Protein–RNA interactions for Protein: O15226

NKRF, NF-kappa-B-repressing factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRFO15226 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.151e-37■■■■■ 140.6
NKRFO15226 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.67□□□□□ -0.381e-37■■■■■ 140.6
NKRFO15226 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.46□□□□□ -0.411e-37■■■■■ 140.6
NKRFO15226 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 80
NKRFO15226 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-18■■■■■ 66.4
NKRFO15226 TRMT44-208ENST00000532477 1851 ntTSL 218.08■□□□□ 0.492e-18■■■■■ 66.4
NKRFO15226 TRMT44-207ENST00000531038 541 ntTSL 314.17□□□□□ -0.142e-18■■■■■ 66.4
NKRFO15226 TRMT44-203ENST00000511149 508 ntTSL 411.51□□□□□ -0.572e-18■■■■■ 66.4
NKRFO15226 TRMT44-204ENST00000511366 4157 ntTSL 211.33□□□□□ -0.62e-18■■■■■ 66.4
NKRFO15226 EXOC7-210ENST00000460476 555 ntTSL 420.58■□□□□ 0.892e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-212ENST00000467586 2393 ntTSL 220.2■□□□□ 0.822e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-215ENST00000494787 542 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-214ENST00000486053 500 ntTSL 316.7■□□□□ 0.262e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-203ENST00000357231 1924 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.232e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-219ENST00000592559 645 ntTSL 513.11□□□□□ -0.312e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 EXOC7-220ENST00000607838 3353 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.892e-13■■■■■ 58.2
NKRFO15226 L3HYPDH-203ENST00000466522 462 ntTSL 37.53□□□□□ -1.28e-19■■■■■ 52.2
NKRFO15226 CHN2-203ENST00000409350 539 ntTSL 415.43■□□□□ 0.065e-9■■■■■ 52
NKRFO15226 CHN2-205ENST00000409964 547 ntTSL 412.16□□□□□ -0.465e-9■■■■■ 52
NKRFO15226 CHN2-204ENST00000409922 740 ntTSL 211.14□□□□□ -0.635e-9■■■■■ 52
NKRFO15226 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 52
NKRFO15226 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 313.59□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 49.1
NKRFO15226 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 48
NKRFO15226 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 47.3
NKRFO15226 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 325.29■■□□□ 1.645e-12■■■■■ 46
NKRFO15226 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 219.02■□□□□ 0.645e-12■■■■■ 46
NKRFO15226 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-12■■■■■ 46
NKRFO15226 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.215e-12■■■■■ 46
NKRFO15226 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.035e-15■■■■■ 45.7
NKRFO15226 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.086e-16■■■■■ 44.4
NKRFO15226 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.596e-16■■■■■ 44.4
NKRFO15226 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.386e-16■■■■■ 44.4
NKRFO15226 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.131e-13■■■■■ 43.9
NKRFO15226 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-13■■■■■ 43.9
NKRFO15226 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.191e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 522.27■■□□□ 1.161e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.991e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 516.92■□□□□ 0.31e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 415.93■□□□□ 0.141e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-224ENST00000568502 546 ntTSL 414.71□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-216ENST00000566561 564 ntTSL 414.36□□□□□ -0.111e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-211ENST00000563845 528 ntTSL 414.01□□□□□ -0.171e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-206ENST00000561825 562 ntTSL 513.12□□□□□ -0.311e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 512.02□□□□□ -0.491e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 KLHDC4-220ENST00000568338 584 ntTSL 49.53□□□□□ -0.881e-11■■■■■ 43.4
NKRFO15226 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 43.2
NKRFO15226 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 514.39□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 43.2
NKRFO15226 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 511.14□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 43.2
NKRFO15226 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 39.57□□□□□ -0.889e-9■■■■■ 43.1
NKRFO15226 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 43.94□□□□□ -1.789e-9■■■■■ 43.1
NKRFO15226 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.514e-9■■■■■ 42.6
NKRFO15226 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 42.6
NKRFO15226 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.27□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 42.3
NKRFO15226 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.442e-12■■■■■ 42.3
NKRFO15226 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 42.3
NKRFO15226 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.01□□□□□ -1.772e-12■■■■■ 42.3
NKRFO15226 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 40.1
NKRFO15226 PALM-206ENST00000589012 579 ntTSL 321.08■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 40.1
NKRFO15226 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 40.1
NKRFO15226 PALM-209ENST00000592870 1346 ntTSL 218.22■□□□□ 0.512e-9■■■■■ 40.1
NKRFO15226 SFI1-206ENST00000417682 1817 ntTSL 518.84■□□□□ 0.616e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-228ENST00000524296 2108 ntTSL 517.41■□□□□ 0.386e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.246e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-212ENST00000452250 2625 ntTSL 215.39■□□□□ 0.056e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.056e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-202ENST00000382162 5250 ntTSL 213.88□□□□□ -0.196e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.386e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.436e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.596e-12■■■■■ 39.6
NKRFO15226 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.062e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-205ENST00000553980 576 ntTSL 422.44■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-206ENST00000554478 545 ntTSL 418.24■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-211ENST00000556174 546 ntTSL 418.09■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-212ENST00000556944 609 ntTSL 417.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 ZNF219-209ENST00000555697 654 ntTSL 214.49□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 38.9
NKRFO15226 FN3K-205ENST00000574496 594 ntTSL 323.11■■□□□ 1.295e-8■■■■■ 37.8
NKRFO15226 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.295e-8■■■■■ 37.8
NKRFO15226 FN3K-204ENST00000573841 513 ntTSL 222.59■■□□□ 1.215e-8■■■■■ 37.8
NKRFO15226 SHANK2-213ENST00000460048 736 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 36.9
NKRFO15226 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 318.36■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 35.4
NKRFO15226 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 35.4
NKRFO15226 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 35.4
NKRFO15226 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 35.4
NKRFO15226 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 35.4
NKRFO15226 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 35.4
NKRFO15226 IGDCC3-203ENST00000559058 564 ntTSL 528.1■■■□□ 2.094e-9■■■■■ 35.1
NKRFO15226 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.934e-9■■■■■ 35.1
Retrieved 100 of 9,198 protein–RNA pairs in 36.4 ms