Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 NSR1YGR159C 1245 nt19.24■□□□□ 0.67
NSI1Q12457 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.23■□□□□ 0.67
NSI1Q12457 NOP1YDL014W 984 nt18.57■□□□□ 0.56
NSI1Q12457 MDJ1YFL016C 1536 nt17.38■□□□□ 0.37
NSI1Q12457 YKL036CYKL036C 393 nt17.17■□□□□ 0.34
NSI1Q12457 Q0297Q0297 156 nt16.3■□□□□ 0.2
NSI1Q12457 SRX1YKL086W 384 nt16.26■□□□□ 0.19
NSI1Q12457 YJL027CYJL027C 417 nt16.02■□□□□ 0.16
NSI1Q12457 SCS3YGL126W 1143 nt15.65■□□□□ 0.1
NSI1Q12457 YCR051WYCR051W 669 nt15.43■□□□□ 0.06
NSI1Q12457 DBP2YNL112W 1641 nt15.23■□□□□ 0.03
NSI1Q12457 YOL085CYOL085C 342 nt14.89□□□□□ -0.03
NSI1Q12457 YBR190WYBR190W 312 nt14.81□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NSI1Q12457 CCC1YLR220W 969 nt14.74□□□□□ -0.05
NSI1Q12457 PKP1YIL042C 1185 nt14.66□□□□□ -0.06
NSI1Q12457 RPP1BYDL130W 321 nt14.62□□□□□ -0.07
NSI1Q12457 RTC3YHR087W 336 nt14.56□□□□□ -0.08
NSI1Q12457 SSA3YBL075C 1950 nt14.5□□□□□ -0.09
NSI1Q12457 SCJ1YMR214W 1134 nt14.29□□□□□ -0.12
NSI1Q12457 RVS167YDR388W 1449 nt14.26□□□□□ -0.13
NSI1Q12457 ATS1YAL020C 1002 nt14.07□□□□□ -0.16
NSI1Q12457 PET122YER153C 765 nt13.99□□□□□ -0.17
NSI1Q12457 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.94□□□□□ -0.18
NSI1Q12457 SCR1SCR1 522 nt13.78□□□□□ -0.2
NSI1Q12457 SHR5YOL110W 714 nt13.7□□□□□ -0.22
NSI1Q12457 PUT4YOR348C 1884 nt13.63□□□□□ -0.23
NSI1Q12457 RRN5YLR141W 1092 nt13.57□□□□□ -0.24
NSI1Q12457 URN1YPR152C 1398 nt13.51□□□□□ -0.25
NSI1Q12457 DEP1YAL013W 1218 nt13.5□□□□□ -0.25
NSI1Q12457 YDJ1YNL064C 1230 nt13.46□□□□□ -0.25
NSI1Q12457 SAH1YER043C 1350 nt13.34□□□□□ -0.27
NSI1Q12457 ARE1YCR048W 1833 nt13.32□□□□□ -0.28
NSI1Q12457 OPI9YLR338W 858 nt13.32□□□□□ -0.28
NSI1Q12457 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.31□□□□□ -0.28
NSI1Q12457 GAR1YHR089C 618 nt13.27□□□□□ -0.29
NSI1Q12457 RSB1YOR049C 1065 nt13.27□□□□□ -0.29
NSI1Q12457 POA1YBR022W 534 nt13.25□□□□□ -0.29
NSI1Q12457 RPN10YHR200W 807 nt13.2□□□□□ -0.3
NSI1Q12457 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.18□□□□□ -0.3
NSI1Q12457 YNL208WYNL208W 600 nt13.17□□□□□ -0.3
NSI1Q12457 Q0182Q0182 405 nt13.04□□□□□ -0.32
NSI1Q12457 PST2YDR032C 597 nt12.98□□□□□ -0.33
NSI1Q12457 BSC6YOL137W 1494 nt12.97□□□□□ -0.33
NSI1Q12457 PUN1YLR414C 792 nt12.93□□□□□ -0.34
NSI1Q12457 BUD23YCR047C 828 nt12.91□□□□□ -0.34
NSI1Q12457 YJR018WYJR018W 363 nt12.87□□□□□ -0.35
