Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEFLP07196 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEFLP07196 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms