR051W 669 nt18.74■□□□□ 0.59
PTA1Q01329 YOL085CYOL085C 342 nt18.21■□□□□ 0.51
PTA1Q01329 PKP1YIL042C 1185 nt17.97■□□□□ 0.47
PTA1Q01329 RPP1BYDL130W 321 nt17.76■□□□□ 0.43
PTA1Q01329 DBP2YNL112W 1641 nt17.7■□□□□ 0.42
PTA1Q01329 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.62■□□□□ 0.41
PTA1Q01329 CCC1YLR220W 969 nt17.53■□□□□ 0.4
PTA1Q01329 SCJ1YMR214W 1134 nt17.34■□□□□ 0.37
PTA1Q01329 ATS1YAL020C 1002 nt17.32■□□□□ 0.36
PTA1Q01329 PET122YER153C 765 nt16.97■□□□□ 0.31
PTA1Q01329 YBR190WYBR190W 312 nt16.86■□□□□ 0.29
PTA1Q01329 SCR1SCR1 522 nt16.84■□□□□ 0.29
PTA1Q01329 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.78■□□□□ 0.28
PTA1Q01329 RVS167YDR388W 1449 nt16.7■□□□□ 0.26
PTA1Q01329 RTC3YHR087W 336 nt16.58■□□□□ 0.24
PTA1Q01329 RRN5YLR141W 1092 nt16.51■□□□□ 0.23
PTA1Q01329 RSB1YOR049C 1065 nt16.26■□□□□ 0.19
PTA1Q01329 YDJ1YNL064C 1230 nt16.19■□□□□ 0.18
PTA1Q01329 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.18■□□□□ 0.18
PTA1Q01329 SHR5YOL110W 714 nt16.18■□□□□ 0.18
PTA1Q01329 PST2YDR032C 597 nt15.98■□□□□ 0.15
PTA1Q01329 GAR1YHR089C 618 nt15.86■□□□□ 0.13
PTA1Q01329 DEP1YAL013W 1218 nt15.71■□□□□ 0.11
PTA1Q01329 URN1YPR152C 1398 nt15.59■□□□□ 0.09
PTA1Q01329 YKL097CYKL097C 411 nt15.51■□□□□ 0.07
PTA1Q01329 YNL208WYNL208W 600 nt15.42■□□□□ 0.06
PTA1Q01329 RPN10YHR200W 807 nt15.39■□□□□ 0.05
PTA1Q01329 SHU1YHL006C 453 nt15.3■□□□□ 0.04
PTA1Q01329 TIR1YER011W 765 nt15.29■□□□□ 0.04
PTA1Q01329 OPI9YLR338W 858 nt15.28■□□□□ 0.04
PTA1Q01329 SAH1YER043C 1350 nt15.15■□□□□ 0.02
PTA1Q01329 PUT4YOR348C 1884 nt15.11■□□□□ 0.01
PTA1Q01329 SSA1YAL005C 1929 nt15.05■□□□□ 0
PTA1Q01329 SSA3YBL075C 1950 nt15.04■□□□□ -0
PTA1Q01329 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.03■□□□□ -0
PTA1Q01329 ARE1YCR048W 1833 nt14.94□□□□□ -0.02
PTA1Q01329 YJR018WYJR018W 363 nt14.88□□□□□ -0.03
PTA1Q01329 SRB2YHR041C 633 nt14.87□□□□□ -0.03
PTA1Q01329 YOR139CYOR139C 393 nt14.84□□□□□ -0.03
PTA1Q01329 PUN1YLR414C 792 nt14.83□□□□□ -0.04
PTA1Q01329 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.77□□□□□ -0.05
PTA1Q01329 POA1YBR022W 534 nt14.71□□□□□ -0.05
PTA1Q01329 YJR120WYJR120W 351 nt14.7□□□□□ -0.06
PTA1Q01329 WWM1YFL010C 636 nt14.69□□□□□ -0.06
PTA1Q01329 NPL3YDR432W 1245 nt14.67□□□□□ -0.06
PTA1Q01329 RPP2BYDR382W 333 nt14.65□□□□□ -0.06
PTA1Q01329 PTC2YER089C 1395 nt14.64□□□□□ -0.07
PTA1Q01329 MNP1YGL068W 585 nt14.63□□□□□ -0.07
PTA1Q01329 YGR021WYGR021W 873 nt14.63□□□□□ -0.07
PTA1Q01329 HOM6YJR139C 1080 nt14.61□□□□□ -0.07
PTA1Q01329 BUD23YCR047C 828 nt14.48□□□□□ -0.09
PTA1Q01329 YOL037CYOL037C 354 nt14.42□□□□□ -0.1
PTA1Q01329 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.4□□□□□ -0.1
PTA1Q01329 RKM5YLR137W 1104 nt14.4□□□□□ -0.1
PTA1Q01329 BDH2YAL061W 1254 nt14.39□□□□□ -0.11
PTA1Q01329 NAB2YGL122C 1578 nt14.38□□□□□ -0.11
PTA1Q01329 BSC6YOL137W 1494 nt14.31□□□□□ -0.12
PTA1Q01329 FPR4YLR449W 1179 nt14.3□□□□□ -0.12
PTA1Q01329 INM2YDR287W 879 nt14.29□□□□□ -0.12
PTA1Q01329 DAL1YIR027C 1383 nt14.25□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.25□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.25□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.25□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.25□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.25□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 LSM3YLR438C-A 270 nt14.23□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 YBL100CYBL100C 315 nt14.23□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 FIS1YIL065C 468 nt14.21□□□□□ -0.13
PTA1Q01329 PHO4YFR034C 939 nt14.13□□□□□ -0.15
PTA1Q01329 TRM9YML014W 840 nt14.09□□□□□ -0.15
PTA1Q01329 PUS2YGL063W 1113 nt14.08□□□□□ -0.16
PTA1Q01329 YLR281CYLR281C 468 nt14.08□□□□□ -0.16
PTA1Q01329 FUN26YAL022C 1554 nt14.07□□□□□ -0.16
PTA1Q01329 WHI5YOR083W 888 nt14.02□□□□□ -0.17
PTA1Q01329 CCT6YDR188W 1641 nt13.9□□□□□ -0.18
PTA1Q01329 ALF1YNL148C 765 nt13.82□□□□□ -0.2
PTA1Q01329 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.81□□□□□ -0.2
PTA1Q01329 MOT3YMR070W 1473 nt13.79□□□□□ -0.2
PTA1Q01329 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.77□□□□□ -0.21
PTA1Q01329 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.77□□□□□ -0.21
PTA1Q01329 DSK2YMR276W 1122 nt13.75□□□□□ -0.21
PTA1Q01329 YPR011CYPR011C 981 nt13.75□□□□□ -0.21
PTA1Q01329 FMP45YDL222C 930 nt13.74□□□□□ -0.21
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