NSI1Q12457 PTC2YER089C 1395 nt12.86□□□□□ -0.35
NSI1Q12457 TIR1YER011W 765 nt12.8□□□□□ -0.36
NSI1Q12457 SSA1YAL005C 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
NSI1Q12457 NAB2YGL122C 1578 nt12.68□□□□□ -0.38
NSI1Q12457 YKL097CYKL097C 411 nt12.65□□□□□ -0.38
NSI1Q12457 MOT3YMR070W 1473 nt12.62□□□□□ -0.39
NSI1Q12457 YJR120WYJR120W 351 nt12.6□□□□□ -0.39
NSI1Q12457 SSA4YER103W 1929 nt12.6□□□□□ -0.39
NSI1Q12457 FPR4YLR449W 1179 nt12.54□□□□□ -0.4
NSI1Q12457 RPP2BYDR382W 333 nt12.53□□□□□ -0.4
NSI1Q12457 SPT5YML010W 3192 nt12.49□□□□□ -0.41
NSI1Q12457 DAL1YIR027C 1383 nt12.47□□□□□ -0.41
NSI1Q12457 SRB2YHR041C 633 nt12.47□□□□□ -0.41
NSI1Q12457 FIS1YIL065C 468 nt12.47□□□□□ -0.41
NSI1Q12457 SHU1YHL006C 453 nt12.45□□□□□ -0.42
NSI1Q12457 INM2YDR287W 879 nt12.41□□□□□ -0.42
NSI1Q12457 PHO4YFR034C 939 nt12.36□□□□□ -0.43
NSI1Q12457 YBL100CYBL100C 315 nt12.27□□□□□ -0.45
NSI1Q12457 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.25□□□□□ -0.45
NSI1Q12457 WWM1YFL010C 636 nt12.23□□□□□ -0.45
NSI1Q12457 BDH2YAL061W 1254 nt12.22□□□□□ -0.45
NSI1Q12457 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
NSI1Q12457 BDF1YLR399C 2061 nt12.18□□□□□ -0.46
NSI1Q12457 YPS1YLR120C 1710 nt12.18□□□□□ -0.46
NSI1Q12457 MEP2YNL142W 1500 nt12.17□□□□□ -0.46
NSI1Q12457 FUN26YAL022C 1554 nt12.13□□□□□ -0.47
NSI1Q12457 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.12□□□□□ -0.47
NSI1Q12457 TRM9YML014W 840 nt12.07□□□□□ -0.48
NSI1Q12457 YDR095CYDR095C 411 nt12.06□□□□□ -0.48
NSI1Q12457 YGR021WYGR021W 873 nt12.06□□□□□ -0.48
NSI1Q12457 HOM6YJR139C 1080 nt12.06□□□□□ -0.48
NSI1Q12457 YOR139CYOR139C 393 nt12.03□□□□□ -0.48
NSI1Q12457 DCW1YKL046C 1350 nt12.03□□□□□ -0.48
NSI1Q12457 ALF1YNL148C 765 nt12.02□□□□□ -0.49
NSI1Q12457 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.49
NSI1Q12457 MNP1YGL068W 585 nt12.01□□□□□ -0.49
NSI1Q12457 LSM3YLR438C-A 270 nt12□□□□□ -0.49
NSI1Q12457 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.96□□□□□ -0.49
NSI1Q12457 NPL3YDR432W 1245 nt11.92□□□□□ -0.5
NSI1Q12457 CCT6YDR188W 1641 nt11.9□□□□□ -0.5
NSI1Q12457 RKM5YLR137W 1104 nt11.88□□□□□ -0.51
NSI1Q12457 RPP2AYOL039W 321 nt11.86□□□□□ -0.51
NSI1Q12457 NVJ2YPR091C 2313 nt11.86□□□□□ -0.51
NSI1Q12457 EMI2YDR516C 1503 nt11.85□□□□□ -0.51
NSI1Q12457 PTP1YDL230W 1008 nt11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms