Protein–RNA interactions for Protein: Q9P021

CRIPT, Cysteine-rich PDZ-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPTQ9P021 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRIPTQ9P021 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRIPTQ9P021 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRIPTQ9P021 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CRIPTQ9P021 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRIPTQ9P021 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRIPTQ9P021 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRIPTQ9P021 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRIPTQ9P021 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CRIPTQ9P021 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CRIPTQ9P021 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRIPTQ9P021 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CRIPTQ9P021 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CRIPTQ9P021 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRIPTQ9P021 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRIPTQ9P021 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRIPTQ9P021 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CRIPTQ9P021 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRIPTQ9P021 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms