RNA–Protein interactions for RNA: YOR349W

CIN1, Transcript of Tubulin folding factor D involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN1, Length 3,045 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN1	YOR349W	YMR074C	Q04773	145 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YPL277C	Q08989	487 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SMC6	Q12749	1114 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	HIR3	P47171	1648 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MRP10	O75012	95 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RAS1	P01119	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SPC72	P39723	622 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	HXT16	P47185	567 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SAP4	P53036	818 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	BTN2	P53286	410 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	CRR1	Q05790	422 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YPR196W	Q06595	470 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	PSF3	Q12146	194 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	BRF1	P29056	596 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	UGA2	P38067	497 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MAD3	P47074	515 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	CBK1	P53894	756 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	PSR1	Q07800	427 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MCH5	Q08777	521 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YLL058W	Q12198	575 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	TRK1	P12685	1235 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YCL049C	P25577	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	ASH1	P34233	588 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YKR051W	P36142	418 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	LAM1	P38851	1228 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	UME6	P39001	836 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	STL1	P39932	569 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RIC1	P40395	1056 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	IRC6	P43615	237 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YGR045C	P53229	120 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YAP1802	P53309	568 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	TAF11	Q04226	346 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MDM38	Q08179	573 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	DCS2	Q12123	353 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SEM1	O94742	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MTF2	P10849	440 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MET8	P15807	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	AFT1	P22149	690 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YCL002C	P25565	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	TGL1	P34163	548 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YKL100C	P34248	587 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YKR075C	P36155	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YHR202W	P38887	602 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	AXL2	P38928	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	EAF5	P39995	279 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	PSF2	P40359	213 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YML6	P51998	286 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	TIM10	P87108	93 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	VID22	Q05934	901 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	DBF4	P32325	704 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MDL2	P33311	773 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	PES4	P39684	611 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	PRK1	P40494	810 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	GPI8	P49018	411 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	TCB1	Q12466	1186 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	NHA1	Q99271	985 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	CDC16	P09798	840 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YKE2	P52553	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	NSI1	Q12457	570 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	TAF5	P38129	798 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	MSC7	P38694	644 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	VID28	P40547	921 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	FCP1	Q03254	732 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RGA2	Q06407	1009 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	PHO5	P00635	467 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	SWI6	P09959	803 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	RED1	P14291	827 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CIN1	YOR349W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84

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